1

Grupo Dr. Enrique Galindo (Lunes 12, de 10:00 a 10:30

hrs.).

“EXPERIENCIA EN LA GESTACIÓN DE EMPRESAS DE BASE TECNOLÓGICA PARA

COMERCIALIZAR BIOFUNGICIDAS Y BIOPOLÍMEROS DESARROLLADOS EN EL IBT”

Personal Académico (2010-2011):

Enrique Galindo, Inv. Tit. “C”, SNI III.

Leobardo Serrano, Inv. Tit. “B”, SNI II.

Carlos Peña, Inv. Tit. “B”, SNI II.

Celia Flores, Técnico Titular “B”

Ma. Soledad Córdova (hasta junio de 2011), Técnico Titular “A”, SNI I.

Estudiantes:

(* graduados)

Ana Laura Muñoz Celaya (Doctorado)

Tania Castillo Marenco (Doctorado)

Celia Flores Ocampo (Doctorado)

Diego Cuervo Amaya (Maestría)

Itzel Gaytán Colín (Maestría)

Claudia Vianney Yáñez Ñeco (Maestría)

Sergio Andrés Cristiano Fajardo (Maestría)

Wendy Ivette Aragón Gómez (Maestría)

Andrés García Romero * (Licenciatura * y Maestría)

Yuridia Solís Arcos* (Licenciatura)

Florencio Ramos Gómez* (Licenciatura)

Abisaí Acevedo Quiroz* (Licenciatura)

Fabiola Amezcua Castillo* (Licenciatura)

Armando Estrada Ponciano (Licenciatura)

Erika Briones Serrano (Licenciatura)

Elizabeth Rubio Rodríguez (Licenciatura)

Silvia Herrera López (Licenciatura)

Ana Isabel Trejo Hernández (Licenciatura)

Martin Dorn (Licenciatura)

Personal por honorarios:

Modesto Millán Pónce

María Eugenia Ramírez Guapo

Personal de apoyo

Leticia Díaz

Juana Ferrer

Antonio Martínez

Resumen de la plática:

2

En estos dos últimos años destaca la actividad de los académicos de nuestro grupo en la incubación de dos

empresas “spin-off”, una de ellas graduada en el 2010. Se trata de las empresas Agro&Biotecnia y

Biopolymex. En esta presentación se describirá brevemente la experiencia de su gestión, incubación e inicio

de operaciones.

Agro&Biotecnia es una empresa de base tecnológica cuya misión es ser líder en el desarrollo comercial de

agentes de control biológico para la agricultura. La empresa se encuentra en las fases finales de la puesta en

el mercado de un biofungicida contra la antracnosis del mango, desarrollado con tecnología propiedad IBt-

UNAM y del CIAD-Culiacán. México es uno de los principales productores de mango a nivel mundial, pero

sólo destina el 14 % de su producción nacional para la exportación, debido a limitaciones en la calidad de los

frutos. El desarrollo tecnológico se ha enfocado en los aspectos más críticos que presentan los sistemas de

control biológico con potencial de entrar al mercado: la producción reproducible y en gran escala de los

antagonistas, el desarrollo de formulaciones con vida de anaquel prolongada y su evaluación extensiva a

nivel comercial. Estas tecnologías han sido patentadas, escaladas y los productos han sido probados

exhaustivamente a nivel comercial en huertos de mango. El biofungicida ha permitido que los productores

logren frutas de alta calidad, sin residuos químicos, susceptibles de exportación (incrementando el valor

agregado de su producción). La tecnología, ha sido transferida a la empresa Agro&Biotecnia, la cual ha

logrado obtener los registros ante las autoridades sanitarias y de agricultura. La empresa se incubó en el

Centro Morelense de Innovación y Transferencia Tecnológica (CeMITT) graduándose en diciembre de 2010.

Actualmente realiza negociaciones finales con una empresa distribuidora que permitirá colocar el producto

(Fungifree-ab) en el mercado, a principios de 2012.

Biopolymex es una compañía surgida en la UNAM campus Morelos que ha sido creada con el objetivo de

madurar tecnologías de producción de bioplásticos. La producción de plásticos biodegradables, obtenidos a

partir de materias primas renovables es fundamental en los tiempos actuales para minimizar los impactos

ambientales negativos ocasionados por los plásticos obtenidos del petróleo. Se estima que el valor del

mercado de plásticos biodegradables en México es de 200,000 toneladas anuales, con un valor potencial de

400 millones de dólares anuales. La experiencia de la empresa ha sido en el desarrollo de biocatalizadores

microbianos y en los procesos de transformación de fuentes renovables en bioplásticos. Además, se han

desarrollado nuevos biomateriales para su utilización en aplicaciones de alta especialidad como el caso de

los dispositivos biomédicos. La empresa cuenta con tecnologías patentadas para la producción de poliácido

láctico (PLA) y sus intermediarios (D y L ácido láctico) y láctida. Actualmente la empresa se encuentra en

incubación en el sistema de incubadoras de empresas (Innova UNAM). Se ha avanzado en la definición del

modelo de negocios en base a las necesidades del mercado. Asimismo, se tienen avances en el análisis

tecnológico, estudio del mercado y el plan de negocio de la empresa.

Titulo de los Carteles:

“Ingeniería de Biopolímeros Microbianos” (Carlos Peña).

“Estudio de la Inducción y de la producción de lacasas por Pleurotus ostreatus“ (Leobardo Serrano).

Publicaciones (2010-2011):

3

“Oxygen transfer rate during the production of alginate by Azotobacter vinelandii under oxygen-limited and

non oxygen-limited conditions”, Lozano, E., Galindo, E., Peña, C. (2011) Microbial Cell Factories

10:13 (doi:10.1186/1475-2859-10-13).

“Increasing Pleurotus ostreatus laccase production by culture medium optimization and copper/lignin

synergistic induction”. Tinoco, R., Acevedo, A., Galindo, E., Serrano-Carreón, L. (2011). Journal of

Industrial Microbiology and Biotechnology 38:531-540.

“The viscosifying power degree of acetylation and molecular mass of the alginate produced by Azotobacter

vinelandii in shake flasks are determined by the oxygen transfer rate”, Peña, C., Galindo, E., Büchs, J.

(2010) Process Biochemistry 46: 290-297.

“Production of laccases by Pleurotus ostreatus in submerged fermentation in co-culture with Trichoderma

viride”, Flores, C., Casasanero, R., Trejo-Hernández, M.R., Galindo, E., Serrano-Carreón, L. (2010)

Journal of Applied Microbiology, 108: 810-817.

“Design and characterization of a one-compartment scale-down system for simulating dissolved oxygen

tension gradientes”, de León-Rodríguez, A., Galindo, E., Ramírez, O. T. (2010) Journal of Chemical

Technology and Biotechnology, 85: 950-956.

“Two-stage fermentation process for alginate production by Azotobacter vinelandii mutant altered in poly--

hydroxybutyrate (PHB) synthesis” (2010), Mejía, M.A., Segura, D., Espín, G., Galindo, E., Peña, C.

(2009) Journal of Applied Microbiology, 108: 55-61.

“Biofungicidas para el control de la antracnosis del mango: logrando frutos de alta calidad internacional para

mercados exigentes”, Serrano, L., Balderas, K., Wong, M.A., Rosas, D.R., Galindo, E. Claridades

Agropecuarias 208: 28-37, Diciembre (2010) (invitada).

“Una nueva herramienta para la caracterización precisa y cuantitativa de la antracnosis del mango, de utilidad

para fitopatólogos, productores y exportadores”, Corkidi, G., Rojas, A., Balderas, K., Sangabriel, J.C.,

Serrano, L., Galindo. E., Claridades Agropecuarias 198: 39-47, Febrero (2010) (invitada).

Capítulo de libro

Peña, C., Núñez, C., Castillo-Marenco, T., Segura, D. (2011). Bioprocess design: fermentation strategies for

improving the production of alginate and poly-β-hydroxybutyrate (PHB) by Azotobacter vinelandii. En:

Progress in Molecular and Environmental Bioengineering, Ed. Angelo Carpi, Intech Open Acess

Publisher ISBN: 978-953-307-268-5. Pp. 217-242.

Innovación (2010-2011):

Patente (México): “Método para obtener una composición líquida con Rhodotorula minuta, efectiva

para control biológico de antracnosis y la composición obtenida”, E. Galindo, L. Serrano, L. Trujillo, A.

Carrillo, R. García, R. Allende y M. Patiño. Otorgada el 19 de Octubre de 2011.

Graduación de la Empresa Agro&Biotecnia S. de R. L. de Mi., en la Incubadora de Alta Tecnología del

Centro Morelense de Innovación y Transferencia de Tecnología (10 de diciembre de 2010).

Fundación e incubación de la Empresa Biopolymex.

4

Tesis concluidas (2010-2011):

“Influencia de la tensión de oxígeno disuelto y de la fuente de nitrógeno sobre la producción y

propiedades químicas del alginato sintetizado por Azotobacter vinelandii DM”. Andrés García

Romero, Universidad Autónoma del Estado de Morelos, Escuela de Biología, 9 de Diciembre de 2011.

(Celia Flores).

“Desarrollo de un sistema quimiostato para el estudio de la síntesis de alginato en Azotobacter

vinelandii”. Florencio Ramos Gómez, Ingeniería en Biotecnología, Universidad Politécnica del Estado de

Morelos, Abril del 2011. (Carlos Peña/Tania Castillo).

“Estudio de las condiciones hidrodinámicas del cultivo de Pleurotus ostreatus CP50 en fermentador de

10 litros”. Fabiola Amezcua Castillo. Carrera: Ingeniería Química. Instituto Tecnológico de Zacatepec.

Febrero 11 de 2011. (L. Serrano/Raunel Tinoco).

“Identificación parcial de antibióticos ciclo-lipopeptídicos termorresistentes producidos por Bacillus

subtilis 83 con actividad antifúngica contra Fusarium spp”, Yuridia Solís Arcos, Universidad Autónoma

del Estado de Morelos, Ingeniería Química, 9 de Diciembre de 2010 (E. Galindo/Ma. Eugenia Ramírez).

“Estudio cinético de la producción de lacasas por Pleurotus ostreatus CP50 en medios complejos”.

Abisaí Acevedo Quiroz. Carrera: Ingeniería Química. Instituto Tecnológico de Zacatepec, Marzo 4 de 2010.

(L. Serrano/Raunel Tinoco).

Docencia (2010-2011):

Curso “Metodología de la Investigación”, Colegio Marymount (Preparatoria), Semestre 2010-I, Semestre

2011-I (E. Galindo).

Curso: “Bioingeniería”, Maestría en Ciencias Bioquímicas, Instituto de Biotecnología, UNAM, Semestres

2010-I (E. Galindo, L. Serrano, C. Peña, en colaboración con otros participantes).

Curso-Taller: “Bioprocesos con microorganismos recombinantes”, Instituto de Biotecnología, UNAM,

Cuernavaca, Mor., 2010 (2 ediciones), 2011 (2 ediciones) (E. Galindo, L. Serrano, C. Peña y otros

participantes).

Tópico Selecto "Diseño Experimental en Biotecnología". Semestre 2010-I. Programa de Posgrado en

Ciencias Bioquímicas-UNAM. (L. Serrano).

Donativos (2010-2011):

SEP-CONACyT (Ciencia Básica), “Estudio de la dispersión de fases en un biorreactor agitado

mecánicamente: caracterización en función de la posición espacial dentro del tanque y durante el

proceso de fermentación” (Diciembre 2010-Abril de 2011) (E. Galindo).

DGAPA-UNAM, “Control biológico de la antracnosis de la papaya: pruebas de efectividad en campo y

seguimiento del antagonista Bacillus subtilis 83 en las plantas de la fruta” (Abril 2010-Diciembre 2011)

(E. Galindo).

FOMIX-Morelos “Producción de biofungicidas contra la antracnosis del mango: generación de un plan

de negocios y obtención de licencias y registros de los productos” (Abril 2008-Junio 2010) (E. Galindo).

5

DGAPA-UNAM, “Desarrollo de un proceso en dos etapas para la producción de lacasas por Pleurotus

ostreatus”. (Enero de 2009-Enero de 2011) (L. Serrano).

DGAPA-UNAM, “Estudio de la producción y de la transcripción génica de lacasas de Pleurotus

ostreatus como respuesta al uso de cobre y/o lignina y de las condiciones de proceso”. (Enero 2011-

Enero 2013) (L. Serrano).

SEP-CONACyT (Ciencia Básica), “Estudio de los factores termodinámicos que determinan la

protección contra el estrés térmico y oxidativo de esporas de Trichoderma harzianum

microencapsuladas por secado por aspersión” (Mayo 2009–Mayo 2013) (L. Serrano).

SEP-CONACyT (Ciencia Básica), “Producción de alginatos bacterianos por fermentación: estudio de la

síntesis y composición del polímero bajo condiciones de limitación extrema”. Enero 2011-Diciembre del

2013) (C. Peña).

DGAPA-UNAM, “Estudio de la acetilación de los alginatos sintetizados por Azotobacter vinelandii en

función de la tensión de oxígeno disuelto y la velocidad específica de crecimiento”. (Enero 2010-

Diciembre del 2012). (C. Peña).

CONACyT-CONICyT (Cooperación Binacional México-Chile) “Producción de alginatos bacterianos por

fermentación: desarrollo de estrategias de cultivo celular y escalamiento para la producción de

alginatos con composición química definida para ser usados en aplicaciones industriales específicas”.

(2011-2012). (C. Peña).

CONACyT-DLR (Cooperación Binacional México-Alemania) “Metabolic fluxes of Acetyl CoA in

Azotobacter vinelandii and its relationship with alginate acetylation and PHB production. (2011-2012).

(C. Peña).

Premios y Distinciones (2010-2011):

Premio AgroBIO 2010 a la trayectoria en Biotecnología Agrícola, octubre de 2010 (E. Galindo).

"Reconocimiento al Mérito Estatal de Investigación 2009" en la categoría de "Divulgación y

Vinculación", como integrante (y coordinador) del Comité Editorial de la Academia de Ciencias de Morelos,

A.C., Consejo de Ciencia y Tecnología del Estado de Morelos, Diciembre de 2010 (E. Galindo).

“Miembro de Honor”, Sociedad Mexicana de Biotecnología y Bioingeniería, A.C., Junio de 2011 (E.

Galindo).

Premio Universidad Nacional, en la categoría de Innovación Tecnológica y Diseño Industrial, Octubre de

2011 (E. Galindo).

Otras actividades relevantes (2010-2011):

Miembro del Jurado del Premio Nacional de Ciencias y Artes 2011, categoría Innovación Tecnológica y

Diseño Industrial (E. Galindo).

Integrante de la Comisión Evaluadora del Programa de Estímulos al Desempeño del Personal Docente de la

Universidad Autónoma del Estado de Morelos (2011) (E. Galindo).

6

Coordinador del Comité Editorial de la Academia de Ciencias de Morelos (2009-2010) (E. Galindo).

Investigador Invitado en el Comité Técnico y de Administración del Fondo Sectorial de Investigación para la

Educación SEP-CONACyT (2009-a la fecha) (E. Galindo).

Integrante de la Comisión de Admisión del Posgrado en Ciencias Biológicas, Centro de Investigación

Científica de Yucatán, Mérida, Yuc., 22 y 23 de Julio de 2010. (E. Galindo).

co-Edición (E. Galindo) del libro "La Ciencia, desde Morelos para el Mundo, Tomo I: Ciencia y Sociedad",

publicado por la Academia de Ciencias de Morelos y el periódico "La Unión de Morelos", Septiembre 2011.

Jurado del Premio AgroBIO 2011 (E. Galindo).

Miembro de la Comisión de Premios de la ACMor (2009-2010) (L. Serrano).

Miembro de la Comisión de Premios de la AMC (2011-2012) (L. Serrano).

Miembro del Consejo Directivo del Programa Adopte un Talento (PAUTA) (2011- ) (L. Serrano).

7

Grupo Dr. Enrique Morett (Lunes 12, de 10:30 a

11:00 hrs.).

Título de la Plática: Regulación global de la expresión genética en E. coli y G. sulfurreducens.

Integrantes del Grupo (2010-2011):

Dr. Juan Enrique. Morett. Investigador.

Dra. Katy Juárez. Investigador.

Dra. Sonia Dávila. Investigador Postdoctoral.

Dr. Angel Andrade (hasta Agosto 2011). Investigador Postdoctoral.

M en C Leticia Olvera. Técnico Académico.

Biol. Maricela Olvera. Técnico Académico

M en C. Alfredo Mendoza (hasta Agosto 2011). Técnico Académico por honorarios.

Ing. Ana Lilia Tirado. Técnico Académico por honorarios.

Evelyn Sánchez. Técnico Académico por honorarios.

Fernando Riveros Mckay. Técnico Académico por honorarios.

Martín del Castillo. Técnico Académico por honorarios.

Dra. Leticia Vega. Técnico Académico del CCADET.

(en estancia temporal).

M.C. Blanca Itzel Taboada. Técnico Académico del CCADET.

(en estancia temporal).

Getzabet González. Estudiante de Doctorado.

Paloma Lara. Estudiante de Doctorado.

Brenda Sanchez. Estudiante de Maestría.

Israel Aguilar. Estudiante de Maestría.

Alberto Ramos. Estudiante de Maestría.

Lizeth Soto. Estudiante de Maestría.

8

Willebaldo García. Estudiante de Licenciatura.

Luis Renato Arriola Martinez . Estudiante de Licenciatura.

Paola Saldierna (hasta Marzo 2011). Estudiante de Lic. en Biología.

Lic. Leonardo Collado (hasta Agosto 2011). Analista de Winter Genomics.

(en estancia temporal).

Carlos Vargas. Analista de Winter Genomics.

(en estancia temporal).

Vanesa Dulanto. Analista de Winter Genomics.

(en estancia temporal).

Javier Dorantes. Laboratorista.

Integrantes de la Unidad Universitaria de Secuenciación Masiva.

Dr. Ricardo Alfredo Grande. Técnico Académico

M.C. Verónica Jiménez. Técnico Académico.

Resumen de la plática:

Los intereses del grupo son estudiar los mecanismos regulatorios que controlan la transcripción en E. coli y

en Geobacter sulfurreduscens así como la bioremediación de metales pesados y la producción de

electricidad por este último. Adicionalmente, estamos enfocados al desarrollo de herramientas

experimentales y analíticas de secuenciación masiva. Nuestras estrategias combinan el trabajo experimental

con estudios y predicciones bioinformáticas, algunas son evaluadas experimentalmente. Presentaremos

nuestros avances en regulación global de la expresión genética mediante la determinación de los sitios de

inicio de la transcripción (TSSs) utilizando metodologías de secuenciación masiva. Estos proyectos,

desarrollados en colaboración con Julio Collado y Derek Lovely, Universidad de Massachusetts, están

orientados a mapear experimentalmente el mayor número de promotores, unidades transcripcionales y

sitios de regulación en E. coli y en G. sulfurreducens para entender globalmente la regulación de la expresión

genética.

Actualmente, la secuenciación masiva aplicada a la determinación de los TSSs ha extendido el campo de la

regulación genética desde una perspectiva local a un nivel global a un costo relativamente reducido. Varios

protocolos han sido desarrollados y optimizados en nuestro laboratorio y en otros para la preparación de

bibliotecas de mRNAs, incluido uno para el enriquecimiento de los transcritos primarios, con el fin de

incrementar la certeza del mapeo de los TSSs. Con estas metodologías ha sido posible obtener información

nunca antes disponible, como la identificación de múltiples promotores para la expresión de un gene u

operón en condiciones específicas de crecimiento, la detección de transcritos dentro de los operones y,

sorprendentemente, gran abundancia de transcripción antisentido, probablemente involucrada en algunos

casos en controlar la expresión genética. Por otra parte, es altamente probable que estemos detectando con

9

estas poderosas metodologías un número importante de eventos de transcripción fortuitos, esto es

fluctuaciones estocásticas en eventos de transcripción de células individuales creciendo en un mismo cultivo

supuestamente uniforme. Sin duda, la célula es capaz de tolerar sin consecuencias desfavorables la mayoría

de estos eventos.

Por otra parte, se ha observado, aunque no hay gran experiencia, que las moléculas independientes, ya sean

DNA o cDNA, no son secuenciadas todas con la misma eficiencia. Más aún dentro de un transcrito, no se

obtienen al mismo nivel los extremos que las regiones centrales, lo que afecta su probabilidad de ser

secuenciadas. Entender estos fenómenos requiere del desarrollo de nuevas metodologías bioinformáticas

que puedan corregir y eliminar falsos positivos.

En este trabajo desarrollamos un procedimiento novedoso de selección de verdaderos TSSs incorporando un

paso de enriquecimiento de extremos 5´trifosfatados de los mRNAs, combinado con el uso de una

metodología ya reportada de eliminación de extremos 5´monofosfatados por digestión con una

exonucleasa. Esta combinación nos permitió una mayor certeza en la asignación de verdaderos TSSs. Por

otra parte, desarrollamos una metodología bioinformática que nos permite rápidamente visualizar

gráficamente y analizar los millones de datos obtenidos por experimento de secuenciación masiva de

manera eficiente, eliminando el ruido metodológico. Podemos identificar con estas herramientas los

posibles promotores y sitios de unión de los diversos reguladores transcripcionales conocidos para estas dos

bacterias.

Los resultados obtenidos nos muestran un muy elevado número de promotores, principalmente localizados

en las regiones upstream de los genes, pero también dentro de ellos. La transcripción antisentido continúa

siendo muy elevada pero es en estas regiones donde menos frecuentemente localizamos promotores

asociados a los TSSs. Para más de 50 transcritos antisentido hemos evaluado la presencia de promotores,

encontrando que sólo una fracción de ellos son funcionales, posiblemente involucrados en regulación. La

expresión del resto pudiera ser fortuita.

Con las metodologías desarrolladas continuaremos con el mapeo de TSSs en diferentes condiciones de

crecimiento y también evaluaremos el efecto de mutaciones en reguladores y en factores transcripcionales

para tener una mejor comprensión de la regulación de la expresión genética global en estas dos bacterias.

Titulo del Cartel: Bioremediación de Cr(VI)

Publicaciones (2010-2011):

1.- Gama-Castro S, Salgado H, Peralta-Gil M, Santos-Zavaleta A, Muñiz-Rascado L, Solano-Lira H,

Jimenez-Jacinto V, Weiss V, García-Sotelo JS, López-Fuentes A, Porrón-Sotelo L, Alquicira-Hernández S,

Medina-Rivera A, Martínez-Flores I, Alquicira-Hernández K, Martínez-Adame R, Bonavides-Martínez C,

Miranda-Ríos J, Huerta AM, Mendoza-Vargas A, Collado-Torres L, Taboada B, Vega-Alvarado L, Olvera

M, Olvera L, Grande R, Morett E, Collado-Vides J. 2011. RegulonDB version 7.0: transcriptional

regulation of Escherichia coli K-12 integrated within genetic sensory response units (Gensor Units).

Nucleic Acids Res. 39: D98-105.

2.- Massimelli MJ, Sanchez DG, Buchieri MV, Olvera L, Beassoni PR, Schweizer HP, Morett E and Lisa AT.

2010. Choline catabolism, sigma(54) factor and NtrC are required for the full expression of the

Pseudomonas aeruginosa phosphorylcholine phosphatase gene. Microbiol Res. 166:380-90.

10

3.- Krushkal J, Juárez K, Barbe JF, Qu Y, Andrade A, Puljic M, Adkins RM, Lovley DR, Ueki T. Genome-wide

survey for PilR recognition sites of the metal-reducing prokaryote Geobacter sulfurreducens. 2010. Gene

469: 31-44.

4.- Krushkal J, Adkins R, Qu Y, Pepples J, Sontineni S, Leang C, Brown P, Young N, Juarez K and D. R Lovley.

Bioinformatic analysis of gene regulation in the metal-reducing bacterial family Geobacteraceae. 2010.

Bioinformatics Summit 2010. BMC Bioinformatics 11 (Suppl 4):A9, 11.

5.- Ortega-Martínez AC, Vázquez-Larios AL, Juárez-López K, Solorza-Feria O, Poggi-Varaldo HM. 2010. A

review of biocathodes and enrichment strategies of electrochemically active bacteria for enhanced

bioelectricity generation in microbial fuel cells. Journal of Biotechnology. 150, Supp. 1 144-145.

6.- Fuentes, C., Del Razo, A., Juárez, K. Alvarez, A. 2011. Influence of NaCl, Na2SO4 and O2 on power

generation from microbial fuel cells with non-catalyzed carbon electrodes and natural inocula. Solar Energy

Journal. ACEPTADO.

CAPITULOS EN LIBROS

1.- Ortega-Martínez AC, Vázquez-Larios AL, Hernández-Flores G, Juárez-López K, Galíndez-Mayer J,

Rinderknecht-Seijas N, Ponce-Noyola MT, Solorza-Feria O, Poggi-Varaldo HM. Capítulo 12. Procedimientos

de enriquecimiento de bacterias electroquímicamente activas en celda de combustible microbiana y

ventajas del uso de biocátodos . In: Ríos-Leal E, Solorza-Feria O, Poggi-Varaldo HM (Editores). Energías

Renovables Biológicas – Hidrógeno - Pilas de combustible- II. 2010. ISBN 978-607-00-3608-8. CINVESTAV del

IPN e ICYTDF. México D.F., México. pp. 168-189. Book in CD-ROM.

2.- Ortega-Martínez AC, Juárez-López K, Galíndez-Mayer J, Rinderknecht-Seijas N, Ponce-Noyola MT, Solorza-

Feria O, Poggi-Varaldo HM. Capítulo 13. Minimización de resistencia interna en una celda de combustible

microbiana de nueva arquitectura. In: Ríos-Leal E, Solorza-Feria O, Poggi-Varaldo HM (Editores). Energías

Renovables Biológicas – Hidrógeno - Pilas de combustible- II. 2010. ISBN 978-607-00-3608-8. CINVESTAV del

IPN e ICYTDF. México D.F., México. pp. 190-205. Book in CD-ROM.

DIFUSION

CIENCIA Y DESARROLLO. Sep 2010. HELIX 75. EXTREMOFILOS. SUPLEMENTO PARA JOVENES, KATY JUÁREZ Y

PAOLA SALDIERNA

Innovación* (2010-2011):

Tesis Concluidas* (2010-2011):

Tesis de Licenciatura: Lorna Luna Mejía. Carrera de Licenciatura en Ingeniería Química UAEM Construcción

y Operación de una Biocelda de Combustible. Marzo 2010

Tesis de Licenciatura en Biología –UAEM. Lizeth Soto Avila Efecto de la fosforilación en el sistema de

regulacion de dos componentes PilR/PilS en Geobacter sulfurreducens. Mayo 2010

Tesis de Licenciatura en Ciencias Genómicas. UNAM, Carlos Vargas Chavez. 9 agosto 2010

11

Tesis de Licenciatura en Biología –UAEM. “Identificación de bacterias de un sitio contaminado con Cr(VI)

por medio del análisis de secuencias de DNAr 16S”. Jessica Paola Saldierna. Enero 2011

Tesis de Maestría en Ciencias Bioquímicas. Gabriel Contreras Ferrat. 2010.

Tesis de Maestría en Ciencias Bioquímicas. Yagul Pedraza Pérez. 2010.

Docencia* (2010-2011): Se refiere a cursos en licenciatura, posgrado, servicios sociales, estancias,

entrenamientos, etc.

Donativos* (2010-2011):

Enrique Morett (Responsable)

1) Ciencia Básica- CONACYT 2008-2010

2) InovaPIME- CONACYT 2010

3) InovaPIME- CONACYT 2011

4) NIH-USA 2008-2011

5) PAPIIT-DGAPA 2008-2010

Katy Juárez (Responsable)

1) Ciencia Básica- CONACYT 2008-2010

2) PAPIIT-DGAPA 2009-2011

Premios y Distinciones* (2010-2011):

Dr. Angel Andrade SNI- CANDIDATO

M en C Leticia Olvera. SNI- NIVEL I

Biol. Maricela Olvera. SNI- CANDIDATO

M en C. Alfredo Mendoza (hasta Agosto 2011). SNI- CANDIDATO

12

13

Grupo Dr. Lorenzo Segovia (Lunes 12, de 11:15 a

11:45 hrs.).

Evolución de la relación estructura y función de proteínas

Integrantes del Grupo (2010-2011):

Lorenzo Segovia

Claudia Martínez Anaya

Ernesto Pérez Rueda

Dagoberto Armenta (D)

Nancy Rivera (D)

Viviana Escobar (D)

Jesús A. banda (LM)

Ximena Contreras (L)

Valérie De Anda (L)

Fernando García (LM)

Mario Mendoza (M)

Catalina Morales (M)

Ana Lilia Pérez (L)

Dainis Tlalmis (L)

Pedro Zapotitla (L)

Ximena Martínez de la Escalera (L)

Adriana Espinosa (M)

Eduardo Soto (L)

Resumen:

Una de las metas de la biotecnología moderna es generar enzimas con actividades enzimáticas que puedan suplir procesos

químicos los cuales son en algunos casos caros y contaminantes. Para ello se han buscado enzimas que cumplan con los

requerimientos particulares de estos procesos usando la ingeniería de proteínas para modificar las propiedades tanto de

estabilidad como de actividad. Desafortunadamente, se necesita de mucha información a priori, la cual no siempre es fácil

de obtener, para poder diseñar los cambios requeridos. Recientemente el grupo de R. Ranganathan desarrolló un método

estadístico llamado SCA, el cual detecta los residuos que covarían en un alineamiento múltiple de proteínas homólogas.

Estos residuos coevolucionados están organizados espacialmente en canales físicamente conectados, uniendo sitios

distantes funcionales de gran relevancia para el proceso de plegamiento y la actividad de la proteína. Por otro lado, se

sabe que uno de los mecanismos evolutivos principales de generación de actividades nuevas ha sido mezclar dominios

estructurales asociados a una función. Tal es el caso de las deshidrogenasas donde se observa que comparten un dominio

Rossmann, que confiere la capacidad catalítica, fusionado a dominios de especificidad distintos. Queremos explorar este

camino generando quimeras de proteínas homólogas de la Shikimato deshidrogenasa (SDH) donde se intercambien los

dominios Rossmann. El análisis de SCA nos permite ver cuáles son las redes de interacción dentro de estas proteínas y en

su caso diseñar mutaciones que permitan el acoplamiento entre los dominios quiméricos. Hemos estudiado la

interrelación que existe entre las posiciones estadísticamente acopladas reveladas utilizando el algoritmo de SCA con los

efectos observados en la estabilización y cambio de capacidades catalíticas de proteínas consenso. Esto permite entender

14

cuáles son las posiciones que verdaderamente contribuyen a la estabilización o a la función para el diseño de enzimas con

propiedades mejoradas. Dada la prevalencia del dominio Rossmann hemos extendido este análisis de dos maneras: hemos

analizado las covariaciones observables en el dominio Rossmann cuando este se encuentra asociado a deshidrogenasas

pero en distintos lugares del polipéptido. Se sabe que este puede estar insertado hacia el extremo NH2, al centro o hacia

el extremo COOH, tal como es el caso de SDH. Hemos observado que estos sitios covariantes no se conservan, sin

embargo encontramos zonas comunes, las cuales parecen ser específicas del dominio Rossmann que une dinucleótidos.

Por otra parte hemos analizado dominios Rossmann que forman proteínas monodominio tal como es el caso de CheY. Este

análisis ha sido extendido a otros dominios no asociados a deshidrogenasas. Hemos podido identificar los residuos

involucrados con el plegamiento y la zona de la proteína que parece tener la disposición ancestral para llevar a cabo

distintos tipos de catálisis. Estas informaciones son de gran utilidad para el diseño de nuevas enzimas. Por último

presentaremos los resultados de análisis de SCA tanto para entender la dinámica molecular de la enzima Adenilato Cinasa

(ADK) como para el diseño de mutaciones que podrían impedir la inhibición por sustrato de enzimas alostéricas como es el

caso de la Prefenato deshidratasa. Estos conocimientos serán de gran utilidad para poder diseñar y construir

posteriormente quimeras de novo buscando actividades no existentes en la naturaleza.

Titulo del Cartel:

Caracterización de la relación Estructura-Actividad de proteínas amorfogénicas de la celulosa. Claudia Martínez

Anaya

Publicaciones* (2010-2011):

1. Mariana Peimbert, Luis David Alcaraz, Germán Bonilla-Rosso, Gabriela Olmedo-Alvarez, Felipe García-Oliva, Lorenzo Segovia, Luis E. Eguiarte, and Valeria Souza (2011) Comparative metagenomics of two microbial mats at Cuatro Ciénegas Basin I:Ancient lessons on how to cope with an environment under severe nutrient stress. Astrobiology -Aceptado

2. Vazquez-Lima,H. Guadarrama,P. Martinez-Anaya,C. 2011. Geometric distortions on a three-coordinated T1 Cu site model as a potential strategy to modulate redox potential. A theoretical study J Mol Model,May 4. [Epub ahead of print], .

3. Quiroz-Castaneda,R.E. Martinez-Anaya,C. Cuervo-Soto,L.I. Segovia,L. Folch-Mallol,J.L. 2011. Loosenin, a novel protein with cellulose-disrupting activity from Bjerkandera adusta Microb Cell Fact, 10, 8.

4. Quiroz-Castaneda,R.E. Perez-Mejia,N. Martinez-Anaya,C. Acosta-Urdapilleta,L. Folch-Mallol,J. 2011.Evaluation of different lignocellulosic substrates for the production of cellulases and xylanases by the basidiomycete fungi Bjerkandera adusta and Pycnoporus sanguineus Biodegradation, 22, 565-572.

5. Rivera-Gomez,N. Segovia,L. Perez-Rueda,E. 2011. The diversity and distribution of TFs and their partner domains play an important role in the regulatory plasticity in bacteria Microbiology, 157, 2308-2318.

6. Armenta-Medina,D. Perez-Rueda,E. Segovia,L. 2011. Identification of functional motions in the adenylate kinase (ADK) protein family by computational hybrid approaches Proteins, 79, 1662-1671.

7. Tenorio-Salgado,S. Huerta-Saquero,A. Perez-Rueda,E. 2011. New insights on gene regulation in archaea Comput Biol Chem, 35, 341-346.

8. Knodler,L.A. Ibarra,J.A. Perez-Rueda,E. Yip,C.K. Steele-Mortimer,O. 2011. Coiled-coil domains enhance the membrane association of Salmonella type III effectors Cell Microbiol, 13, 1497-1517.

9. Santos-Zavaleta,A. Gama-Castro,S. Perez-Rueda,E. 2011. A comparative genome analysis of the RpoS-sigmulon shows a high diversity of responses and origins Microbiology, 157, 1393-1401.

10. Chavez-Calvillo,G. Perez-Rueda,E. Lizama,G. Zuniga Aguilar,J.J. Gaxiola,G. Cuzon,G. Arena-Ortiz,L. 2010. Differential gene expression in Litopenaeus vannamei shrimp in response to diet changesAquaculture, 300, 137-141.

11. Perez-Rueda,E. Janga,S.C. 2010. Identification and genomic analysis of transcription factors in archaeal genomes exemplifies their functional architecture and evolutionary origin Mol Biol Evol., 27, 1449-1459.

15

12. Martinez-Nunez,M.A. Perez-Rueda,E. Gutierrez-Rios,R.M. Merino,E. 2010. New insights into the regulatory networks of paralogous genes Microbiology, 156, 14-22.

Tesis Concluidas* (2010-2011):

Ximena Martínez de la Escalera (L FC-UNAM))

Adriana Espinosa (MBQ)

Eduardo Soto (LCG)

Dagoberto Armenta (MBQ)

Jesús Banda (LCG)

Fernando García (LCG)

Pedro zapotitla (L FC-UAEM)

Patricia Ortegón. Maestría en Ciencias e Ingeniería de la Computación UNAM

Docencia* (2010-2011):

Curso Básico de Biología Molecular. Doctorado en Ciencias. CICESE. 01/agosto/2011 - 11/noviembre/2011 Herramientas bioinformáticas en el estudio de la regulación transcripcional en procariotes. 5 horas a la semana. IBT de 11/03/2011 a 15/06/2011. Alineamientos múltiples. Métodos de Clustalw, Pileup, T-coffee y Muscle. Bioinformática. Enero 2011 – Junio 2011. Facultad de Ciencias, UAEM. Fundamentos y Metodologías de las Interacciones proteína-proteína. PCBQ 4 horas a la semana. IBT Analisis de secuencias en genomas completos: El caso de los reguladores transcripcionales, nivel Posgrado en Ciencias Genómicas. UACM 19/10/2010 a 19/10/2010. Bioinformática. Doctorado en Genética Humana. UdG de 06/06/2010 a 11/06/2010. Bioinformatica. Licenciatura en Licenciatura en Biologia 4 horas a la semana (Docente). Facultad de Ciencias, 02/09/2010 a 02/09/2010.

Taller de Taller Facultad de Ciencias. LA BIOLOGÍA A PARTIR DE LAS BIOMOLÉCULAS; NUEVOS PARADIGMAS Y

APLICACIONES.

Donativos* (2010-2011):

CONACYT 155116. Comparación de rutas metabólicas utilizando algoritmos genéticos: Un enfoque genómico.

(2010)

CONACYT 132580 Análisis evolutivo y diseño de dominios Rossmann en la superfamilia de las Aminoácido

Deshidrogenasas.(2011)

PAIIPA-UNAM. (IN-209511). Reconstrucción de redes regulatorias en Arqueas. 2011-2013.

PAIIPA-UNAM. (IN-213511). Uso de información evolutiva para diseñar quimeras de proteínas. 2011-2013

Premios y Distinciones* (2010-2011):

16

Ernesto Pérez-Rueda:

Beca CONACYT. Estancia Sabática. Wilfrid Laurier University. Canadá. 2011-2012

Beca al desempeño académico

PRIDE Nivel D. 2011-2015.

Definitividad y promoción a Investigador Titular B. UNAM. 2011.

Claudia Martínez Anaya:

PAIPA nivel B

17

Grupo Dr. Xavier Soberón (Lunes 12, de 11:45 a 12:15

hrs.).

18

Grupo Dra. Alejandra Covarrubias (Lunes 12, de 12:30 a

13:00 hrs.).

MECANISMOS MOLECULARES DE LA RESPUESTA AL

DEFICIT HÍDRICO EN PLANTAS

Alejandra A. Covarrubias Robles (Investigador Titular C)

José Luis Reyes Taboada (Investigador Titular A)

Francisco Campos Álvarez (Investigador Titular A)

Miguel Ángel Rosales Villegas (Posdoctoral UNAM, 2009-2010)

J. Efraín Ramírez Benítez (Posdoctoral CONACyT, 2010)

Rocío Rodríguez Valentín (Posdoctoral CONACyT, 2010)

Yadira Olvera Carrillo (Doctorado CBQ)

Cecilia Contreras Cubas (Doctorado CBM)

Lucero Rivera Nájera (Doctorado CBQ)

César L. Cuevas Velazquez (Doctorado CBQ)

V. Miguel Palomar Olguín (Doctorado CBM)

Guadalupe Sosa Valencia (Doctorado CBM)

Carlos de la Rosa Ureña (Maestría CBQ)

Inti Arroyo Mosso (Maestría CBQ)

Minerva S. Trejo Arellano (Licenciatura CG)

Arturo Velarde Garduño (Licenciatura CG)

Edilia Ocampo Flores (Licenciatura, FB-UAEM)

Coral Martínez Martínez (Licenciatura FC-UNAM)

Marco A. Ortiz (Estancia CG)

José Pineda de la O (Licenciatura, FB-UAEM)

Resumen

El interés de nuestro grupo ha sido identificar y tratar de entender los mecanismos de respuesta de plantas vasculares a

condiciones de limitación de agua. En estos dos últimos años hemos avanzado principalmente en los proyectos dirigidos a:

(a) identificar y determinar la función de microRNAs en la respuesta a la limitación de agua en frijol. La caracterización de

los RNAs pequeños identificados previamente ha mostrado, por un lado, que éstos realmente corresponden a microRNAs

y, por otro, ha revelado datos interesantes relacionados a su organización genómica. Ejemplo de ello es la presencia de

dos miRNAs diferentes en un mismo precursor cuya acumulación se da de manera diferencial en respuesta a condiciones

de estrés; también hemos encontrado que otro par de miRNAs que responden a condiciones de estrés, aunque se

procesan en este caso de dos precursores diferentes, ambos se transcriben de un transcrito policistrónico.

Adicionalmente, la identificación de RNAs pequeños implicados en la respuesta de frijol a déficit hídrico se ha optimizado

dado que se han secuenciado masivamente bibliotecas construidas a partir de RNAs pequeños obtenidos de plantas

crecidas bajo condiciones óptimas o bajo condiciones de limitación de agua; ésto ha permitido identificar tanto posibles

miRNAs como siRNAs u otro tipo de RNAs pequeños que serán analizados para priorizar su estudio posterior. Por otro

19

lado, a pesar de no contar con la secuencia completa del genoma de frijol ha sido posible identificar algunos de los RNAs

mensajeros blanco de algunos de estos miRNAs, en buena parte debido a que se construyó una biblioteca enriquecida en

transcritos procesados por miRNAs, la cual se sometió a secuenciación masiva, de tal forma que su análisis permitió

identificar varios transcritos blanco por complementariedad con los miRNAs identificados.

(b) determinar la participación y la función de las hidrofilinas vegetales durante la respuesta a déficit hídrico. El análisis

funcional de mutantes deficientes en proteínas LEA de diferentes familias demostró la participación de estas proteínas en

la adaptación de las plantas al déficit hídrico. El análisis funcional se ha complementado con un análisis estructural por

dicroísmo circular y RMN, el cual ha revelado que estas proteínas LEA, en particular las clasificadas en el grupo 6 poseen

un alto grado de desorden estructural en solución acuosa que está en equilibrio con estructuras que mantienen expuesta

a la proteína a la solución. También se ha demostrado que esta proteína tiene la capacidad de formar estructuras

ordenadas y que la baja disponibilidad de agua y el amontonamiento molecular son capaces de promover cambios

conformacionales. Estos datos han reforzado nuestro modelo propuesto para el funcionamiento de estas proteínas.

(c) determinar caracteres fisiológicos asociados a la resistencia a sequía en cultivares de frijol. Caracterizamos tres

cultivares de frijol que difieren en su resistencia a sequía para determinar parámetros fisiológicos asociados a la

resistencia a sequía que permitan en el futuro definir marcadores que puedan ser utilizados en la selección de cultivares

resistentes, así como mecanismos capaces de conferir resistencia a esta ambiente adverso en el campo.

Título de los carteles

1) Respuestas a déficit hídrico moduladas por microRNAs en Phaseolus vulgaris

Responsable: José Luis Reyes

2) Análisis estructural de proteínas LEA del grupo 6

Responsable: Lucero Rivera Nájera

Publicaciones (2010-2011):

Yadira Olvera-Carrillo, Francisco Campos, José Luis Reyes, Alejandro Garciarrubio. Alejandra A. Covarrubias. Functional

Analysis of the Group 4 Late Embryogenesis Abundant proteins reveals their relevance in the adaptive response during

water deficit in Arabidopsis thaliana. Plant Physiology 154: 373-390 (2010)

Yadira Olvera-Carrillo, José Luis Reyes, Alejandra A. Covarrubias. Late Embryogenesis Abundant proteins: versatile players

in the plant adaptation to water limiting environments. Plant Signaling and Behavior 64: 1-4 (2011)

Francisco Campos, Gabriel Guillén, José L Reyes, Alejandra A Covarrubias. A general method of protein purification for

recombinant unstructured non-acidic proteins. Protein Expression and Purification. 80: 47-51 (2011)

Covarrubias AA, Reyes JL. Post-transcriptional gene regulation of salinity and drought responses by plant

microRNAs. Plant Cell Environ 33, 481-489 (2010).

Valdés-López O, Yang SS, Aparicio-Fabre R, Graham PH, Reyes JL, Vance CP, Hernández G. MicroRNA expression profile in common bean (Phaseolus vulgaris) under nutrient deficiency stresses and manganese toxicity. New Phytol 187: 805-818 (2010).

Cecilia Contreras-Cubas, Fernando Rabanal, Catalina Arenas, Alejandra A. Covarrubias, José Luis Reyes. The Phaseolus

20

vulgaris miR159a precursor encodes a second differentially expressed microRNA. Plant Molecular Biology. DOI

10.1007/s11103-011-9847-0 (2011)

Miguel A. Rosales, Sonia M. Cuéllar, María de la Paz Arrieta-Montiel, Jorge Acosta-Gallegos, Alejandra A. Covarrubias.

Physiological traits related to terminal drought resistance in common bean (Phaseolus vulgaris L). Journal of the Science of

Food and Agriculture. En revisión.

Miguel A. Rosales, Edilia Ocampo, Rocío Rodríguez-Valentín, Yadira Olvera-Carrillo, Jorge Acosta-Gallegos, Alejandra A. Covarrubias. Physiological analysis of common bean (Phaseolus vulgaris L.) cultivars uncovers characteristics related to the resistance to terminal drought. Plant & Soil. En revisión. Pablo Peláez Hernández, Minerva S. Trejo Arellano, Luis P. Iñiguez Rábago, Georgina Estrada-Navarrete, Alejandra A.

Covarrubias Robles, José Luis Reyes Taboada, Federico E. Sánchez Rodríguez. Identification and characterization of

microRNAs in Phaseolus vulgaris by high-throughput sequencing. BMC Genomics. En revisión.

Tesis concluidas (2010-2011):

Licenciatura

Víctor Miguel Palomar Olguín. Facultad de Ciencias-UNAM (Tutor: Alejandra A. Covarrubias)

Minerva S. Trejo Arellano. Ciencias Genómicas-UNAM (Tutor: José Luis Reyes Taboada)

Paso directo a doctorado

César L. Cuevas Velázquez. Ciencias Bioquímicas-UNAM (Tutor: Alejandra A. Covarrubias)

Doctorado

Yadira Olvera-Carrillo Ciencias Bioquímicas-UNAM (Tutor: Alejandra A. Covarrubias)

Docencia* (2010-2011):

Servicio Social:

Edilia Ocampo Flores. Facultad de Biología-UAEM (Tutor: Miguel Ángel Rosales Villegas).

José Pineda de la O. Facultad de Biología-UAEM (Tutor: Francisco Campos Álvarez).

Cursos Licenciatura:

Alejandra A. Covarrubias

- Taller “La Biología a partir de las biomoléculas; nuevos paradigmas y aplicaciones”. 6 h /semestre. Facultad de Ciencias. UNAM. Semestres 10-I, 10-2, 11-1, 11-2, 12-1, 12-2.

Cursos de Posgrado:

José Luis Reyes:

- Expresión del genoma vegetal: respuestas a estrés. Doctorado en Ciencias Biomédicas. 12 horas/semestre

(Docente). Coordinadora: Georgina Hernández, CCG. Semestre 2011-1.

- Biología Vegetal, Maestría en Ciencias Bioquímicas 6 horas / semestre. Instituto de Biotecnología, Semestre

2011-1, 2012-1

- Biología Molecular, Maestría en Ciencias Bioquímicas. 6 horas / semestre. Instituto de Biotecnología.

Semestre 2010-1, 2010-2, 2011-1, 2012-1

21

- Tópico selecto: RNAs pequeños: moduladores post-transcripcionales al rescate de plantas en estrés. . Doctorado

en Ciencias Biomédicas. Semestre: 12-1. Responsables: Alejandra A. Covarrubias y José Luis Reyes. Coordinadora:

Guadalupe Sosa (estudiante de doctorado).

Francisco Campos A.

- Biología Vegetal. Maestría en Ciencias Bioquímicas 6 horas / semestre. Instituto de Biotecnología. Semestre

2011-1, 2012-1

Alejandra A. Covarrubias

- Biología Vegetal (Respuesta de las plantas a estrés abiótico: déficit hídrico). Maestría en Ciencias Bioquímicas. 6 horas /

semestre. Instituto de Biotecnología. Semestres: 10-2, 11-1, 12-1

- Bioquímica (Fotosíntesis y Síntesis de nucleótidos). Maestría en Ciencias Bioquímicas. 6 horas / semestre. Instituto de

Biotecnología. Semestres: 10-2, 11-1, 11-2, 12-1.

- Biología Celular (Comunicación celular y matriz extracelular vegetal). Maestría en Ciencias Bioquímicas. 3 horas / semestre. Instituto de Biotecnología. 10-I, 11-1, 12-1

- Tópico selecto: Epigenética y herencia trans-generacional en respuesta a estrés en plantas superiores. Doctorado en Ciencias Biomédicas. Semestre: 11-2 Responsable: Alejandra A. Covarrubias. Coordinador: Miguel Palomar O (estudiante de doctorado).

- Tópico selecto: RNAs pequeños: moduladores post-transcripcionales al rescate de plantas en estrés. Doctorado en Ciencias Biomédicas. Semestre: 12-1. Responsables: Alejandra A. Covarrubias y José Luis Reyes. Coordinadora: Guadalupe Sosa (estudiante de doctorado).

Estancias:

Marco A. Ortiz. Licenciatura en Ciencias Genómicas-UNAM (Tutor: José Luis Reyes)

Donativos* (2010-2011):

- DGAPA-UNAM - IN222309 “Identificación de las moléculas ‘blanco’ para algunas hidrofilinas vegetales”. 2009 – 2011. - CONACyT - 50485-Q “Análisis funcional de algunas hidrofilinas vegetales” Responsable: Alejandra A. Covarrubias.

2006-2009 (real 2007-2010) - CONACyT - 132258 “Estudio funcional de algunas hidrofilinas vegetales y el impacto de su expresión heteróloga en la

tolerancia a sequía” Responsable: Alejandra A. Covarrubias. 2010 - 2013

- DGAPA-UNAM - IN-222509. Regulación post-transcripcional por microRNAs y su contribución en la respuesta

a diferentes estímulos ambientales en plantas superiores. Duración 3 años. 2009-2011. Responsable: José Luis

Reyes

- CONACyT - J48740. Modalidad Investigadores Jóvenes. Estudio de los microRNAs de plantas superiores

Involucrados en la respuesta a diferentes estímulos ambientales. Duración 3 años. 2007-2010. Responsable:

José Luis Reyes

Distinciones.

José Luis Reyes: SNI nivel I

Francisco Campos: SNI nivel I

Alejandra A. Covarrubias: SNI nivel III (Renovación 2011)

22

Otras actividades relevantes* (2010-2011):

Comités editoriales:

Frontiers in Plant Genetics and Genomics. Alejandra A. Covarrubias

Revista Mexicana de Ciencias Agrícolas. Alejandra A. Covarrubias

Associate Editor, BioMedCentral (BMC) Plant Biology. José Luis Reyes

Comités de evaluación:

CONACyT:

Evaluación de proyectos. Categorías: Jóvenes investigadores y grupos. Alejandra A. Covarrubias (2010-2011)

Evaluación de proyectos para Laboratorios Nacionales. Alejandra A. Covarrubias (2009-2010).

Comité de premios

Academia Mexicana de Ciencias. 2011. Francisco Campos A.

Intercambio científico.

Comité Científico: México-Argentina. 2011. Alejandra A. Covarrubias

Comités técnicos:

- Unidad de Proteómica-IBt-UNAM: Alejandra A. Covarrubias

- Unidad de Microscopía-IBt-UNAM Electrónica: Alejandra A. Covarrubias

- Unidad de Cultivo Vegetal-IBt-UNAM: Alejandra A. Covarrubias

Consejos:

- Consejo Interno del IBt-UNAM. Representante del personal académico. Alejandra A. Covarrubias. 2010 – a la fecha.

- Mesa Directiva de la Academia de Ciencias de Morelos. Alejandra A. Covarrubias

Coordinación:

Propuesta a CONACyT para la compra de un nuevo MET para la Unidad de Microscopía Electrónica. Donativo otorgado.

Comisiones:

Comisión permanente de ingreso y egreso del Posgrado (CPIEP) Ciencias Bioquímicas. Alejandra A. Covarrubias

23

Grupo Dr. Federico Sánchez (Lunes 12, de 13:00 a 13:30

hrs.).

Resumen de Presentación. IBT Diciembre 2011.

Federico Esteban Sánchez Rodríguez. Investigador Titular C, TC.

Título de la Plática:

La inmunidad innata, la autofagia y la UPR en la simbiosis Phaseolus vulgaris-Rhizobium etli. Integrantes del Grupo (2010-2011): Investigadores: Investigador Asociado: Dra. Claudia Díaz Camino (Inv. Tit. A, TC) Investigadores Postdoctorales: Dra. Margarita Rodríguez Domínguez y Kessler (01-5- 2008 al 01-5-2010). Dr. Chandrasekar Balu Rajeswari (01-5-2011 al 01-5-2012) Dr. Hernán Ramiro Lazcano (01-12-2009 al 01-12-2010) Profesor visitante Intercambio: Dra. Julieta Pérez Jiménez (tres meses julio-sept 2010) Técnicos Académicos: M en C. Georgina Estrada Navarrete, Técnico Académico Titular C M en C. Juan Elías Olivares Grajales, Técnico Académico Titular B M en C. Gabriel Guillén Solís, Técnico Académico Titular C Estudiantes de Doctorado en curso: Pablo Peláez Eunice Alejandra Zayas Lucio Ricardo Montero Jonathan Rodríguez-López Aarón Barraza Celis Alejandrina Hernández López Gabriel Guillén (Pasante) Georgina Estrada-Navarrete (U. de la Plata) Estudiantes de Maestría en curso: Mauricio Díaz Sánchez Omar Bueno (Revisión de Tesis) Estudiantes de Licenciatura durante 2010-1011 Daniela Elizabeth Ledezma Tejeida José Rodrigo Flores Espinoza Luis Pedro Iñiguez Rábago Eunice Alejandra Zayas Tesis Concluidas* (2010-2011): Tania Islas Flores (Doctorado 2011) Marcos Amed Salazar (Maestría 2010) Nancy Hernández Bueno (Maestría 2011) Eunice Alejandra Zayas (Licenciatura LCG 2010)

24

Luis Pedro Iñiguez (Licenciatura LCG 2011) Tesis concluídas en el grupo durante 2010-2011 Jonathan Rodríguez (Maestría 2010) Neftali Cruz Mireles (Licenciatura) Cynthia Gemalit Martínez Centeno (Licenciatura) Nidia Beltrán (Licenciatura) Docencia* (2010-2011):

-Coordinador del Seminario Aplicaciones de la Genómica. Licenciatuara en Ciencias Genómicas, UNAM. 04/02/2010 a 28/05/2010. 8 horas/semana. - Genómica Funcional 2, nivel en Licenciatura en Ciencias Genómicas. UNAM 6 horas a la semana (Responsable) Impartido en Licenciatura en Ciencias Genómicas de 04/02/2010 a 28/05/2010. -Genómica Funcional 2, nivel en la Licenciatura en Ciencias Genómcas . UNAM. 6horas a la semana (Responsable). 08/08/2011 a 25/11/2011.

-Biología Vegetal, nivel Posgrado en Ciencias Bioquímicas 6 horas al semestre (Docente) Impartido en IBT-UNAM de 07/12/2010 a 09/12/2010. -microRNAs en plantas. Curso 2 horas impartido en el curso de Epigenética impartido por el Dr.Felix Resillas en el Instituto de Fisiología Celular. 14-10-2011. -Curso sobre microRNA y estés abiótico: La toxicidad de metales pesados en plantas. 2h/semana/semestre. Programa del Postgrado en Ciencias Biomédicas. 08/08/2011 a 25/11/2011.

-Comités Tutorales: 9 externos al Programa del IBT y 7 Internos de mis alumnos inscritos. Resumen de la plática: La inmunidad innata, la autofagia y la UPR en la simbiosis Phaseolus vulgaris-Rhizobium etli.

La fijación simbiótica del nitrógeno en los nódulos, es la culminación de una interacción exitosa entre leguminosas y

bacterias fijadoras de nitrógeno. Esta simbiosis surgió hace unos 60 MYA. Es muy reciente en la evolución, si se compara

con la formación de arbúsculos, que ocurre durante la interacción de las plantas con hongos micorrízicos, lo cual ocurrió

hace unos 400 MYA. El reconocimiento entre Phaseolus vulgaris-Rhizobium etli se da como producto de un diálogo

molecular entre ambos simbiontes. Asimismo, se establece un compromiso de “no agresión” por ambos partes. Ni la

planta mata a la bacteria, y la bacteria deja de dividirse una vez que alcanza el estado intracelular cuando se diferencia a la

forma que fija el nitrógeno (bacteroide). Las células de la planta donde se lleva a cabo este proceso se encuentran en el

centro del nódulo, son poliploides (64N), tienen un volumen de varios órdenes de magnitud mayor que una célula típica

de la raíz (cortex) y están en un estado hipóxico ya que inducen a la lehemoglobina. Esta proteína constituye hasta el 20%

de la proteína total del nódulo y se encarga de secuestrar el oxígeno libre para que la nitrogenasa, enzima que lleva a cabo

la FBN, no se “inactive” con este gas. Un nódulo maduro puede llegar a albergar hasta 10 10

bacterias. En los nódulos de P.

vulgaris, muchas de éstas no pierden por completo la viabilidad, al contrario de lo que sucede en otros sistemas donde

Rhizobium queda terminalmente diferenciado e incapaz de recuperar la capacidad de dividirse después de la senescencia

del nódulo.

Algunas de las preguntas que queremos responder en este sistema son:

25

-Cómo se regula negativamente la inmunidad innata en la planta? Por qué Rhizobium puede penetrar y permanecer en la

planta sin ser eliminado por el sistema de muerte tipo vacuolar que se conoce como respuesta hipersensible o HR (por sus

siglas en inglés Hypersensitive Respone) por el cual las plantas se defienden de microorganismos patógenos?

-Por qué las células infectadas no mueren o no entran en senescencia temprana en las condiciones tan adversas en que se

encuentran en el nódulo?

-Cómo puede la planta “alimentar” a 10 10

bacterias para mantenerlas vivas y al mismo tiempo regular que éstas no se

dividan y no se comporten como saprófitas/patógenas antes de la senescencia del nódulo?

Para contestar, al menos parcialmente, estas preguntas hemos estudiado el papel de una chaperona de bajo peso

molecular y de una aspartil protease en la defesa (inmunidad innata) de frijol. Asimismo, hemos estudiado funcionalmente

algunos de los componente que participan en el tráfico vesicular, la autofagia y la respuesta a proteínas no plegadas o UPR

(Unfolded Protein Respose) durante la ontogenia del nódulo de P. vulgaris. Presentaremos evidencias que estos procesos

son esenciales tanto en las etapas tempranas como una vez que el nódulo simbiótico ya está formado y la FBN se inicia.

Titulo de los Carteles: Cartel 1: “Identification and characterization of microRNAs in Phaseolus vulgaris by high-throughput sequencing” Presentado por Pablo Peláez, estudiante de doctorado. Cartel 2: “Bax inhibitor-1 is a programmed cell death negative regulator in the Phaseolus-rhizobia symbiosis“ Presentado por Alejandrina Hernández-López, estudiante de doctorado Publicaciones* (2010-2011): -Federico A. Sánchez Quinto y Federico E. Sánchez Rodríguez. Genética Evolutiva Humana: homínidos antiguos y el Homo sapiens sapiens. La Unión de Morelos. Enero 10, pag 34-35,2011.

-M. L. Guerrero-González, M. Rodríguez-Kessler, R. Rodrıíguez-Guerra, M. González-Chavira, J. Simpson, F. Sanchez, J. F. Jiménez-Bremont. 2011. Differential expression of Phaseolus vulgaris genes induced during the interaction with Rhizoctonia solani. Plant Cell Reports. 30, 1465-1473.

. -Claudia Díaz-Camino, Padmanaban Annamalai, Federico Sanchez, Aardra Kachroo and Said A Ghabrial. 2011. An effective

virus-based gene silencing method for functional genomics studies in common bean. Plant Methods. 7: 1-16. -Rosana Sánchez-López, David Jáuregui, Noreide Nava, Xóchitl Alvarado- Affantranger, Jesús Montiel, Olivia Santana,

Federico Sanchez, and Carmen Quinto. 2011. Down-regulation of SymRK correlates with a deficiency in vascular bundle development in Phaseolus vulgaris nodules. Plant Cell & Environment 34: 2109-2121.

-Islas-Flores T, Guillén G, Sánchez F, Villanueva MA. 2011. Changes in RACK1 expression induce defects in nodulation and development in Phaseolus vulgaris. Plant Signaling and

Behaviour (addendum) in press. -Tania Islas-Flores, Gabriel Guillén, Xóchitl Alvarado-Affantranger, Miguel Lara-Flores,

Federico Sánchez, and Marco A. Villanueva.2011. PvRACK1 Los-of-Function Impairs Cell Expansion and Morphogenesis in Phaseolus vulgaris L. Root Nodules. MPMI. 24: 819–826.

26

-Juan-Elías Olivares, Claudia Díaz-Camino, Georgina Estrada-Navarrete, Xochitl Alvarado-Affantranger, Margarita Rodríguez-Kessler, Fernando Z. Zamudio, Timoteo Olamendi-Portugal, Yamile Márquez, Luis Servín and Federico Sánchez. 2011. Nodulin 41, a novel late nodulin of common bean with peptidase activity. BMC Plant Biology 11:134.

- Pablo Peláez, Minerva S Trejo, Luis P Iñiguez, Georgina Estrada-Navarrete, Alejandra A Covarrubias, José L Reyes and Federico Sanchez. Identification and characterization of microRNAs in Phaseolus vulgaris by high-throughput sequencing. 2011.BMC Genomics MS: 1788939756184511. Sometido. Innovación* (2010-2011): "Método rápido de selección de DNAs", ha sido otorgada por el IMPI. 2011.

Donativos* (2010-2011): CONACyT. 01/08/2009 al 31/12(2011. Genómica Funcional y Proteómica de la muerte celular programada en las raíces de Phaseollus vulgaris cuando interacciona con microorganismos simbiontes y patógenos. aprobación , duración 3 año(s). Clave del Proyecto 83324/871. -CONACyT otorgado a Alejandra Zayas . $ 100,000 Pesos ($ 100,000 este período) Fecha de Inicio 09/08/2009-09/10/2010. Estudio de la proteína tipo HSP70, relacionada con la respuesta al estrés de proteínas no plegadas en el retículo endoplásmico en Phaseolus vulgaris. Duración 1 año(s). Clave del Proyecto 103160. -DGAPA-UNAM -$ 600 000 Pesos ($ 200000 este período) Fecha de Inicio 04/05/2009. 04/12/ 2011. : El papel de la proteasa extracelular P41 en la defensa y el desarrollo en Phaseolus vulgaris. Duración 3 año(s). Clave del Proyecto IN214909. -International Atomic Energy Agency. Fecha de Inicio 01/02/2011. Donados por. Uso : Transcriptome, gene discovery and functional genomics analysis of nitrogen-fixing root-nodules from Phaseolus vulgaris, Phaseolus acutifolius (tepari bean)and Vigna unguiculata (cowpea) heat and drought tolerant cultivars.. aprobación , duración 3 año(s). Clave del Proyecto 16601/RO. Otras actividades relevantes* (2010-2011): Tipo de Participación : Cuerpos Colegiados -Comité Académico de la Licenciatura en Ciencias Genómicas - Miembro del Executive Board de la International Society of Molecular Plant-Microbe Interactions. -Comisión dictaminadora del Instituto de Ciencias Físicas-UNAM -COMISIÓN DICTAMINADORA DE CIENCIAS AGRÍCOLAS la FES Cuautitlán -Comisión Evaluadora del PAPIIT en el área Ciencias Biológicas y de la Salud -Evaluador externo de la Licenciatura en Biología. Universidad de San Luis Postosí -Revisor de las Revistas: BMC Plant Biology, MPMI, PlosOne, Plant Journal. -Miembro Regular de la Sociedad Mexicana de Bioquímica -Miembro Regular de la Academia Mexicana de Ciencias -Miembro de la Academica de Ciencias de Morelos Premios y Distinciones* (2010-2011): -Fellow of the American Association for the Advancement of Sciences (AAAS). 2011 Otras actividades relevantes* (2010-2011): Se refiere a participación en comités editoriales, comités, consejos, coordinaciones, organización de eventos, etc. *En estos rubros se refiere a actividades realizadas por todos los integrantes del laboratorio, sea o no el LA autor o responsable.

27

Otras actividades relevantes* (2010-2011):

-Revisión de Proyectos del CONACYT -Dos Proyectos de Intercambio Académico. Cooperación Bilateral México-Argentina MINCYT –CONACYT. -Revisión de artículos: PLoS ONE, Plant Journal, Plant Molecular Biology, BMC Plant Biology, J of Experimental Botany. -Comité de Bioseguridad del IBT. -Sinodal en Exámenes de Maestría y Doctorado.

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Grupo Dra. Patricia León (Martes 13, de 9:00 a 9:30 hrs.).

La percepción de azúcares en plantas

Integrantes del Grupo (2010-2011):

- Arturo Gueravara García (Asociado)

- Elizabeth Cordoba (Asociado)

- Josefat Gragorio Jorge (Postdoc)

- Maricela Ramos Vega (Estudiante de Doctorado)

- Susana de la Torre (Estudiante de Doctorado)

- Marel Change (Estudiante de Maestría, vía MEP)

- Jesús López Bucio (Estudiante de Maestría, MAPK)

- Luis Alberto De Luna Valdez (Estudiante Maestría, cloroplasto)

- Carol Martínez (Estudiante de Maestría, Señalización de azucares)

- Ernesto Llamas Pamanes (Estudiante de Licenciatura/ Maestría, cloroplasto)

- Alma Fabiola Bernal (Estudiante de Maestría, señalización de azucares)

- Gabriela Medina (Estudiante de Licenciatura/ Maestría)

- Hamid Texas (Estudiante de Licenciatura)

Resumen

Los azúcares adicionalmente de ser moléculas estructurales y energéticas, funcionan como señales

capaces de modular una variedad de procesos metabólicos y de desarrollo en todos los organismos. El

mecanismo de regulación por azúcares en plantas es complejo, e involucra varias vías de señalización que son

capaces de regular tanto positiva como negativamente la expresión de un número importante de genes. A pesar

de que la regulación por azúcares es un mecanismo central para el crecimiento y el desarrollo de las plantas,

los mecanismos involucrados en este proceso son aún poco entendidos. Uno de los objetivos del laboratorio

desde hace tiempo es conocer el mecanismo de percepción de azúcares e identificar elementos importantes de

éstas vías de señalización. Con este propósito hemos utilizado tanto una estrategia genética, a través del

aislamiento de mutantes, como una estrategia de genética reversa, a partir del análisis de algunos genes

blancos. Nuestro trabajo ha permitido identificar la interconexión entre las vías de azúcares con la de la

hormona ABA. También hemos identificado al factor transcripcional ABI4, como un elemento central de la

percepción de azúcares durante el desarrollo temprano de la planta. Nuestros datos indican que ABI4 es capaz

de funcionar directamente como activador y represor de la expresión de varios genes en respuesta a azúcar.

Entre sus genes blancos se encuentra el mismo gen de ABI4 quien para ser expresado requiere de ser activado

por el mismo. El factor transcripcional ABI4 es expresado de manera prominente durante el desarrollo de la

semilla, exclusivamente en el embrión y su función en estas etapas del desarrollo es poco clara. Nuestros datos

29

recientes han podido demostrar que la expresión de ABI4 es regulada por los factores transcripcionales LEC,

que son factores maestros del desarrollo de la semilla. En particular hemos encontrado que LEC2 activa la

expresión de ABI4. En mutantes lec2 no se observa expresión de ABI4 durante todo el desarrollo de la semilla,

por lo que este factor, en conjunto con el mismo ABI4 paren ser los reguladores centrales de la expresión de

ABI4. De manera interesante hemos corroborado que LEC2 también regula los niveles de ABI4 durante la

germinación de tal manera que las mutantes lec2 son insensibles tanto a la hormona ABA como a azucares, es

decir son gin. De esta forma hemos encontrado otro factor importante en la respuesta de azucares en plantas.

En adición a su regulación transcripcional, estudios funcionales han mostrado que ABI4 es también regulado

postraducionalmente. Esta regulación depende de una región particular de la proteína e involucra una

degradación vía proteosoma que parece estar regulada por señales particulares. Finalmente en esta platica se

presentará la caracterización de la regulación del gen que codifica para un transportador de monosacáridos

(STP1) por azúcares. Este gen es fuertemente reprimido por azúcares a través de una vía independiente de

hexocinasa. y de donde se conocen pocos de los factores que participan.

Titulo de los Carteles:

El estudio de los elementos en cis involucrados en la regulación por glucosa del gen STP1 por glucosa en

Arabidopsis thaliana. Responsable: Elizabeth Cordoba

ABA y Acido Jasmonico participan en el desarrollo de la raíz a través de una cascada de MAP cinasas. Arturo

Guevara

Publicaciones* (2010-2011):

- Padilla, D.,.Cordoba, E., Olivera, T. Sánchez, S., Coello,P., Leon, P., Tiessen, A and .Martínez-Barajas (2010).Heterologous expressionof yeast HXT2 in Arabidopsis thaliana alters sugar uptake carbon metabolism and gene expression leading to glucose tolerance of germinating seedlings. Plant Molecular Biology 72: 631-641.

- Cordoba, E., Porta, H., Arroyo, A., San Roman, C., Medina, L., Rodriguez-Concepción, M. and León, P. (2011) Functional

characterization of the three genes encoding 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate synthase in maize. J. Exp Bot 62:1-16.

-Helena Porta, Gladys Jimenez, Elizabeth Cordoba, Patricia Leon, Joel Kingsolver, Mario Soberon and Alejandra Bravo

(2011) Tobacco plants expressing the Cry1AbMod toxin suppress tolerance to Cry1Ab toxin of Manduca sexta cadherin-

silenced larvae. Insect Biochemistry and Molecular Biology, 41: 513-519.

- Cordoba, E. and León, P. Understanding the mechanisms that modulate the MEP pathway in higher plants. In

Isoprenoid Synthesis in Plants and Microorganisms. Springer Science (In press).

- Méndez-Bravo A, Calderón-Vázquez C, Ibarra-Laclette E, Raya-González J, Ramírez-Chávez E, Molina-Torres

J, Guevara-García AA, López-Bucio J, Herrera-Estrella L (2011) Alkamides Activate Jasmonic Acid Biosynthesis

and Signaling Pathways and Confer Resistance to Botrytis cinerea in Arabidopsis thaliana. PLoS One.

6(11):e27251.

- Saucedo-García M, Guevara-García A, González-Solís A, Cruz-García F, Vázquez-Santana S, Markham JE,

Lozano-Rosas MG, Dietrich CR, Ramos-Vega M, Cahoon EB, Gavilanes-Ruíz M. (2011) MPK6, sphinganine

and the LCB2a gene from serine palmitoyltransferase are required in the signaling pathway that mediates cell

death induced by long chain bases in Arabidopsis. New Phytol 191(4):943-57.

Tesis Concluidas* (2010-2011):

30

Jesús López Buceo Maestría en Ciencias Bioquímicas Nov 2011 Dilucidación de una cascada de señalización

de MAP cinasas que participan en el desarrollo del embrión y del sistema radical de Arabidopsis.

Alma Hernández Bernal Maestría en Ciencias Octubre 2011 Análisis transcripcional del gen ABI4 durante la

embriogénesis de Arabidopsis thaliana y de su posible ortólogo en Teobroma.

Docencia* (2010-2011): Se refiere a cursos en licenciatura, posgrado, servicios sociales, estancias,

entrenamientos, etc.

- Curso de Biología Molecular Arturo Guevara y Elizabeth Cordoba - Cuerso de Biología Celular Patricia León - Curso de Biología Molecular de Plantas Patricia León, Arturo Guevara y

Elizabeth Cordoba - Taller Facultad de Ciencias Patricia León -

Donativos* (2010-2011):

- CONACYT 2010- 2013 Responsable Patricia León - DGAPA 2010-2013 Responsable Patricia León - CONACYT 2010-2013 Responsable Arturo Guevara - DGAPA 2010-2013 Responsable Arturo Guevara - CONACYT 2011-2014 Responsable Elizabeth Cordoba - PAPSA 2011-2014 Responsable Elizabeth Cordoba

Otras actividades relevantes* (2010-2011):

Editor de Plant Cell

Editor Frontiers in Plant Physiology

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Grupo Dr. Omar Pantoja (Martes 13, de 9:30 a 10:00

hrs.).

Omar Pantoja Ayala

TÍTULO DE LA PLÁTICA: Regulación de la actividad del transportador de Na+ OsHKT1;3 del arroz

INTEGRANTES DEL GRUPO (2010-2011):

Dra. Bronwyn J. Barkla

Dra. Rosario Vera Estrella

Dr. Armando Bravo García

Dr. Vadim Pérez Koldenkova

Dr. Julio Amezcua Romero

M.C. Paul Rosas Santiago

M.C. Josué Reyes Aguilar

M.C. Carlos Ortíz Ramírez

M.C. Marcela Hernández Coronado

Delia Angélica Narváez Barragán

María Fernanda Gómez Méndez

RESUMEN

La superfamilia de transportadores de K+ ocurre en todos los organismos, con excepción de los animales y

pueden funcionar como simportadores Na+/K

+ (TaHKT2;1 en trigo y OsHKT2;2 en arroz y posiblemente la sub-

unidad KtrB del sistema KtrAB en bacterias); transportadores de Na+ (AtHKT1 en A. thaliana y OsHKT2;1 en

arroz); simportadores H+/K

+ (Trk2 en hongos y la subunidad TrkH del sistema Trk en procariotes), entre otros.

En plantas, los transportadores HKT se han identificado como mecanismos que participan en tolerancia a la

salinidad al realizar la exclusión del Na+ del xilema o mediante su recirculación desde las partes aéreas hacia

las raíces, a lo largo del floema. En los últimos años hemos trabajado sobre la caracterización de los

transportadores HKT presentes en el arroz, y en particular en OsHKT1;3, un mecanismo altamente selectivo y

de baja afinidad por Na+. Estos estudios los hemos ampliado estudiando la posible regulación de este

transportador a nivel transcripcional y post-traduccional. Análisis de la expresión del transcrito o manipulación

de los mecanismos defosforilación/defosforilación, cambios en el pH intra y extracelular, así como inhibidores de

canales iónicos no afectaron la actividad del transportador cuando este se expresó en ovocitos de Xenopus. En

busca de otros mecanismos de regulación, se estudio la posible participación de interacciones proteína/proteína

empleando el sistema de la ubiquitina dividida (mbSUS), especialmente diseñado para analizar este tipo de

interacciones entre proteínas de membrana. Estos estudios demostraron que los transportadores HKT del arroz

aparentemente no forman homo o hetero-oligomeros entre ellos o establecen interacciones con algunas cinasas

de proteínas de la familia CIPK (Calcineurin Interacting Protein Kinases). El muestreo de una librería de

proteínas de membrana de A. thaliana con las proteínas HKT del arroz en el mbSUS permitió identificar 151

posibles interacciones, de las cuales 19 fueron comunes entre los tres HKT empleados. De estas, se han

analizado dos y una de ellas, el ortólogo del cornichon 1 del arroz (OsCNIH1) se ha comprobado mediante el

mbSUS que interactúa con OsHKT1;3 y que su co-expresión en los ovocitos de Xenopus resulta en la inhibición

32

de las corrientes de Na+. Estos resultados sugieren que OsCNIH1 actúa como un regulador negativo del

transporte de Na+ que realiza OsHKT1;3 en el arroz.

TITULO DE LOS CARTELES:

Functional characterization of the bean ammonium transporter PvAMT1;1. Carlos Ortiz Ramírez, Ivonne Mora,

Enrique Rudiño, Omar Pantoja

PUBLICACIONES:

Vera-Estrella R, Barkla BJ, Amezcua-Romero JC, Pantoja O (2011) Day/Night Regulation of Aquaporins During

the CAM Cycle in Mesembryanthemum crystallinum. Plant Cell and Environment (En prensa).

Ortiz-Ramirez, C., Mora, S.I., Trejo, J. and Pantoja, O. (2011) PvAMT1;1, a highly selective ammonium

transporter that functions as an H+/NH4

+ symporter. J. Biol. Chem. 286: 31113–31122

Amezcua-Romero, J.C., Pantoja, O. and Vera-Estrella, R. (2010) Ser123 is essential for the water channel

activity of McPIP2;1 from Mesembryanthemum crystallinum. J. Biol. Chem. 285:16739-16747.

Barkla, BJ and Pantoja, O. (2010) Plasma Membrane and Abiotic Stress Eds. A. Murphy, W. Peer, B. Schulz.

Plant Cell Monographs Vol. 19. Springer, Heidelberg, Germany. pp 457-470.

Vera-Estrella R. Bohnert HJ. (2010) Multiple Physiological Roles of Plant Aquaporins – requirement for a large

Gene Family In The plant Plasma Membrane. Eds. Murphy A. Peer W. and Schulz B. Plant Cell Monographs.

Vol. 19 Springer, Heidelberg, Germany. pp 193-222

TESIS CONCLUIDAS:

Julio Cesar Amezcua Romero. 2011. “Estudio de la distribución, función, expresión y regulación de la

acuaporina McPIP4;1 de Mesembryanthemum crystallinum en respuesta al estrés osmótico y salino”. Doctorado

en Ciencias Bioquímicas. Junio 2011.

Carlos Ortiz Ramírez. Análisis del mecanismo de activación por protones del transportador PvAMT1;1 del frijol.

Maestría, 13 diciembre, 2010.

Marcela Hernández Coronado. Determinación de la asociación de las enzimas aldolasa y enolasa con la V-

ATPasa y de su participación en la respuesta a estrés salino en Arabidopsis thaliana. Maestría, 6 Diciembre,

2010.

Isaac Rodríguez Sánchez. Análisis funcional del transportador OsHKT2;1 del arroz expresado en plantas

mutantes athkt1;1 de Arabidopsis thaliana. Licenciatura, 8 septiembre, 2010

DOCENCIA:

Se participo en los Cursos de Biología Celular (BB, OP y RVE) y Biología Vegetal (OP y RVE); se coordino el

Tópico: La membrana plasmática de células vegetales (BB y OP) en el IBT y en el curso Proteínas y

Proteómica (BB y RVE) en el CCG. Coordinación de los cursos de Biología Celular y Biología Vegetal de

Maestría y Doctorado del programa de Bioquímica, sede Instituto de Biotecnología/UNAM (RVE).

33

DONATIVOS:

DGAPA IN218308 (OP)

CONACYT 79191 (OP)

DGAPA IN212410 (BB)

CONACYT 49735 (BB)

DGAPA IN203711 (RVE) CONACYT 57685 (RVE) DGAPA IN221308 (RVE)

OTRAS ACTIVIDADES RELEVANTES

Comité Organizador:

IV Simposio de Espectrometría de Masas Proteómica Celular y Molecular, Hotel Presidente, Puebla, Puebla 8-

11 Nov, 2011. (BB y RVE)

Joint European Bioinformatics Institute/Sociedad Mexicana de Proteomica Bioinformatics RoadShow –

Bioinformatics for Proteomics, CCG, UNAM, Cuernavaca 2-6 Mayo, 2011. (BB y RVE)

3rd

Pan-American Plant Membrane Biology Workshop, Hotel Presidente, Puebla, Mexico, Enero 2010. (OP, BB

y RVE)

Associate Editor Frontiers in Plant Transport and Trafficking (BB)

Associate Editor Frontiers in Plant Physiology (OP)

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Grupo Dr. Joseph Dubrovsky (Martes 13, de 10:00 a

10:30 hrs.).

Paradoja de la acción dual de la auxina durante la iniciación de raíces laterales en Arabidopsis thaliana.

Joseph Dubrovsky INTEGRANTES DE GRUPO 2010-2011 Investigadores: Dra. Svetlana Shishkova Técnicos M. en C. Selene Napsucialy Mendivil Posdocs Dra. Yamel Sonia Ugartechea Chirino (becaria de CONACyT, Enero a Mayo de 2010, becaria de DGAPA, Junio 2010 a Diciembre de 2011). Dr. Jun-Cheol Moon (becario de la SRE, Abril a Diciembre de 2011). Estudiantes de Licenciatura Hector Hugo Torres Martínez Norma Elizabeth Moreno Anzúrez Mayra Liliana Lopez Valle Dulce Ibett Arenas Reyes Anallely Patiño Castillo Laura Elisa Villavicencio Bahena Carlos Alfonso Sierra Sarabia Kristel Melanie Salgado (Estancia temporal) Paulina Cobián Sánchez (Servicio Social) Estudiantes de Maestría Biol. Ramces De Jesús García, Q.F.B. María Dolores Gutiérrez Alanís Biol. Raquel Sánchez Izquierdo Estudiantes de Doctorado M. C. Alejandra Hernández Barrera Biol. Blanca Jazmín Reyes Hernández Personal Administrativo Jesús Moreno Mercado Mario Roberto Cruz Jarillo Juana Maricela Izquierdo Cabrera RESUMEN DE LA PLÁTICA: La arquitectura del sistema radical es el resultado integral de procesos continuos de la iniciación, formación y emergencia de las raíces laterales (RLs). La auxina es una hormona clave involucrada en el desarrollo del sistema radical. Encontramos que la zona de mínima respuesta transcripcional y mínima concentración de auxina, localizada entre los gradientes distal y proximal en la parte apical de la raíz, define una ventana de desarrollo durante la cual ocurre la iniciación de los primordios de RLs (PRLs). En esta ventana de desarrollo, las células del periciclo que dan origen al PRL, tienen máxima competencia para este proceso. Las células fuera de la ventana no pierden la competencia de formar el PRL, pero pueden formar el PRL solamente

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después de tratamiento con auxina externa. Cuando las células del periciclo están bloqueadas genéticamente o farmacológicamente, pierden la capacidad de formar el PRL de manera irreversible. Previamente demostramos que la auxina puede actuar como señal parecida al morfógeno. Gradientes de auxina definen una zona donde ésta actúa como un disparador morfogenético para la formación de PRLs. Por lo tanto, de acuerdo con el concepto dominante durante los últimos 75 años, la auxina actúa como promotora del desarrollo del sistema radical. Paradójicamente, nosotros también encontramos que la aplicación de auxina externa en un rango de concentraciones de nM, las cuales no detienen por completo el crecimiento de la raíz primaria, también actúa como un inhibidor potente de la iniciación de PRLs. Las mutantes en transporte (aux1-7 and eir1/pin2) y en la percepción (tir1-1) de auxina son resistentes a esta acción inhibitoria de auxina tanto en los procesos de iniciación de PRLs como en la elongación celular. Esto indica que, en la raíz intacta, el transporte y la percepción de auxina son requeridos no solamente para inducir, sino también para inhibir la iniciación de las LRs. Ésta acción dual es parte de un mecanismo complejo involucrado en el control de la arquitectura del sistema radical en plantas.

TITULOS DE LOS CARTELES: Expresión diferencial de genes durante el agotamiento del meristemo de la raíz primaria del cardón Pachycereus pringlei (Cactaceae). (Presentado por Svetlana Shishkova) La mutante de Arabidopsis thaliana en una isoforma de folilpolyglutamato sintetasa está afectada en el mantenimiento del meristemo apical de la raíz (Presentado por la estudiante de doctorado Blanca Jazmín Reyes Hernández) PRODUCTIVIDAD PRIMARIA Publicaciones (con miembros de grupo; con Estudiantes; en colaboraciones externas) 1. Ivanchenko M.G., Napsucialy-Mendivil S., Dubrovsky J.G., 2010. Auxin-induced inhibition of lateral root initiation contributes to the root system shaping in Arabidopsis thaliana. Plant Journal, 64: 740–752. IF 6.946 2. Ugartechea-Chirino,Y. Swarup,R. Swarup,K. Peret,B. Whitworth,M. Bennett,M., Bougourd,S. 2010. The AUX1 LAX family of auxin influx carriers is required for the establishment of embryonic root cell organization in Arabidopsis thaliana Ann Bot., 105, 277-289 IF 3.501 3. Dubrovsky J.G., Napsucialy-Mendivil S., Duclercq J., Cheng Y., Shishkova S., Ivanchenko M., Friml J, Murphy A.S., Benková E. 2011. Auxin minimum defines a developmental window for lateral root initiation. New Phytologist, 191: 970–983. IF 6.516 4. Hernández-Barrera A., Ugartechea-Chirino Y.S., Shishkova S., Napsucialy-Mendivil S., Soukup A., Reyes-Hernández B.J., Lira-Ruan V., Dong G. and Dubrovsky J.G. Apical meristem exhaustion during determinate primary root growth in the moots koom 1 mutant of Arabidopsis thaliana. Planta, 234:1163-1177. IF 3.0984. 5. Dubrovsky J. G. and Forde B. G. Quantitative analysis of lateral root development: pitfalls and how to avoid them Plant Cell, en prensa. IF 9.396 TESIS CONCLUIDAS (JD) A. Hernández Barrera, tesis de doctorado, 19 de Septiembre de 2011 (JD) M. D. Gutiérrez Alanís, tesis de maestría, 25 de Junio de 2010 (JD) R. De Jesús García, tesis de maestría, 17 de Noviembre de 2011

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(SS) N.E. Moreno Anzúrez, tesis de licenciatura, 19 de Febrero de 2010. (SS) M. L. López Valle, tesis de licenciatura, 7 de Diciembre de 2011. (SS) A. Patiño Castillo, tesis de licenciatura, Diciembre de 2011. (YSUC) D.I. Arenas Reyes, tesis de licenciatura, 31 de Marzo de 2010 (AHB) L. E. Villavicencio Bahena, tesis de licenciatura, 18 de Febrero de 2010. DOCENCIA (JD) Participación en 2 cursos de Posgrado en ciencias BQ, UNAM y en Comités Tutorales de 8 estudiantes de Maestría y Doctorado; participación como miembro de jurado en 4 exámenes de estudiantes de Posgrado (sin considerar los estudiantes de laboratorio). (SS) Participación en 3 cursos de Posgrado en ciencias BQ, en 2 cursos de Licenciatura (FC UAEM), en Comités Tutorales de 4 estudiantes de Maestría y Doctorado, miembro de jurado de 2 exámenes de estudiantes de Posgrado y 1 de Licenciatura. (YSUC): Participación en 1 curso, nivel de Licenciatura (FC UAEM). (AHB): Participación en 1 curso de posgrado (FQuímica, UNAM); 1 curso, nivel de Licenciatura (FC UAEM); 1 curso, nivel Preparatoria (Tec. De Monterrey). (BJRH): Participación en 1 curso, nivel de Licenciatura (FC UAEM). DONATIVOS (JD) 2007-2010, Proyecto financiado por SEP-CONACyT: “Caracterización y mapeo genético de las mutantes de Arabidopsis thaliana afectadas en el desarrollo del sistema radical” (No. 49267). Monto total: $1,499,236.00 2009-2011, Proyecto financiado por DGAPA, UNAM (IN212009) “Desarrollo de la raíz lateral en Arabidopsis thaliana: análisis a nivel genético y celular.” Monto: $600,000.00 2011-2014, Proyecto financiado por SEP-CONACyT: “Caracterización y mapeo genético de las mutantes de Arabidopsis thaliana afectadas en el desarrollo del sistema radical: Parte II” (No. 127957). Monto: $1,300,000.00 (SS) 2009-2011, Proyecto financiado por SEP-CONACyT, 79736: “Caracterización de la expresión diferencial de genes en las etapas inicial y terminal del crecimiento determinado de la raíz de cactáceas desérticas”. Monto: $550,000. 2009-2010, Proyecto financiado por CONACyT, 102285 (“SNI-estudiantes de licenciatura”): “Caracterización de algunos genes involucrados en el crecimiento determinado de la raíz de las cactáceas desérticas”. Monto: $42,500. 2009-2011, Proyecto financiado por DGAPA - UNAM, IN212509: “Análisis del crecimiento determinado de la raíz en cactáceas”. Monto: $599,000.00.

37

PREMIOS Y DISTINCIONES (JD) Desde 2010, El Miembro Asociado de FACULTY of 1000 Participación como revisores en las revistas: (JD) 2010, The Plant Journal, Journal of Plant Physiology, Annals of Botany. 2011, PLANT CELL, Plant Physiology, BioMED Central PLANT METHODS. (SS) 2010, Planta, Plant Growth Regulation, Botanical Studies. Otras actividades relevantes (JD) Miembro de Comité Científico de 7

th International Symposium on Structure and Function of Roots, Nový

Smokovec, Slovakia, September 5-9, 2011.

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Grupo Dr. Luis Covarrubias (Martes 13, de 12:15 a 12:45

hrs.).

Título de la Plática:

Entender para curar: los enigmas de algunas enfermedades humanas en modelos animales.

Integrantes del Grupo (2010-2011):

Laboratorio sobre Degeneración y Regeneración Tisular

Investigadores

Luis F. Covarrubias Robles

Susana Castro Obregón

Christopher Wood

Asistentes de investigación

Concepción Valencia García (diferenciación neural, señalización)

Rayo Sánchez Carbente (muerte celular, autofagia)

Posdoctorados

Celina García Meléndez (regeneración, cáncer, células troncales)

Estudiantes Licenciatura

Elizabeth Ortiz Gutiérrez (LC; células troncales; biología de sistemas)

Ximena Ibarra Soria (LC; células troncales, reprogramación)

Sara Albarrán (CW; genes reporteros, fluorescencia)

Saúl Rojas (CW; genes reporteros, luminiscencia)

Norman Lot Frausto Ruiz (SC; muerte celular, autofagia)

Ana Paulina de las Peñas Rincón (SC; autofagia)

Wendy Villamizar Gálvez (SC; muerte celular, autofagia)

Estudiantes Maestría

Damaris Anell Rendón (SC; muerte celular, regulación metabólica)

Gabriela Zárraga Granados (SC; muerte celular, autofagia)

39

Elida Amaya Vicente (LC; células troncales, diferenciación)

Luz Adriana Vega Cabrera (LC; muerte celular, morfogénesis)

Aimée Bastidas Ponce (CW; células troncales, genes reporteros)

María Concepción (CW; células troncales, diferenciación neural)

Francisco Castillo Castellanos (SC; muerte celular, autofagia)

Daniel Alberto Fuentes (CW; genes reporteros, transcripción)

Estudiantes Doctorado

Rocío Hernández Martínez (LC; muerte celular, morfogénesis)

Niurka Trujillo Paredes (LC; diferenciación neural, señalización)

Gilda Guerrero Flores (LC; células troncales, diferenciación neural)

José Raúl Pérez Estrada (LC; estrés oxidativo, regulación metabólica)

Personal Administrativo

Minerva Carcaño Velázquez (Secretaria)

Lorena Salazar Arroyo (Laboratorista)

Cruz Elena Martell Lugo (Auxiliar)

Resumen de la plática:

Diversas enfermedades que afectan al humano resultan de alteraciones en procesos biológicos que pueden

originarse en el embrión en desarrollo y/o a lo largo de la vida adulta. La degeneración celular en combinación

con la aparente limitada capacidad de renovación/regeneración de los tejidos adultos resultan en padecimientos

que limitan funciones básicas como las metabólicas, motoras y cognitivas. En contraste, la pérdida en el control

de la renovación de tejidos puede derivar en multitud de tipos de cánceres que si no se tratan adecuadamente

conllevan a la muerte. Otro tipo de padecimientos pueden impedir el funcionamiento de células maduras

causando deficiencias sistémicas o asociadas a un órgano en particular. Desde otro punto de vista, el desarrollo

de procedimientos terapéuticos efectivos está directamente relacionado al conocimiento disponible de las

causas de la enfermedad. Regenerar un tejido perdido depende de si éste tiene un reservorio de células

troncales y/o si el entorno es adecuado para la diferenciación celular. Identificar la fuente de células que permita

reparar un tejido puede ser una limitante fundamental en muchos casos. La efectividad para eliminar células

cancerosas, por otro lado, puede beneficiarse de qué tanto sabemos sobre la célula troncal cancerosa y los

genes afectados, al igual que de los mecanismos que las células utilizan para auto-eliminarse naturalmente.

Fallas en el funcionamiento celular requiere conocer la célula afectada y también la alteración metabólica o en

la señalización celular.

Nuestro laboratorio, en el afán de entender procesos del desarrollo y regeneración, se ha visto inmerso

en el estudio de varias enfermedades humanas, algunas de especial relevancia para la población mexicana

como lo son el cáncer cérvico-uterino y la diabetes/obesidad. Nuestro enfoque es asociar la enfermedad con

procesos que naturalmente ocurren en el organismo. En este mismo contexto, hemos estado estudiando los

límites de la capacidad regenerativa de los tejidos adultos, lo que ha implicado tanto identificar células troncales

40

adultas como explorar si existen condiciones permisivas o instructivas para la diferenciación específica, ambos

aspectos fundamentales para definir estrategias terapéuticas para tratar enfermedades neurodegenerativas

como la Enfermedad de Parkinson.

La terapia celular depende cada vez más de la caracterización de células troncales y los mecanismo

específicos de especificación y diferenciación. Los próximos años nos esforzaremos por valorar la plasticidad

celular estimada por la capacidad de las células para reprogramar su genoma en respuesta a factores internos

y externos.

Titulo de los Carteles:

1. Development of multicolour luciferase-based reporters for dynamic imaging of morphogen expression during dopaminergic neuron specification. Christopher Wood.

2. La autofagia como mecanismo comun entre la muerte celular, el metabolismo, la estabilidad del genoma y la longevidad. Susana Castro.

Publicaciones (2010-2011):

Artículos

1. Hernández-García D, Wood CD, Castro-Obregón S, Covarrubias L. Reactive oxygen species: A radical role in development? Free Radic Biol Med. 2010 Jul 15;49(2):130-43.

2. Baizabal JM, Valencia C, Guerrero-Flores G, Covarrubias L. Telencephalic neural precursor cells show transient competence to interpret the dopaminergic niche of the embryonic midbrain. Dev Biol. 2011 Jan 15;349(2):192-203.

3. Hernández-Martínez R, Covarrubias L. Interdigital cell death function and regulation: new insights on an old programmed cell death model. Dev Growth Differ. 2011 Feb;53(2):245-58.

4. Baizabal JM, Cano-Martínez A, Valencia C, Santa-Olalla J, Young KM, Rietze RL, Bartlett PF, Covarrubias L. Glial Commitment of Mesencephalic Neural Precursor Cells Expanded as Neurospheres Precludes Their Engagement in Niche-Dependent Dopaminergic Neurogenesis. Stem Cells Dev. 2011 Jul 6.

5. Ocadiz-Delgado R, Castañeda-Saucedo E, Indra AK, Hernandez-Pando R, Flores-Guizar P, Cruz-Colin JL, , Recillas-Targa F, Perez-Ishiwara G, Covarrubias L, Gariglio P. RXRα deletion and E6E7 oncogene expression are sufficient to induce cervical malignant lesions in vivo. Cancer Lett. 2011 Nov 29. In press.

6. Cuervo R, Hernández-Martínez R, Jesús Chimal-Monroy, Merchant-Larios H, Covarrubias L. Full regeneration of the tribasal Polypterus fin. Proc Natl Acad Sci U S A. Accepted

7. Guerrero A, Carneiro J, Pimentel A, Wood CD, Corkidi G, Darszon A “Strategies for locating the female gamete: the importance of measuring sperm trajectories in three spatial dimensions” Molecular Human Reproduction 2011 17(8) 511-523

8. Espinal J, Aldana M, Guerrero A, Wood CD, Darszon A, Martinez-Mekler G. Discrete Dynamics Model for the Speract-Activated Ca2+ Signaling Network Relevant to Sperm Motility”. PLOS One 2011 6(8):e22619

9. Spiller D.G., Wood CD, Rand D.A., White M.R.H. (2010) Measurement of single-cell dynamics Nature 2010 465:736-745

10. Guerrero A, Nishigaki T, Carneiro J, Tatsu Y, Wood CD*, Darszon A. Tuning sperm chemotaxis by calcium burst timing. Dev Biol 2010 344:52-65

11. Alberto Valbuena, Susana Castro-Obregón and Pedro A. Lazo (2011). Downregulation of VRK1 by p53 in response to DNA damage is mediated by the autophagic pathway. PLOS ONE 6(2):e17320.

12. Castro-Obregón, S. (2010) The discovery of lysosomes and autophagy. Nature Education 2010 3(9):49.

Capítulos en libros

41

1. Gilda Guerrero-Flores and Luis Covarrubias (2011). Dopaminergic Differentiation Potential of Neural Precursor Cells Derived from Embryonic Stem Cells, Embryonic Stem Cells: The Hormonal Regulation of Pluripotency and Embryogenesis, Craig Atwood (Ed.), ISBN: 978-953-307-196-1, InTech.

2. Hernandez-Martinez, R. and Covarrubias, L. (2012) Detection of cells programmed to die in mouse embryos. In: Mouse Molecular Embryology. (Lewandoski, M. Ed.), Springer. In press.

3. Raymond A. Swanson and Susana Castro-Obregon. “Cell Death”. Encyclopedia of the Neurological Sciences, Academic Press, 2011 (NYP)

4. Susana Castro Obregón (2012). Autofagia en el proceso de envejecimiento. Aspectos Moleculares del Envejecimiento. Editado por el Instituto Nacional de Geriatría, México.

Tesis Concluidas (2010-2011):

1. Georgina Peñalosa Ruíz. Efectos epigenéticos inducidos por extrés oxidativo en fibroblastos embriónicos de ratón. Licenciatura, Facultad de Ciencias. (LC)

2. Paula Rubio Alvarado. Construcción de vectores para expresión de sensores genéticos fluorescentes para el Ca2+ y el peróxido y su comprobación en células mamíferas en cultivo. Licenciatura, Facultad de Ciencias. (CW)

3. Elizabeth Ortiz Gutiérrez. Comprendiendo la División Celular Asimétrica como un mecanismo de diferenciación analizando la red de interacciones entre proteínas. Licenciatura, Ciencias Genómicas. (LC)

4. Ximena Ibarra Soria. Analizando bases de datos de células troncales embriónicas en diferenciación neural para determinar los genes que se expresan diferencialmente en precurosres neurales y neuronas (Opcional). Licenciatura, Ciencias Genómicas. (LC)

5. Gabriela Zárraga Granados. Consecuencias funcionales de la SUMOilación del receptor nuclear Nur77. Maestría, Posgrado en Ciencias Bioquímicas. (SC)

6. Dámaris Anell Rendón. Estudio del mecanismo por el cual el receptor nuclear Nur77 modula la autofagia. Maestría, Posgrado en Ciencias Bioquímicas. (SC)

7. Rocío Hernández Martínez. Morfogénesis de la extremidad: funciones del FGF8 y del ácido retinoico durante la activación de la muerte celular interdigital. Doctorado, Posgrado en Ciencias Bioquímicas. (LC)

Docencia (2010-2011):

1. Curso Básico de Biología Celular, Posgrado en Ciencias Bioquímicas, UNAM. SC, Coordinadora y particpante; LC, participante; CW, participante.

2. La Biología del Desarrollo en la Era Genómica, Facultad de Ciencias (Biología), UNAM. LC, ponente. 3. La Biología a partir de las biomoléculas: nuevos paradigmas y aplicacions. Facultad de Ciencias

(Biología). Taller imapartido desde el 2000 hasta la fecha. LC, CW y SC, participantes. 4. Tópico selecto “Células troncales”, Posgrado en Ciencias Bioquímicas. Responsables LC y CG;

Coordinadora GG. 5. Curso de Biología Celular en el Doctorado en Ciencias de la Universidad Autónoma del Estado de

Morelos. SC, participante.

Donativos (2010-2011):

1. DGAPA IN225910 (LC) 2. CONACYT SALUD-2005-01-14609 (LC) 3. CONACYT SEP-131031 (LC) 4. IMPULSA 02 (LC) 5. CONACYT SEP-132478 (CW) 6. DGAPA IN223810 (CW) 7. DGAPA IN221909-3(SC) 8. CONACYT SEP-106598 (SC)

42

9. Alexander von Humboldt Foundation (SC)

Premios y Distinciones (2010-2011):

Alexander von Humboldt Fellow (SC)

Otras actividades relevantes (2010-2011):

1. 3rd Latin American Course: Embryonic Stem Cells as a Model for Embryonic Development, - Cuernavaca, Morelos, Mexico. Organizadores (LC, SC & CW)

2. Comisión Permanente de Ingreso y Egreso del Posgrado (CPIEP) en Ciencias Bioquímicas (SC) 3. Representante de académicos en Consejo Interno (SC) 4. Miembro del Comité Evaluador del Sistema Nacional de Investigadores, Área II (2009-2010)

43

Grupo Dr. Mario Zurita (Martes 13, de 12:45 a 13:15

hrs.).

Título de la Plática:

TFIIH y sus problemas existenciales: los complejos del complejo.

Integrantes del Grupo (2010-2011):

Investigadoras:

Dra. Martha Vázquez

Dra. Viviana Valadez

Dra. Denhi Schanbel

Estudiantes de doctorado:

Zoraya Palomera

Claudia Villicaña

Mariana Herrera

Grisel Cruz

Juan Luis Moribot

Brenda López

Cinthya Gurrión

Carlos Flores

Estudiantes de Maestría:

Alyeri Bucio

Silvia Meyer

Mandy Juárez

Dabne Ibarra.

Personal Adm.

Minerva Calcaño

Carmen Muñoz

44

Silvia Velázquez

Resumen de la plática: (máximo 500 palabras).

El complejo de reparación/transcripción TFIIH participa en 3 procesos fundamentales que son la reparación por

excisión de nucleótidos, la trasncripción por RNA pol II y RNA pol I y en el control del ciclo celular. En esta

ocasión presentaremos los resultados que involucran la interacción funcional de TFIIH con otros factores

celulares y describiremos posibles nuevos papeles de TFIIH en otras funciones en la célula. Usando a

Drosophila como modelo hemos encontrado que la subunidad p52 de TFIIH interacciona física y funcionalmente

con p53. La reducción de los niveles de TFIIH en el disco imagal de ala generan reducción de la proliferación

celular, defectos en diferenciación y reducción del tamaño celular. Parte de estos fenotipos son debidos a un

incremento importante de la apoptosis durante el desarrollo del ala. Una de las causas de la inducción de

apoptosis parece ser la generación de aberraciones cromosomales. Cuando p52 y p53 son afectados al mismo

tiempo hay un incremento en los defectos que se observan en las alas adultas y esto es debido a que en lugar

de disminuir la apoptosis por la falta de p53 esta aumenta. Sin embargo esta apoptosis es dependiente de

caspas, pero parece ser independiente de la vía de JNK. En este momento estamos analizando otras

posibilidades. Por otro lado, hemos demostrado que p52 y p53 interaccionan directamente aun en ausencia de

daño al DNA.

En Drosophila la subunidad p8 de TFIIH se encuentra codificada en un transcrito bicistrónico con la subunidad

Swc6/p18 del complejo remodelador de la cromatina SWR1/SRCAP. Usando estrategias de genética,

bioquímica y biología molecular hemos encontrado que Sw6/p18 interacciona físicamente in vitro e in vivo con

p52 y funcionalmente con TFIIH. Estos resultados sugieren una inter-conexión funcional entre TFIIH y un

complejo remodelador de la cromatina. Por otro lado hemos analizado la distribución durante el desarrollo de

las subunidades p8 y p52 así como el efecto de mutaciones en estas subunidades en el desarrollo temprano y

la espermatogénesis. Contrario a lo que hemos observado con otras subunidades de TFIIH, p8 es nuclear

durante todas las fases del ciclo celular del blastodermo sincicial. Durante la interfase y profase esta unida a los

cromosomas, pero se desprende de estos durante la metafase y se vuelve a unir a los cromosomas en la

anafase y telofase. Interesantemente la ausencia de p8 en este estado del desarrollo genera defectos en la

mitosis que sugieren un papel de esta subunidad de TFIIH en este proceso. Durante la espermatogénesis p8 y

p52 se localizan en el núcleo de casi todas las diferentes etapas, pero en espermatocitos primarios se

concentran en la periferia del nucléolo y en las cromatidas hermanas que es el paso anterior a la entrada de la

meiosis. Interesantemente, las mutaciones en p8 y p52 detienen la espermatogénesis en la fase de

espermatocitos primarios. Todos estos datos sugieren un papel para p52 y p8 en mitosis y meiosis en

Drosophila.

Titulo de los Carteles: Mínimo 1, máximo 2, especificando el, la o los responsables de la presentación del

mismo.

Poster 1:

ATRX durante el desarrollo embrionario del pez cebra (Danio rerio)"

Presentado por Denhi Schnabel y Dabne Ibarra,

Poster 2:

Localización y función de Tonalli A, una proteína trithorax que interacciona genéticamente con el

complejo Brahma.

45

Presentado por Martha Vázquez y Juan Luís Moribot.

Publicaciones*(2010-2011):

PALOMERA-SANCHEZ Z, BUCIO-MENDEZ A, VALADEZ-GRAHAM V, REYNAUD E, ZURITA M. (2010)

DROSOPHILA P53 IS REQUIRED TO INCREASE THE LEVELS OF THE DKDM4B DEMETHYLASE AFTER

UV-INDUCED DNA DAMAGE TO DEMETHYLATE HISTONE H3 LYSINE 9. J BIOL CHEM. 285(41):31370-9.

ZORAYA PALOMERA-SANCHEZ AND MARIO ZURITA (2011) OPEN, REPAIR AND CLOSE AGAIN:

CHROMATIN DYNAMICS AND THE RESPONSE TO UV-INDUCED DNA DAMAGE, DNA- REPAIR 10, 119-

125.

RENE HENANDEZ-VARGAS1, LUIS FONSECA-ORNELAS

1, IGNACIO LOPEZ-GONZALEZ

1, JUAN REISGO-

ESCOVAR2, MARIO ZURITA

1 AND ENRIQUE REYNAUD

1*. (2011) RECIPROCAL SUPPRESSION OF

NEUROTOXICITY OF SYNPHILIN-1 AND ALPHA-SYNUCLEIN IN A DROSOPHILA MODEL OF

PARKINSON´S DISEASE. (GENESIS, 49(5):392-402).

SANDRA REYES-CARMONA,VIVIANA VALADEZ-GRAHAM, JAVIER AGUILAR-FUENTES, MARIO ZURITA,

ALFONSO LEON DEL RIO, (2011) TRAFFICKING AND CHROMATIN DYNAMICS OF HOLOCARBOXYLASE

SYNTHETASE DURING DEVELOPMENT OF DROSOPHILA MELANOGASTER MOLECULAR GENETICS

AND METABOLISM, 103(3):240-8

VIVIANA VALADEZ-GRAHAM1*

, YASUHIDE YOSHIOKA2*

OSCAR VELAZQUEZ1, AKIHITO KAWAMORI

2

VIRGINIA BARAJAS1, MASAMITSU YAMAGUCHI

2 AND MARIO ZURITA (2011) DATRX INTERACTS WITH

DREF IN THE CHROMATIN TO REGULATE GENE EXPRESSION.

Nucleic Acids Res. 2011 Oct 22. [Epub ahead of print]

Sometidos:

YASUHIDE YOSHIOKA, NGUYEN TRONG TUE, SHUNSUKE FUJIWARA, RISA MATSUDA, VIVIANA

VALADEZ-GRAHAM , MARIO ZURITA

AND MASAMITSU YAMAGUCHI (2011) Drosophila transcription factor

DREF acting via the JNK pathway is required for thorax development (Sometido Exp. Cell Research)

Mariana Herrera*, Grisel Cruz*, Claudia Villicaña, Viviana Valadez, Enrique Reynaud and Mario Zurita+.(2011)

Physical and functional interactions between the Swc6/p18 subunit of the SWR1/SRCAP chromatin-remodeling

complex with the transcription factor TFIIH (Sometido a PLoS Genetics).

Innovación*(2010-2011):

Tesis:

Concluidas*(2010-2011):

ZORAYA PALOMERA, DOCTORADO EN CIENCIAS BIOQUÍMICAS (GRADO OBTENIDO EN JUNIO

2011)

Docencia* (2010-2011):

Curso básico de Biología Molecular posgrado en ciencias bioquímicas.

46

Donativos*(2010-2011):

Mario Zurita:

Conacyt ciencia básica 2010-2013.

PAPIIT. 2008-2011.

IXTLI. 2010-2011

Fundación Miguel Alemán. 2010

Martha Vázquez:

CONACyt ciencia básica 2009-2012-

Viviana Valadez:

CONACyT-SNI nivel I 2011-2012

PAPIIT- Inv. Asociado 2011-2012.

PremiosyDistinciones*(2010-2011):

Presidente de la Sociedad latinoamericana de Biología del Desarrollo (2008-2010)

Otras actividades relevantes* (2010-2011):

-MIEMBRO DEL COMITE EDITORIAL, GENESIS: THE JOURNAL OF GENETICS AND DEVELOPMENTAL

BIOLOGY. (2007- ).

-Miembro de la comisión de premios de la AMC. (2010- )

-Miembro de la comisión de Biología en los proyectos de ciencia básica del CONACyT (2011-- )

47

Grupo Dr. Enrique Reynaud (Miércoles 14, de 9:00 a 9:30

hrs.).

Moscas adictas y la genética de la respuesta a la nicotina.

Dr. Enrique Reynaud

Integrantes del Grupo (2010-2011):

Dr. Ignacio López Gonzáles (ahora con la Dra. Claudia Treviño)

M. en C. René Hernández Vargas (Técnico Académico)

María del Carmen Muñoz (Laboratorista)

Silvia Velazquez (laboratorista)

Minerva Carcaño Velazquez (Secretaria)

Dra. Verónica Narváez (Sabático)

Biol. Luis Fonseca Órnelas (Estudiante de Maestría)

Biol. Alejandro González Gallina (Estudiante de Maestría)

Q.F.B. Sandra Zué Villarreal Reyna (Estudiante de Maestría)

M. en C. Iván Sánchez Díaz (Estudiante de Maestría)

Lic. Cuauhtemoc Gómez Barroso (Estudiante de Maestría)

José Emmanuel Peregrina García (Estudiante de licenciatura)

En mi laboratorio estamos interesados en el control genético del comportamiento. Nuestra premisa básica es que los

genes controlan de manera estereotípica la ontología del organismo, incluyendo al Sistema Nervioso Central (SNC). Por

esta razón los SNCs de los distintos individuos de una misma especie son esencialmente idénticos y por lo tanto sus

comportamientos son estereotípicos. En pocas palabras, los genes determinan la arquitectura y la bioquímica del SNC y

estos determinan el comportamiento.

Nuestra aproximación fundamental para entender el control genético del comportamiento consiste en una estrategia de

genética directa (forward genetics) utilizando elementos transponibles de tipo “P enhancer trap GAL4” que nos permite

generar mutaciones insercionales semi-aleatorias en todo el genoma de la mosca de la fruta Drosophila melanogaster.

Esta estrategia marca el sitio de inserción molecularmente, identificando fácilmente al gene dañado. Estos transposones

capturan las secuencias reguladoras del gene mutado permitiéndonos expresar cualquier otro transgén en su patrón

espacio temporal. Utilizando esta tecnología y varios paradigmas conductuales hemos identificado mutantes en procesos

tan diversos como el cortejo sexual y copulación, ovoposición, sensibilidad a estímulos nocivos, procesos neuronales

involucrados en las últimas etapas del desarrollo y en la respuesta a la nicotina.

48

La secuenciación del genoma de Drosophila melanogaster demostró que al menos el 70% de los genes humanos asociados

a síndromes genéticos tienen un homólogo en la mosca. Esto significa que Drosophila puede ser un modelo importante en

aproximadamente el 70% de las enfermedades genéticas humanas. Por otro lado, existe evidencia que en la población

humana, individuos hipersensibles o híper-resistentes a distintas drogas tienen una probabilidad mayor de desarrollar

adicciones. Bajo esta premisa, se ha propuesto que buscar moscas mutantes que presenten fenotipos de hipersensibilidad

o híper-resistencia a drogas consumidas por humanos, puede ser una estrategia viable para identificar genes homólogos

humanos asociados a adicciones. Nosotros hemos desarrollado un protocolo de exposición a nicotina que nos permite

identificar moscas con una sensibilidad alterada a esta droga. Con esta metodología encontramos una inserción del

elemento “P-GAL4” que se insertó en un cluster de micro RNAs (miRNAs), alterando su patrón de expresión, lo que

genera un fenotipo de hipersensibilidad a la nicotina. Este resultado es extremadamente relevante ya que por primera vez

se asocia un fenotipo conductual a la expresión de miRNAs. En esta plática discutiremos el método de selección de dicho

tipo de mutaciones.

Título del cartel:

Efecto de la expresión de alfa-sinucleína y sinfilina en el envejecimiento y el stress oxidativo de Drosophila

melanogaster.

Responsables: Sandra Zué Villarreal y René Hernandez.

Publicaciones 2010-2011:

1) René Hernández-Vargas, Luis Fonseca-Ornelas, Ignacio López-González, Juan Riesgo-Escovar, Mario Zurita and Enrique Reynaud. SYNPHILIN-1 SUPPRESSES A-SYNUCLEIN NEUROTOXICITY IN A PARKINSON´S DISEASE DROSOPHILA MODEL. 2011, Genesis.May;49(5):392-402.

2) Reynaud, E. PROTEIN MISFOLDING AND DEGENERATIVE DISEASES. 2010, Nature

Education 3(9):28.

3) Palomera-Sanchez Z, Bucio-Mendez A, Valadez-Graham V, Reynaud E, Zurita M. DROSOPHILA P53 IS REQUIRED TO INCREASE THE LEVELS OF THE DKDM4B DEMETHYLASE AFTER UV-INDUCED DNA DAMAGE TO DEMETHYLATE HISTONE H3 LYSINE 9. J Biol Chem. 2010, Oct 8;285(41):31370-9.

4) Miranda-Miranda, E. Cossio-Bayugar, R. Quezada-Delgado, Ma.D.R. Sachman-Ruiz, B. Reynaud, E. STAPHYLOCOCCUS SAPROPHYTICUS IS A PATHOGEN OF THE CATTLE TICK RHIPICEPHALUS (BOOPHILUS) MICROPLUS. Biocontrol Science and Technology, 2010, 20, 1055-1067.

Tesis Concluidas* (2010-2011):

Licenciatura:

1) Construcción de genes de fusión que codifican para las proteínas CFP-sinucleína WT y sus versiones mutantes asociadas al mal de Parkinson y YFP-sinfilina para estudios de FRET. Angeles Guadalupe Mayorga López. Para obtener el título de Ingeniero Biotecnólogo. Universidad Autónoma de Chiapas. Noviembre 2010.

49

2) Selección de líneas en Drosophila melanogaster con sensibilidad alterada a nicotina. Víctor Jesús Cancino García. Para obtener el título de Ingeniero Biotecnólogo. Universidad Autónoma de Chiapas. Diciembre 2010.

3) “Caracterización Fenotípica de la perdida de función del gene de HSP27 en Drosophila melanogaster como modelo de la enfermedad neurodegenerativa Marie-Charcot-Tooth. Flor Berenice Ordóñez. Para obtener el título de Ingeniero Biotecnólogo., Universidad Autónoma del estado de Chiapas. Diciembre 2011.

Maestría:

1) “Caracterización de una línea de Drosophila con esterilidad inducible por desactivación de redes neuronales” Alejandro González Gallina. Para nivel de Maestría en Ciencias Bioquímicas. Abril 2011.

Docencia (2010-2011):

1) Participación en el Taller del IBT en la Facultad de Ciencias. 2) Participación en el Curso de Bioquímica del Posgrado en Ciencias Bioquímicas. 3) Participación en el Curso de Biología Molecular del Posgrado en Ciencias Bioquímicas.

Donativos (2010-2011):

1) Donativo de la “Bill and Melinda Gates Foundation” en conjunto con el Dr. Lourival Possani. (2009-2010) “Channel Blockers for Malaria Control”. 2) Donativo CONACYT convocatoria 2009 (2011-2013) Continuación del proyecto “Análisis genético, celular y molecular de los circuitos neuronales involucrados en la percepción y transducción del dolor en Drosophila melanogaster”. 3) Donativo DGAPA (PAPIIT) 2011 “Análisis de la interacción in vivo de Alfa-synucleina y Synfilina-1 mediante

FRET y su relación con el mal de Parkinson usando como modelo a Drosophila melanogaster” .

Otras actividades relevantes (2010-2011):

Miembro del “Regional Committee of the Pew Latin American Fellows Program in Biomedical Sciences” a partir del 2006 hasta el 2011. Presidente (chairman) del “Regional Committee of the Pew Latin American Fellows Program in Biomedical Sciences” a partir del 2008 hasta el 2011.

Director Científico de Biodetecta y de Biohominis S.A. de C.V. (2008-).

50

Grupo Dra. Hilda Lomelí (Miércoles 14, de 9:30 a 10:00

hrs.).

El papel del gen Zimp7 en el desarrollo dorsoventral del pez cebra

Integrantes del grupo

Investigadores:

Hilda Lomelí Buyoli

Enrique Salas Vidal

Técnicos:

Laura Ramírez

Estudiantes:

Angel Flores Alcántar (doctorado)

Héctor Rodríguez Magadán (doctorado)

Roberto Moreno Ayala (doctorado)

Gretel Gorostieta Galicia (maestría)

Dámaris Rodríguez López (maestría)

Adriana González Sandoval (licenciatura)

Brenda Herrera Arcos (licenciatura)

Mario Mendieta Serrano (maestría-E.Salas)

Jerónimo Miranda Rodríguez (licenciatura-D.Schnabel)

Alejandro Priego Espinosa (licenciatura)

Laboratorista:

Dulce Pacheco Benitez

Personal Administrativo:

María de la Paz Colín.

Virginia Ramírez Granados

51

Resumen de la plática

En los últimos dos años hemos consolidado el uso del pez cebra como un modelo para abordar temas de genética

del desarrollo embrionario. En este organismo hemos logrado inactivar la función de distintos genes de manera exitosa y

así determinar su importancia en la embriogénesis. Uno de los proyectos que han dado resultados muy interesantes es el

de la pérdida de función del gen zimp7, del cual voy a presentar nuestros avances en esta ocasión. Zimp7 es una

proteína relacionada con la familia de las proteinas PIAS, la cual se caracteriza por la presencia del dominio llamado SP-

RING. Las PIAS participan en un proceso de modificación postraduccional que se conoce como SUMOilación, que consiste

en la adición covalente de un pequeño péptido llamado SUMO a proteínas específicas. La actividad de las PIAS las define

en términos generales como co-reguladoras de la actividad transcripcional. Por su parte, Zimp7 podría además participar

en la remodelación de la cromatina o regular directamente la expresión genética, según lo indican otras evidencias de

interacción bioquímica, así como el análisis de su secuencia. Los patrones de expresión de Zimp7 en embriones de ratón y

pez cebra son muy dinámicos y pueden asociarse a procesos morfogenéticos. Sin embargo hasta ahora no se sabe nada de

sus funciones.

Con el uso de moléculas antisentido llamadas morfolinos logramos inactivar la expresión de Zimp7 en embriones de

pez desde etapas tempranas. El análisis de los fenotipos obtenidos nos dio evidencia de que Zimp7 está involucrado en la

determinación del eje dorsoventral y en la producción de mesodermo. Además, el estudio de la expresión de diversos

marcadores genéticos nos indica que Zimp7 actúa desde etapas tempranas en un momento crítico para la formación de

los ejes del embrión, que es cuando se forma una estructura llamada organizador dorsal. Por otra parte tenemos también

datos que demuestran que la ausencia de Zimp7 afecta el funcionamiento de una vía de señalización de TGF- llamada

Nodal y quizá también afecta la actividad de la catenina, que es una proteína que se deposita por vía materna en forma

asimétrica para así originar una asimetría dorsoventral. Identificar los genes que participan en este proceso ha sido uno de

los objetivos mas importantes de la biología del desarrollo en los últimos años. Por esa razón, creemos que se nos

presenta una excelente oportunidad para contribuir a esta área del conocimiento. En mi presentación voy a describir estos

resultados, así como las perspectivas del proyecto.

Título de los carteles.

1. El papel de las RhoGTPasas en el desarrollo embrionario de pez cebra.

Responsable: Enrique Salas Vidal

2. Estudio de las proteínas ARID en la embriogénesis del pez cebra.

Responsables: Angel Flores y Laura Ramírez

Publicaciones.

52

1. Sexually dimorphic gene expression of the zimp7 and zimp10 genes in embryonic gonads. Hector Rodríguez-Magadán,

Laura Ramírez, Denhi Schnabel, Martha Vázquez and Hilda Lomelí. 2010. Gene Expression Patterns. 10(1):16-23.

2. Dynamics of expression of the ARID1A and ARID1B subunits in mouse embryos and in cells during the cell cycle. Angel

Flores-Alcantar, Adriana Gonzalez-Sandoval, Diana Escalante-Alcalde, Hilda Lomelí. 2011. Cell Tissue Res. 345(1):137-48.

3. Expression of LPP3 in Bergmann glia is required for proper cerebellar sphingosine-1-phosphate metabolism/signaling

and development.López-Juárez A, Morales-Lázaro S, Sánchez-Sánchez R, Sunkara M, Lomelí H, Velasco I, Morris AJ,

Escalante-Alcalde D.

2011. Glia. 59(4):577-89.

4. Emerging roles of the SUMO pathway in development. Lomelí H, Vázquez M. 2011. Cell Mol Life Sci. 68(24):4045-64.

Tesis Concluidas.

Brenda Herrera (HL)- Licenciatura (2010)

Alejandro Priego (ES)- Licenciatura (2011)

Jorge Medel (ES)- Licenciatura (2011)

Damaris López (HL)- Maestría (2010)

Mario Mendieta (ES)- Maestría (2011)

Angel Flores Alcántar (HL) -Doctorado)- 2011

Hector Rodríguez (HL)- Doctorado-2011

Docencia.

Hilda Lomelí

Participante en el curso de Biología Celular semestres 2010-2 y 2011-2.

Participante en el tópico “Células Troncales” impartido en IFC (responsable Iván Velasco). 2010.

Participante en el versión 2011-2 del curso “Organismos Modelo” (responsable Ernesto Maldonado, IFC)

Enrique Salas

53

Profesor único. Curso de Biología del Desarrollo. Facultad de Ciencias. UAEM

Profesor en Curso pre-congreso al X Congreso de la Sociedad Mexicana de Biología del Desarrollo: “Estrategias

experimentales para el análisis molecular del desarrollo del pez cebra.” Instituto de Fisiología Celular, UNAM. Octubre

2011.

Participante en el curso de Biología Celular semestres 2010-2 y 2011-2.

Angel Flores y Héctor Rodríguez

Impartieron el curso de Biología del Desarrollo en la Facultad de Ciencias (UAEM) para obtener créditos de doctorado

Donativos

CONACYT 2011-2013 (HL)

DGAPA 2009-2011 (HL)

DGAPA 2009-2011 (ES)

DGAPA-IXTLI 2010 -2011(ES)

54

Grupo Dr. Carlos Arias (Miércoles 14, de 10:00 a 10:30

hrs.).

Apuntes sobre el proceso de entrada y el tráfico intracelular de rotavirus en las fases tempranas de la infección

Carlos F. Arias

Integrantes del Grupo (2010-2011):

Líderes Academicos: Carlos F. Arias, Susana López

Investigadores asociados: Dres. Ernesto Méndez, Pavel Isa, Tomás López

Técnicos académicos: Rafaela Espinosa, Pedro Romero, Yunuen Acevedo, MC Marco Anonio Espinoza (ultimos dos por

honorarios)

Estudiantes:

Licenciatura: Cinthia Martínez, Joaquín Moreno, Ana Paola Carranco

Maestría: María de los Dolores Soto, Georgina Cobián, Marina Escalera, Luis Felipe Paulín, Enrique Rojas, Rodrigo

Velázquez, Diego Cevallos Porta, Luis Alberto Casorla,

Héctor Ramírez, Alfonso Oceguera, , Liliana Sánchez, Juan Manuel Carreño, Paula Rubio

Doctorado: Daniela Silva, Marco Aurelio Díaz, Jesús Torres, Andrea Murillo, Miguel Angel Martínez, Rosa Ma. Rubio,

Vicenta Trujillo

Administrativos: Lorena Salazar, Silvia Flores, Miguel Angel Olvera.

Resumen

En el periodo 2010-2011 mi laboratorio ha continuado profundizando en el estudio del mecanismo de entrada de los

rotavirus a la célula huésped y del tráfico intracelular de las vesículas que portan a las partículas virales que ingresan. Una

observación novedosa fue que dos cepas de rotavirus diferentes (RRV y UK) usan mecanismos diferentes de endocitosis

para infectar a la célula. UK lo hace a través de endocitosis clásica mediada por clatrina, mientras que RRV entra por un

mecanismo de endocitosis no bien caracterizado. Considerando estas diferencias, utilizamos un juego de virus rearreglantes

UKxRRV, en los cuales una de las proteínas de superficie de una cepa de virus (VP7 ó VP4) está presente en el fondo

genético de la otra. Por ejemplo, la proteina VP4 de UK sobre el fondo genético de RRV. De esta manera identificamos a la

proteína VP4 de UK como la responsable de definir la entrada del virus por la vía de endocitosis clásica. También

determinamos que una mutación puntual en VP4 es suficiente para cambiar la vía de endocitosis utilizada por el virus para

ingresar a la célula. Utilizando RNAi y la expresion de mutantes dominantes negativas de varias de las moléculas celulares

involucradas en el proceso endocítico (EEA1, Rab5, Rab7, Rab9, ESCRT) encontramos que, independientemente de la vía

endocítica empleada por RRV y UK, las vesículas endocíticas que internalizan a los dos diferentes virus convergen en

endosomas tempranos. Encontramos también que ambos virus dependen de la maquinaria de ESCRT –necesaria para la

maduración de los endosomas tempranos a cuerpos multivesiculares y endosomas tardíos- para infectar exitósamente a la

célula. Sin embargo, RRV parece llegar exclusivamente hasta endosomas tempranos y de ahí salir al citosol para iniciar el

proceso de transcripción viral, mientras que UK requiere continuar su proceso de internalización hasta endosomas tardíos y

probablemente lisosomas, antes de poder ser liberado al citosol. Esta diferencia en el proceso de infección también depende

de la proteína de superficie VP4. De manera paralela, en este trabajo también encontramos que algunas proteínas de las

uniones estrechas (claudinas 9, 14 y 16, ocludina, JAM y ZO-1) son importantes para la infección del virus.

En resultados que no presentaré en esta ocasión, pero que es importante mencionar, nuestro laboratorio se ha

enfocado también en los últimos dos años a la caracterización de la evolución molecular y diversidad del virus de influenza

A, a la epidemiología de las infecciones virales respiratorias, a estudios metagenómicos para determinar los patógenos

asociados a enfernedades respiratorias severas, así como al diseño de métodos diagnósticos de virus respiratorios y

gastrointestinales utilizando una plataforma de microarreglos de oligonucléotidos de DNA. Tambien hemos continuado con

55

la caracterización de diversos estadios de la replicación de los astrovirus, los cuales, al igual que los rotavirus, se asocian a

las gastroenteritis infantiles.

Titulo de los Carteles:

1. “Identificación de factores celulares necesarios para la replicación de rotavirus utilizando enfoques globales”. Presenta

Tomás López.

2. “El uso de secuenciación masiva para estudiar la evolución del virus de influenza tipo A”. Presenta Pavel Isa.

Publicaciones:

1. Realpe M, Espinosa R, López S, and Arias CF. 2010. Rotaviruses require basolateral molecules for efficient infection of

polarized MCDKII cells. Virus Res. 147:231-241

2. Gutiérrez M, Isa P, Sánchez-San Martin C, Pérez-Vargas J, Espinosa R, Arias CF, and López S. 2010. Different rotavirus

strains enter MA104 cells through different endocytic pathways: The role of clathrin-mediated endocytosis. J Virol.

84:9161-9169.

3. Rojas M, Arias CF, and López S. 2010. Protein Kinase R is the kinase responsible for the phosphorylation of eIF2alpha

in rotavirus infection. J Virol. 84:10457-10466.

4. López, S. and Arias, C. 2010. How Viruses Hijack Endocytic Machinery. Nature Education 3(9):16

5. Alexander L. Greninger, Eunice C. Chen, Taylor Sittler, Alex Schneierman, Nareg Roubinian, Guixia Yu, Pavel Isa, C. F.

Arias, Dylan Pillai, Cyril Guyard, John Hackett, Jr., Gerald Schochetman, Steve Miller, Patrick Tang, Charles Y. Chiu.

2010. A Metagenomic Analysis of Pandemic Influenza A (2009 H1N1) Infection in Patients from North America. PLOS

One. Oct 18;5(10):e13381.

6. Carreño-Torres JJ, Gutiérrez M, Arias CF, López S, and Isa. 2010. Characterization of viroplasm formation during the

early stages of rotavirus infection. Virol J. 7:350.

7. López T, Silva-Ayala D, López S, Arias CF. 2011. Rotavirus genome replication requires an active ubiquitin-proteasome

system. J Virol. 85:11964-11971

8. Trujillo-Alonso V, Maruri-Avidal L, Arias CF, López S. 2011. Rotavirus infection induces the unfolded protein response

of the cell and controls it through the nonstructural protein NSP3. J Virol. 85:12594-12604.

9. López, T., Silva-Ayala, D., López, S., Arias, CF. 2011. Methods suitable for high-throughput screening of siRNAs and

other chemical compounds with the potential to inhibit rotavirus replication. J Virol Methods. 2011 Nov 18. [Epub ahead of

print]

10. Martha N. Calderon, Carlos A. Guerrero, Orlando Acosta, Susana Lopez and Carlos F. Arias. 2011. Inhibiting rotavirus

infection by membrane-impermeant thiol/disulfide exchange blockers and antibodies against protein disulfide isomerase.

Intervirology. En Prensa.

11. Dong J, Dong L, Méndez E, Tao Y. 2011. Crystal structure of the human astrovirus capsid spike. Proc Natl Acad Sci U

S A. 108:12681-12686.

12. Velázquez-Moctezuma R, Baños-Lara MD, Acevedo Y, Méndez E. 2011. Alternative cell lines to improve the rescue of

infectious human astrovirus from a cDNA clone. J Virol Methods. 2011 Nov 18. [Epub ahead of print]

Enviados

1. Identification of an influenza virus strain that represents a sister lineage to the A/H1N1/2009 pandemic clade. 2011.

Escalera-Zamudio, M., Cobián-Güemes, G., Soto-del Río, MD., Isa, P., Romero, P., Sánchez-Betancourt, I., Velázquez-

56

Salinas, L., Huerta-Lozano, B., Montero, H., Vinuesa, P., López, S., and Arias, CF. 2011. Enviado. PLoS ONE.

2. Vazquez-Perez JA, Isa P, Ramírez-Gonzalez JE, Kobasa D, Ormsby CE, Romero D, Ranadheera C, Li Y, Bastien N,

Embury-Hyatt C, González-Duran E, Barrera-Badillo G, Ortiz J, Ablanedo Y, Sevilla-Reyes E, Escalera-Zamudio M,

Cobián-Güemes AG, Lopez I, Alpuche-Aranda C, Perez-Padilla R, Reyes-Teran G. 2011. H1N1pdm HA D222 variants

associated with severity and mortality in patients during a second wave in Mexico and their pathogenicity in mouse model.

Enviado. PLoS ONE.

3. Mark Yeager, Kelly Dryden, Mariana Tihova, Norbert Nowotny, Suzanne Matsui, Ernesto Mendez. 2011. Conservation

in the icosahedral design of human astrovirus and Hepatitis E virus. EMBO J. Enviado.

Capítulos de libro:

1. Méndez, E. and Arias, C.F. 2011. Astroviruses. In: Fields Virology. 6th

Edition. Editors in chief: DM Knipe and PM

Howley. Lippincott Williams & Wilkins. En prensa.

2. Albert Bosch, Ernesto Méndez, Neel K. Krishna, Mary Pantin-Jackwood, Stacey Schultz-Cherry, Steve S. Monroe, and

Susana Guix, Astroviridae. In: Andrew M.Q. King, Michael J. Adams, Eric B. Carstens, and Elliot J. Lefkowitz, editors,

Virus Taxonomy. Oxford: Elsevier, 2011, pp. 953-960.

Difusión:

1. Arias, CF y López, S. Biología del virus de influenza A. En: “La epidemia de influenza A/H1H1 en México” Capítulo I,

pags 3-15. 2010. Córdova Villalobos, JA, Valdespino Gómez JL, y Ponce de León Rosales S., (eds.). Editorial Médica

Panamericana.

2. López, S. y Arias CF. Virus de la influenza: Biología, diagnóstico, prevención y control. 2009. En: La UNAM ante una

emergencia sanitaria. Experiencia de la epidemia de influenza A (H1N1). Martuscelli Quintana, J. y Narro Robles J.(eds).

En Prensa.

3. Por un uso responsable de los organismos genéticamente modificados. 2011. Comité de Biotecnología. Coordinador Francisco

Bolívar.

4. Pérez-Vargas J, López S, Arias CF. 2010. Familia Reoviridae. En: Molina López, J., Manjarrez Zavala, M.A y Tay

Zavala, J. (ed.), Microbiología. Bacteriología y Virología. Méndez Editores. Cd. de México, pp. 573-593.

Divulgacion:

1. La Ciencia y el termómetro de Howard Hughes.

Gaceta UNAM 24 de noviembre de 2011, p-10 y Unión de Morelos. Lunes en la Ciencia. 28 de noviembre de 2011

Tesis Concluidas:

Licenciatura:

1. Ana Georgina Cobián Güemes. 2011 (Marzo 23). Metagenómica viral de enfermedades respiratorias graves. Lic.

Ciencias Genómicas, CCG/IBt, UNAM. (Tutor: Carlos Arias)

2. Tomás Rodríguez García. 2010 (Jul 9). Montaje de un sistema de rescate fenotípico para rotavirus", para nivel

Licenciatura. Facultad de Ciencias Biológicas, Universidad Autónoma del Estado de Morelos. (Tutor: Tomás López)

3. Diego Cevallos Porta. 2010 (Nov 23). Infección de células intestinales por rotavirus” Facultad de Ciencias, Universidad

Autónoma del Estado de Morelos. (Tutor: Pavel Isa)

4. Ana Paula Carranco Arenas. 2010 (Oct 14). Papel de la infección con rotavirus y RNA doble cadena en la formación de

gránulos de estres. Licenciatura en Ciencias Genomicas. (Tutor: Susana López)

Maestría

1. Marina Escalera Zamudio. 2011 (Ago 19) Epidemiología molecular de virus influenza A y B circulantes en México,

Programa de Posgrado en Ciencias Bioquímicas/IBt, UNAM. (Tutor: Pavel Isa)

57

2. María de los Dolores Soto del Río. 2011 (Ago 24). Desarrollo y validación de un microarreglo que detecto todos los virus

que se asocian al tracto respiratorio en vertebrados. Programa de Posgrado en Ciencias Bioquímicas/IBt, UNAM. (Tutor:

Carlos Arias)

3. María de Lourdes Gándara Suárez. 2011 (May 28). Obtención de baculovirus recombinantes que expresan la proteína

estructural de astrovirus. Programa de Posgrado en Ciencias Bioquímicas/IBt, UNAM. (Tutor: Ernesto Méndez)

4. Marco Antonio Espinosa Torres. 2010 (Oct 1). “Identificación de los genes de rotavirus involucrados en el apagado de la

síntesis de proteínas celulares” Maestría en Ciencias Bioquímicas. (Tutor: Susana López)\

Doctorado

1. Rocío Baños Lara. 2011 (Feb 10) Actividad de Caspasas inducida por astrovirus humanos en cultivos celulares y su

relación con el procesamiento de la proteína estructural. Programa de Posgrado en Ciencias Bioquímicas/IBt, UNAM.

(Tutor: Ernesto Méndez)

2. Margarito Rojas. 2011 (Feb15) “Caracterizacion de los mecanismos que utiliza rotaviruspara mantener la fosorilación del

factor eIF2a” Doctorado en Ciencias Bioquimicas. (Tutor: Susana López)

Michelle Gutierrez. 2011 (Feb15) "Caracterizacion del mecanismo de entrada de los rotavirus" Doctorado en Ciencias

Bioquimicas. (Tutor: Susana López).

Docencia Curso “Biología molecular de Virus” para maestría y doctorado en el posgrado en Ciencias Bioquimicas/UNAM y la

Licenciatura en Biología de la Facultad de Ciencias, UNAM.

Ago 2010 – Ene 2011 y Ago 2011 – Ene 2012. Responsable Pavel Isa. Participación de Tomás López

Curso Virología Básica, en las XI jornadas de la Escuela nacional de Biofísica Molecular. Universidad de Sonora,

Hermosillo, Abril 2010. Responsable Pavel Isa

Participación en Curso Básico “Biología celular” en Programa en Ciencias Bioquímicas de la UNAM, con tema Matriz

extracelular, Junio 2010. Responsable Pavel Isa

Participación en curso “Agentes infecciosos asociados a padecimientos emergentes y bioterrorismo” con la ponencia

Influenza. Instituto Nacional de Salud Publica, Escuela de Salud Publica de México, Marzo 2010. Responsable Pavel Isa

Participación en el curso Vacunas y salud publica, en Instituto Nacional de Salud Publica, con la impartición del tema

“Vacuna contra rotavirus”. Agosto 2010. Responsable Pavel Isa

Responsable del Tópico Selecto “Microarreglos de DNA” dentro del posgrado en Ciencias Bioquímicas, Enero-Julio 2011.

Responsable Pavel Isa

Participación en el Curso Teórico Práctico de Biología Molecular. Departamento de Biología Molecular e

Histocompatibilidad del Hospital Dr. Manuel Gea González. Tema: Interferencia de RNA y sus Aplicaciones. 2010.

Responsable Tomás López.

Participación en el curso de Virología en el Departamento de Biomedicina Molecular del CINVESTAV. Tema: Reovirus,

Rotavirus y Orbivirus. 2010 y 2011. Responsable Tomás López.

Participación en el curso “Fronteras de la Genómica” para la Licenciatura en Ciencias Genómicas. 2010. Carlos Arias

Krystle Yakshe, Texas A&M University, USA, Junio-Julio 2011. Entrenamiento metodológico en interferencia de RNA.

Responsable: Susana López.

58

Nadia Castañeda, Universidad del Bosque, Bogota, Colombia, Sept-Oct 2011. Responsable: Susana López.

Felipe Manuel Llera Güemes. Estancia de verano. Técnicas de virología

Escuela: Centro de Bachillerato Tecnológico industrial y de servicios Número 76

Responsable: Georgina Cobián.

Donativos:

1. Proyecto DGAPA/UNAM. IN-219208 (Ene 2008-Dic 2010). Identificación de genes celulares necesarios para la

replicación de rotavirus. Responsable Carlos F. Arias

2. Proyecto Salud-Conacyt 69852 (Dic 2010) Diagnóstico molecular de patógenos asociados a enfermedades respiratorias

usando un microarreglo de DNA. Responsables Ignacio Santos/Carlos F. Arias

3. Proyecto Conacyt. Fondo especial del grupo asesor CONACYT-SS (2009-2011.). Caracterización molecular de los virus

asociados a la epidemia de influenza 2009. Responsable Carlos F. Arias

4. Proyecto UC-Mexus UCSF/UNAM (2008-2010) Metagenomics for deteciton and discovery of viruses associated with

acute gastroenteritis. Responsable del proyecto: Charles Chiu/Carlos F. Arias

5. Proyecto HHMI. Apoyo al IBT para el programa docente “Frontiers in Genomics Program in México). 2008-2011.

Responsable: Carlos F. Arias

6. Proyecto Conacyt INFR-2009-01-122212 (2009-2010) Convocatoria para Apoyos Complementarios para la

Actualización de Equipo Científico 2009. “Actualización del equipo científico del Instituto de Biotecnología de la

Universidad Nacional Autónoma de México. Responsable: Carlos F. Arias

7. Proyecto SEP-CONACyT. 79574 (Oct 2008 - Sep 2011). “Identificación de las proteínas celulares que interactúan con la

proteína estructural de astrovirus y su posible papel en la morfogénesis del virus”. Responsable Ernesto Méndez.

8. Proyecto DGAPA/UNAM. IN219910 (Ene 2010 - Dic 2012): “Factores involucrados en la entrada de astrovirus a su

célula huésped.” Responsable Ernesto Méndez.

10. Proyecto del Instituto de Ciencia y Tecnología del D.F. PICDSI09-209. (Dic 2009-Dic 2010). “Epidemiología molecular

del virus responsable de la epidemia de influenza 2009”. Responsable Pavel Isa.

11. Proyecto Salud-Conacyt 111593 (2009-2011) Desarrollo y validación de un microarreglo de DNA para detección y

subtipificación de agentes virales asociados a gastroenteritis. Responsable Pavel Isa.

12. Proyecto DGAPA/UNAM. IN-213410 (2010-2012). Identificacion de virus respiratorios y subtipificación de influenza

tipo A en muestras clinicas utilizando un microarreglo de DNA. Responsable Pavel Isa.

13. Proyecto SEP-Conacyt 102823 (2009-2011). Estudio del mecanismo de entrada de rotavirus a su célula huésped.

Responsable Pavel Isa.

14. Proyecto. SEP-CONACYT 82351 SCAI 3377. (2009-2011) Identificación de eventos de fosforilación y cinasas

relevantes para la replicación de rotavirus utilizando enfoques globales. Responsable Tomás López.

15. Proyecto DGAPA/UNAM. IN212211-3 (2011-2013). Papel del sistema ubiquitina-proteasoma en la replicación de

rotavirus. DGAPA-UNAM. Duración 3 años. Responsable Tomás López.

16. Proyecto DGAPA/UNAM. IN211411-3 (2011-2014). Mecanismos de evasión de la respuesta antiviral por rotavirus.

Responsable: Susana López

59

17. Proyecto Salud-Conacyt. Clave S0008-126823 (2009-2011) convocatoria especial influenza 2009. Caracterización de la

diversidad genética de virus de influenza circulantes en humanos, cerdos y aves Responsable: Susana López

18. Texas A&M University-CONACYT: Collaborative Research Grant Program.

Proposal No.: 2010-035. (2010-2011). Characterization of new transport molecules that function in the unconventional

transport and secretion of the rotavirus enterotoxin, NSP4.

PIs: Judith Ball, Texas A&M University. Susana López, UNAM

19. Proyecto. SEP-CONACYT 153639 (2011-2014) Caracterizacion de las interacciones de los rotavirus con su celula

huesped necesarias para el establecimiento de una infeccion productiva. Responsable: Susana López

Premios y Distinciones:

Miembro del “Review Panel de la “Iniciative for Early Career Support” del HHMI. Nov 2011.

Otras actividades relevantes: 1. Comité editoriales:

Editorial Board de Journal of Virology por el periodo Ene 2004 –Dic 2012 (cuatro renovaciones de 2 años c/u)

Editorial Board de Virology por el periodo 2006-Feb 2011

Editorial Board de Archives of Medical Research por el periodo Abril 2011-

Revisor ad hoc de Journal of Virology, Virology, Journal of General Virology, PLoS ONE, Journal of Proteomics,

Veterinary Research, Revista del INSP.

2. Consejos Directivos/Administración/Académicos

Miembro del Consejo de Administración de la empresa Birmex 2005-

Miembro del Organo de Gobierno del Centro de Investigación y Asistencia en Tecnología y Diseño del Estado de

Jalisco (CIATEJ) 2005-

Miembro del Organo de Gobierno del Centro de Investigación Científica de Yucatán (CICY) 2008-

Miembro de la Comisión Académica Ampliada del Instituto Nacional de Salud Pública 2005-

Presidente del Consejo de Dirección del Campus Morelos de la UNAM. Ene 2010-Ene 2011.

60

Grupo Dr. Alberto Darszon (Miércoles 14, de 12:15 a

12:45 hrs.).

Título:

Canales de comunicación del espermatozoide/Alberto Darszon

Integrantes:

Asoc.1 : Carmen Beltrán

Pos.1 : Claudia Sánchez

Pos.2 : Gerardo Orta

E.Lic.1 : Vilma Jimenez Sabinina-Licenciatura

E.Lic.2 : Tatiana Luna Ruiz

E.Posgr.1 : Adan Oswaldo Guerrero-Doctorado

E.Posgr.2 : Pablo Martinez Lopez-Doctorado

E.Posgr.3 : Dulce María Figueiras Fierro-Doctorado

E.Posgr.4 : Enrique Balderas Ángeles-Doctorado

E.Posgr.5 : Ana Laura González Cota-Doctorado

Adm.1 : Leonel Linares Labastida

Adm.2 : Margarita Ferrel Fuentes

Adm.3 : Antonio Blancas/Técnico

Resumen:

La reproducción es fundamental para la preservación de las especies, para la salud humana, la ganadería y la pesca. Los

canales iónicos del espermatozoide participan en la movilidad, maduración e inducción de un proceso exocitótico que lo

prepara para fusionarse con el óvulo llamado la reacción acrosomal (RA). La capa de gelatina que rodea al óvulo de erizos

de mar Strongylocentrotus purpuratus contiene al speract, un decapéptido que modula la concentración del Ca2+

intracelular

([Ca2+

]i) y la movilidad del espermatozoide. Registrando simultáneamente la trayectoria, la forma del flagelo y su

concentración local de [Ca2+

]i, establecimos que gradientes de speract disparan incrementos en la [Ca2+

]i regulados en

tiempo y espacio que desencadenan respuestas quimiotácticas en espermatozoides de L. pictus, y bajo condiciones

particulares en los de S. purpuratus. Alteraciones en la orquestación de los flujos iónicos modifican las fluctuaciones en la

[Ca2+

]i e inhiben la respuesta quimiotáctica del espermatozoide. Por ejemplo, inhibidores mitocondriales, o bloqueadores de

canales modifican los cambios en el [Ca2+

]i inducidos por el speract en el espermatozoide del erizo y su respuesta

quimiotáctica. La sintonización de los flujos iónicos a través de la membrana del flagelo con la polaridad del gradiente del

quimioatrayente, establece una regulación espacio-temporal de su aparato motor. Cambios eléctricos en la membrana

flagelar sincronizan la respuesta motora regulando el [Ca2+

]i que incrementa cuando el espermatozoide se aleja de la fuente

del quimioatrayente desencadenando el viraje, la orientación y el nado en lineal hacia el centro de este.

La capacitación, un proceso de maduración del espermatozoide de mamífero, ocurre en el tracto genital femenino y lo

prepara para fecundar al óvulo; aumenta el [Ca2+

]i y el pHi, y varias proteínas se fosforilan en tirosinas. En el ratón y

algunas otras especies, la capacitación se acompaña de una hiperpolarización del Em. Varios canales parecen contribuir a

dicha hiperpolarización. Hemos obtenido evidencia de que el CFTR, un canal de Cl- presente en los espermatozoides de

ratón y humano, regula a los canales de Na+ ENaCs que participan en esta hiperpolarizacón. La fosforilación que ocurre

durante la capacitación depende de aumentos en la concentración de AMPc, sintetizada por una adenilato ciclasa soluble

dependiente de HCO3-. La capacitación depende de la elevación de los niveles tanto de HCO3

- intracelular como del pHi, y

la homeostasis intracelular del Cl-, el HCO3

- y el pHi están íntimamente relacionadas. Durante este periodo terminamos de

establecer la presencia funcional del CFTR en el espermatozoide de ratón. También registramos corrientes macroscópicas

de Cl- reguladas por Ca

2+ en el espermatozoide de humano maduro y encontramos que estas participan en la RA. El inductor

natural de la RA es la ZP3, una glicoproteína de la matriz externa del óvulo. ZP3 activa, entre otras cosas, una entrada de

Ca2+

dependiente de Ca2+

externo necesaria para la RA. Hemos desarrollado una nueva estrategia para seguir la RA en el

tiempo simultáneamente con el [Ca2+

]i.

Título Presentaciones:

61

1) La mitocondria modula las señales de Ca2+

inducidas por el speract. Ana Laura González Cota.

2) Participación de los intercambiadores Cl-/HCO3

- SLC26A3 y SLC26A6, del canal de Cl

- CFTR y del factor

regulatorio NHERF-1 en la capacitación del espermatozoide de ratón. Julio C. Chávez.

Publicaciones 2010-2011:

1: Reyes JG, Osses N, Knox M, Darszon A, Treviño CL. Glucose and lactate regulate maitotoxin-activated Ca2+ entry in

spermatogenic cells: the role of intracellular

[Ca2+]. FEBS Lett. 2010 Jul 16;584(14):3111-5. Epub 2010 Jun 2. PubMed PMID:

20621838.

2: Guerrero A, Nishigaki T, Carneiro J, Yoshiro Tatsu, Wood CD, Darszon A. Tuning sperm chemotaxis by calcium burst

timing. Dev Biol. 2010 Aug 1;344(1):52-65. Epub 2010 May 16. PubMed PMID: 20435032.

3: José O, Hernández-Hernández O, Chirinos M, González-González ME, Larrea F, Almanza A, Felix R, Darszon A,

Treviño CL. Recombinant human ZP3-induced sperm acrosome reaction: evidence for the involvement of T- and L-type

voltage-gated calcium channels. Biochem Biophys Res Commun. 2010 May 14;395(4):530-4. Epub 2010 Apr 13. PubMed

PMID: 20394732.

4: Suhaiman L, De Blas GA, Obeid LM, Darszon A, Mayorga LS, Belmonte SA. Sphingosine 1-phosphate and sphingosine

kinase are involved in a novel signaling pathway leading to acrosomal exocytosis. J Biol Chem. 2010 May

21;285(21):16302-14. Epub 2010 Mar 17. PubMed PMID: 20236935; PubMed Central PMCID: PMC2871498.

5: Santi CM, Martínez-López P, de la Vega-Beltrán JL, Butler A, Alisio A, Darszon

A, Salkoff L. FEBS Lett. 2010 Mar 5;584(5):1041-6. Epub 2010 Feb 9. PubMed

PMID: 20138882; PubMed Central PMCID: PMC2875124.

6: Chávez JC, De Blas GA, De la Vega-Beltrán JL, Nishigaki T, Chirinos M, González-González ME, Larrea F, Solís A,

Darszon A, Treviño CL. The opening of maitotoxin-sensitive calcium channels induces the acrosome reaction in human

spermatozoa: differences from the zona pellucida. Asian J Androl. 2010 Sep 13. PubMed PMID: 20835262.

7: Martínez-López P, Treviño CL, de la Vega-Beltrán JL, Blas GD, Monroy E,

Beltrán C, Orta G, Gibbs GM, O'Bryan MK, Darszon A. TRPM8 in mouse sperm detects

temperature changes and may influence the acrosome reaction. J Cell Physiol. 2010

Nov 10. [Epub ahead of print] PubMed PMID: 21069744.

8: Guerrero A, Wood CD, Nishigaki T, Carneiro J, Darszon A. Tuning sperm

chemotaxis. Biochem Soc Trans. 2010 Oct;38(5):1270-4. PubMed PMID: 20863297.

9. Chávez JC, de Blas GA, de la Vega-Beltrán JL, Nishigaki T, Chirinos M, González-González ME, Larrea F, Solís A,

Darszon A., Treviño CL. The opening of maitotoxin-sensitive calcium channels induces the acrosome reaction in human

spermatozoa: differences from the zona pellucida. Asian J. Androl. 2011 Jan;13(1):159-65. Epub 2010 Sep 13. PubMed

PMID: 20835262.

10. Visconti PE, Krapf D, de la Vega-Beltrán JL, Acevedo JJ, Darszon A. Ion channels, phosphorylation and mammalian

sperm capacitation. Asian. J. Androl. 2011. 13: 395-405.

11. Gibbs GM, Orta G, Reddy T, Koppers AJ, Martínez-López P, Luis de la Vega-Beltràn J, Lo JC, Veldhuis N, Jamsai D,

McIntyre P, Darszon A, O'Bryan MK. Cysteine-rich secretory protein 4 is an inhibitor of transient receptor potential M8

with a role in establishing sperm function. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2011. Apr 26;108(17):7034-9. PMID:21482758

12. Balderas E, Arteaga-Tlecuitl R, Rivera M, Gomora J, Darszon A. Niflumic acid blocks native and recombinant T-type

channels. J. Cell Physiol. 2011. Aug 24. doi: 10.1002/jcp.22992. [Epub ahead of print] PubMed PMID: 21898399.

13. Torres-Flores V, Picazo-Juárez G, Hernández-Rueda Y, Darszon A González-Martínez MT. Sodium influx induced by

external calcium chelation decreases human sperm motility. Hum Reprod. 2011 Aug 2. [Epub ahead of print]PubMed

PMID: 21810864.

14. Visconti PE, Krapf D, de la Vega-Beltrán JL, Acevedo JJ, Darszon A. Ion channels, phosphorylation and mammalian

sperm capacitation. Asian J Androl. 2011 May;13(3):395-405. Review. PubMed PMID: 21540868.

15. Darszon, A., C. Beltran, R. Felix, T. Nishigaki, y C.L. Trevino. Calcium channels in the development, maturation and furnction of spermatozoa. 2011. Physiol. Revs. 2011. 91: 1305-1355.

16. Pimentel JA, Carneiro J, Darszon A., Corkidi G. A segmentation algorithm for automated tracking of fast swimming unlabelled cells in three dimensions. J. Microsc. 2011. Oct 17. doi: 10.1111/j.1365-2818.2011.03545.x. [Epub ahead ofprint] PubMed PMID: 21999166.

62

17. Espinal J, Aldana M, Guerrero A, Wood C, Darszon A, Martínez-Mekler G. Discrete dynamics model for the speract-activated Ca2+ signaling network relevant to sperm motility. PLoS One. 2011;6(8):e22619. Epub Aug 16. PubMed PMID: 21857937; PubMed Central PMCID: PMC3156703.

18. Martínez-López P, Treviño CL, de la Vega-Beltrán JL, De Blas G, Monroy E, Beltrán C, Orta G, Gibbs GM, O'Bryan MK, Darszon A. TRPM8 in mouse sperm detects temperature changes and may influence the acrosome reaction. J Cell Physiol. 2011 Jun;226(6):1620-31. doi: 10.1002/jcp.22493. PubMed PMID: 21413020.

Tesis Concluidas* (2010-2011):

Adán Guerrero

Docencia* (2010-2011): Biología Celular/Transporte; Taller de Bioquímica

Donativos* (2010-2011):

DGAPA-UNAM IN225406 IN225806, IN227806, IN211907; CONACyT 49113-Q y 128566, 0056660; NIH (U

MASSACHUSETTS 08-004692 A 00); DIA/CIC-UNAM

Otras actividades relevantes* (2010-2011): Conferencias por invitación:

1) EMBO Workshop on Biophysical Mechanisms of Development. Mayo 5-7. Instituto Gulbenkian, Oeiras, Protugal. 2011.

2) 36th FEBS CONGRESS, Biochemistry for Tomorrow’s Medicine, Torino, Italia. Junio 25-30, 2011.

3) Gordon Research Conference, “Fertlization and Activation of Development” Plática dada por Adán Guerrero. Julio 12-

17. 2011.

4) 1st International caesar Conference "Sperm signaling and motility". Octubre 5-7, Bon, Alemania. 2011.

5) International Symposium on Photonic Bioimaging, 21-23 October, 2011. Saporo, Japón.

Evaluaciones para 2010-2011:

Journal of Andrology, Molecular Human Reproduction, Journal of Cell Physiology, Developmental Biology, Journal of Cell

Biology, J. Gen. Physiol, Science, Proc. Natl. Acad. Sci. USA. Curr. Biol.

63

Grupo Dra. Alejandra Bravo (Miércoles 14, de 12:45 a

13:15 hrs.).

Alejandra Bravo

Título de la Plática: Como controlar a los insectos que s vuelven resistentes

a las toxinas insecticidas Cry de Bacillus thuringiensis?

Integrantes del Grupo (2010-2011):

Investigadores: Estudiantes a su cargo:

Liliana Pardo Luis E. Zavala (M, Enero 2012 y CD), Adriana Vega (CD)

Carlos Muñoz-Garay Leivi Portugal (M, Enero 2012 y CD) José Aguilar (L, Abril 2010)

Helena Porta Gladys Jiménez (M), Abiud Fuentes (L, Enero 2012)

Estudiantes:

Diana Martínez de Castro (L. Enero 2012, M)

Leidy Bedoya (M)

Jazmín López (M) CD = candidato a doctorado

Violeta Matus (M)

Técnicos:

Jorge Sánchez

Lizbeth Cabrera

Estudiantes graduados en el periodo:

Ángeles Cancino (D, Mayo 2010)

Guadalupe Peña (D, Diciembre 2010)

Raquel Arroyo (L, Abril 2010)

Gerardo del Toro (L, Agosto 2010)

Daniela Carmona (L, Enero 2012)

Luis Enrique Zavala (L, Mayo, 2011)

Resumen de la plática:

Bacillus thuringiensis produce toxinas Cry insecticidas que se usan en el control de insectos plaga. Estas son toxinas

formadoras de poro que interactúan con diferentes receptores en las células del intestino de los insectos en donde forman

poros causando la ruptura de las células y la muerte del insecto.

Es muy importante entender el mecanismo de acción de estas toxinas a fin de hacerlas efectivas contra otras plagas de

insectos o para contender con insectos que se vuelven resistentes a las toxinas. Hablare de dos temas principales: 1. Como

se mete la toxina en la membrana? y 2. Como matar a insectos resistentes?

Existe controversia de cómo se inserta el oligomero de Cry en la membrana para formar poro. Una hipótesis dice que solo el

hairpin hidrofobico formado por hélices alfa-4 and alfa-5 del dominio I se inserta en la bicapa y el resto queda en la

superficie de la membrana y la otra dice toda la toxina se inserta en la membrana. Construimos mutantes de Cry1Ab con

una sola Cys en los tres dominios de la toxina, se marcaron estas posiciones con colorantes fluorescentes y se analizó la

Fluorescencia ay el apagado con quencheadores solubles o asociados a membrana. El análisis de toxinas solubles o

insertadas en membrana revelo que los tres dominios de la toxina permanecen en la superficie de la membrana y que una

región discreta del dominio I se inserta en la bicapa lipídica. Nuestros datos acaban con la controversia por lo que se

propone que la toxina se inserta a manera semejante a otras toxinas bacterianas siguiendo un modelo de inserción de

paraguas.

Por otro lado, el desarrollo de resistencia a estas toxinas es el principal problema para su aplicación. La resistencia a toxinas

Cry en algunos insectos esta ligada a mutaciones en el receptor caderina. Recientemente se mostro que la resistencia se

puede asociar a mutaciones en otras proteínas como un transportador ABC o una aminopeptidasa P. La caderina esta

involucrada en inducir oligomerización de toxinas Cry tras el corte de hélice alfa-1. Las toxinas CryMod que construimos

en el laboratorio carecen del extremo amino terminal incluyendo la hélice alfa-1 y son capaces de matar a larvas de M. sexta

silenciadas en expresión de caderina y también a una población de insectos Pectinophora gossypiella resistentes a toxinas

64

Cry que presentan mutaciones en el gene de caderina. La toxicidad de toxinas CryMod fue probada en contra de tras seis

poblaciones de insectos resistentes a toxinas Cry. Nuestros resultados muestran que las toxina CryMod reducen los niveles

de resistencia de tres poblaciones ligadas a mutaciones en el transportador ABC y una población ligada a mutaciones en

aminopeptidasa P. Por el contrario, poblaciones que muestran niveles de resistencia bajos debido solo a mutaciones en

caderina no fueron controladas tan eficientemente por las toxinas CryMod, esto se debe a que la potencia de toxinas

CryMod se disminuyo considerablemente en las poblaciones susceptibles correspondientes. Nuestros datos indican que las

toxinas CryMod podrán ser utilizadas en el control de insectos resistente aun cuando presenten diferentes mecanismos de

resistencia.

Titulo de los Carteles: 1. Los fragmentos de la toxina Cyt1Aa de Bacillus thuringiensis correspondientes a los extremos N- y C-terminal juegan un

rol diferente, ya sea en oligomerización de la toxina o en inserción en membrana para la formación de poro. Presentado por

Claudia Rodríguez Almazán (Posdoctoral durante 2008-2010)

2. Mutantes Cry Dominantes-Negativas funcionan como anti-toxinas y demuestran que la oligomerización entre diferentes

toxinas Cry in vivo es posible. Presentado por Carlos Muñoz

Publicaciones* (2010-2011):

1. Fernandez Luna M.T., Lanz Mendoza H., Gill SS., Bravo A., Soberón M., and Miranda Rios J. 2010. An -amylase is a

Novel Receptor for Bacillus thuringiensis subsp. israelensis Cry4Ba and Cry11Aa Toxins in the Malaria Vector

Mosquito Anopheles albimanus (Diptera: Culicidae). Environm Microbiol 12: 746-757

2.- Cancino-Rodezno A., Alexander C., Villaseñor R., Pacheco S., Porta H., Pauchet Y., Gill S.S., Soberón M., and Bravo

A. 2010 The mitogen-activated protein kinase p38 pathway is involved in insect defense against Cry toxins from

Bacillus thuringiensis. Insect Biochem Mol Biol. 40: 58-63

3.- Arenas I., Bravo A., Soberón M. and Gómez I. 2010. Role of alkaline phosphatase from Manduca sexta in the

mechanism of action of Bacillus thuringiensis Cry1Ab toxin J Biol Chem 285: 12497-12503

4. Martins E.S., Monnerat R.G., Quiroz P.R., Dumas V.F., Braz S.V., de Souza Aguilar R.W., Gomes A.C., Sánchez J.,

Bravo A., and Ribeiro B.M. 2010 Midgut GPI-anchored proteins with alkaline phosphatase activity from the cotton boll

weevil (Anthonomus grandis) are putative receptors for the Cry1B protein of Bacillus thuringiensis. Insect Biochem Mol

Biol. 40:138-145

5. Fernandez-Luna M.T., Tabaschnik B., Lanz-Mendoza H., Bravo A., Soberon M., Miranda-Rios J. 2010 Single-

Concentration Tests Show Synergism Among Bacillus thuringiensis subsp. israelensis Toxins Against the Malaria

Vector Mosquito Anopheles albimanus. J Invertebr Pathol 104:231-233

6. Muñoz-Garay C., Soberón M. and Bravo A. 2010 Mode of action of Bacillus thuringiensis genetically modified

Cry1AbMod and Cry1AcMod toxins: role of alkaline pH in toxin oligomerization. Southwestern Entomologist 35: 383-

386

7. Gómez I., Arenas I., Pacheco S., Bravo A., and Soberon M. 2010. New insights into the mode of action of Cry1Ab toxin

used in transgenic insect-resistant Crops. Southwestern Entomogist.35: 387-390.

8. Vazquez A. Yanez G.N., Lopez M.E., Mendoza P., Liebano, E., Bravo, A. 2010. Biochemical characterization of two

purified proteins of the IB16 Bacillus thuringiensis strain and their toxicity against the sheep nematode Haemonchus

contortus in vitro. Transbound Emerg Dis 57: 111-114

9. Soberon M., Pardo L. Munoz-Garay C., Sanchez J., Gomez I., Porta H., Bravo A. 2010. Pore formation by Cry toxins

Adv. Exp. Med. Biol., 677: 127-142.

10. Canton P.E., Reyes E.Z., RuizdeEscudero I., Bravo A., Soberón M. 2011 Binding of Bacillus thuringiensis subsp.

israelensis Cry4Ba to Cyt1Aa has an important role in synergism Peptides 32: 595-600

11. Porta H., Cancino-Rodezno A., Soberón M. and Bravo A. 2011 Role of MAPK p38 in the cellular responses to Pore

Forming Toxins. Peptides 32:601-606

12. Likitvivatanavong S., Chen J., Bravo A., Soberón M. and Gill S. S. 2011 Cadherin, alkaline phosphatase and

aminopeptidase N as receptors of Cry11Ba toxin from Bacillus thuringiensis jegathesan in Aedes aegypti. Appl Environ

Microbiol 77: 24-31

13. Terenius O., A. Papanicalou; J.S Garbutt; I. Eleftherianos; H.Huvenne; M. Albrechtsen; C. An; J-L. Aymeric; A.

Barthel; P. Bebas; K. Bitra; A. Bravo; F. Chevalier; DP Collinge; CM Crava; RA de Maagda; BDuvic; M Erlandson; I

Faye; G Felföldi; H Fujiwara; R Futahashi; AS Gandhe; HS Gatehouse; LN Gatehouse; J Giebultowicz; I Gómez; CJ

Grimmelikhuijzen; AT Groot; F Hauser; G Heckel; DD Hegedus; S Hrycaj; L Huang; JJ Hull; K Iatrou; M Iga; MR

Kanost; J Kotwica; C Li; J Li; M Lundmark; S Matsumoto; M Meyering-Vos; PJ Millichap; A Monteiro; N Mrinal; J

Nagaraju; T Niimi; D Nowara; A Ohnishi; V Oostra; K Ozaki; M Papakonstandinou; A Popadic; MV Rajam; S Saenko;

RM Simpson; M Soberón; MR Strand; S Tomita; U Toprak; P Wang; CW Wee; S Whyard; W Zhang; RH ffrench-

65

Constant; S Herrero; K Gordon; L Swevers; G Smagghe. 2011. RNA interference; Lepidoptera; delivery methods; tissue

uptake; gene function; dsRNA Properties. J. Insect Physiol. 57: 231-245

14. Likitvivatanavong S., Chen J., Evans A.E., Bravo A., Soberón M. and Gill S. S. 2011 Multiple receptors as targets of

Cry toxins in mosquitoes. J Agric Food Chem 59: 2829-2838

15. Rodriguez-Almazan C., Ruiz de Escudero I., Canton E., Muñoz-Garay C., Pérez C., Gill S.S., Soberón M., and Bravo A.

2011. The amino- and carboxyl-terminal fragments of the Bacillus thuringiensis Cyt1Aa toxin have differential roles on

toxin oligomerization and pore formation. Biochemistry. In Press

16. Bravo A., Likitvivatanavong S., Gill S. S., and Soberón M. 2011 Bacillus thuringiensis: a story of a successful

bioinsecticide. Insect Biochem Mol Biol 41: 423-31.

17. Zavala L.E., Pardo-López L., Cantón P.E., Gómez I., Soberón M. and Bravo A. 2011 Domains II and III of Bacillus

thuringiensis Cry1Ab toxin remain exposed to the solvent after Insertion of part of Domain I into the membrane. J Biol

Chem 286: 19109-19117

18. Carmona D., Rodríguez-Almazán C., Muñoz-Garay C., Portugal L., Pérez C., de Maagd R.A., Bakker P., Soberón M.

and Bravo A. 2011 In vivo heteroligomer formation of Bacillus thuringiensis Cry toxins PloSOne 2011;6(5):e19952.

Epub 2011 May 16.

19. Porta H., Jiménez G., Cordoba E., León P., Soberón M. and Bravo A. 2011.Tobacco plants expressing the Cry1AbMod

toxin suppressed the insect tolerance to Cry1Ab toxin of Manduca sexta cadherin-silenced larvae. Insect Biochem Mol

Biol 41: 513-519

20. Porta H., Muñoz-Minutti C., Soberón M. and Bravo A. 2011. Induction of Manduca sexta larvae caspases expression in

midgut cells by Bacillus thuringiensis Cry1Ab toxin. Psyche J Entomol doi:10.1155/2011/938249

21. Tabashnik B. E., Huang F., Ghimire M.N., Rogers L.B., Siegfried B.D., Rangasamy M., Yang Y., Wu Y., Gahan L.J.,

Heckel D.G., Bravo A., and Soberón M. 2011. Efficacy of genetically modified Bt toxins against insects with different

mechanisms of resistance. Nature Biotechnol In Press

22. Fernandez-R. M., Pena-Ch. G.. Romo-Martinez A., Hernandez-V. V., Bravo A., and De la Rosa D.P 2010. Evaluation

of Bacillus thuringiensis pathogenicity for a strain of the tick, Rhipicephalus microplus, resistant to chemical pesticides.

J Insect Science, 10: 186

23. Soberón M., Bravo A., and Gomez I. 2011 Role of GPI-anchored membrane receptors in the Cry toxins mode of action

In: Integrated Pest Management and Pest Control InTech - Open Access Publisher.

24. Bravo A., Del Rincon-Castro M.C., Ibarra J.E., and M. Soberón. 2011 Towards a healthy control of insect pest:

Potential use of Microbial insecticides. In: Green trends in insect control. O. López and Fernandez-Bolaños J.G. (Eds)

Royal Society of Chemistry UK. ISBN 978-1-84973-149-2 pp 266-299

26. Soberón, M. y Bravo, A. 2011 Control de insectos con Bacillus thuringiensis, un método efectivo y compatible con el

ambiente. En V CICLO MUJER CIENCIA pp 1-11

27. Cordoba E., Porta H., Medina L., Arroyo A., San Román C., Rodríguez-Concepción M. and León P. 2011. Functional

characterization of the three genes encoding 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate synthase in maize. J Exp Bot 63, 2023-

2028

Innovación* (2010-2011):

1. Soberón, M. Bravo, A., Gómez, I. Mutants of Cry1 genes from Bacillus thuringiensis and methods of use. United States

Patent application. Depositada Marzo 30, 2011.

2. Serrano Carreon L., Soberon Chavez M., Bravo de la Parra A. Composición de un insecticida para el control biológico de

larvas de mosquitos vectores de enfermedades con efectividad estabilizada. Instituto Mexicano de la Propiedad

Intelectual. Solicitud MX/a/20011/202100. Depositada 25 de Febrero del 2011.

Tesis Concluidas* (2010-2011):

A. Bravo:

1. Raquel Gabriela Arroyo Loranca. Licenciatura en Biología UNAM. Análisis de unión de toxinas Cry1A silvestres y

modificadas en larvas resistentes y sensibles a toxinas Cry de Pectinophora gossypiella y Plutella xylostella. Fecha

de examen: 15 Abril 2010

2.Gerardo del Toro de León. Licenciatura en Biología UNAM. Caracterización del espectro de acción de la toxina

Cry1Ab Mod , activa contra insectos resistentes y su comparación con la toxina convencional Cry1Ab de Bacillus

thuringiensis. Fecha de examen: 18 Agosto 2010

3. Luis Enrique Zavala Licenciatura en Biología UNAM. Análisis del fenotipo de dominancia negativa presentado por

algunas mutantes de la hélices alfa 4 de las toxinas Cry de Bacillus thuringiensis. 20 Mayo 2011.

4. María de los Angeles Cancino Rodezno Doctorado en Ciencias Bioquímicas/UNAM Caracterización de la respuesta

celular de Anopheles gambiae a la toxicidad de Bacillus thuringiensis subsp.israelensis Mayo 2010

66

5.Guadalupe Peña Chora. Doctorado en Ciencias Biológicas. Identificacion de nuevas endotoxins de Bacillus

thuringiensis para el control de la conchuela de frijol Epilachna varivestis Mulsant (Coleoptera: Coccinellidae).

Diciembre 2010.

6. Daniela Carmona León. Licenciatura en Biología UNAM. Aislamiento de mutantes de las toxinas Cry4 y Cry11 con

fenotipo dominante negativo. Programada para Enero 2012

Helena Porta:

1. Abiud Fuentes Cortés. Licenciatura en Biología UAEM. “Diseño y desarrollo de la toxina Cry3AaMod. Facultad de

Ciencias UAEM Programada para Febrero 2012.

Carlos Muñoz

1. José Natividad Aguilar Toribio. Licenciatura en Biología Univesidad de Guanajuato. Diseño y análisis de las toxinas

Cry11Aa de Bacillus thuringiensis afectadas en toxicidad y oligomerización. Abril 2010

2. Leivi Clara Portugal Luna. Maestría en Ciencias Bioquímicas UNAM Estudio del mecanismo de acción de las toxinas

Cry de Bacillus thuringiensis en la línea celular Cf-1 de insecto. Programada Enero 2012

Docencia* (2010-2011):

A.Bravo :

Participación como profesor en el Tópico CONTROL MICROBIOLOGICO DE PLAGAS UAEM, Centro de

Investigación en Biotecnología, Febrero 17 a Junio 10. 2010

Participación como profesor en el Taller de Investigación: La biología a partir de biomoléculas; Nuevos paradigmas y

aplicaciones 2010-1. Lic. en Biología. Fac. Ciencias. UNAM. 2010 y 2011

A.Bravo y L. Pardo :

Participación como profesores responsables del Tópico Selecto: “Viejas y nuevas tendencias en el uso de la

fluorescencia para el análisis estructural de las proteínas y sus procesos biológicos” Agosto-Diciembre 2010

Participación como profesores en el Tópico: Teoría y aplicaciones de la fluorescencia para el análisis dinámico de los

procesos biológicos. Posgrado en Ciencias Bioquímicas. IBT/UNAM Agosto-Diciembre 2011.

L. Pardo

Participación como profesor en el tópico Mecanismos de Internalización y control del Tráfico de Proteínas de Membrana

en Animales y Plantas, Posgrado en Ciencias Bioquímicas. IBT/UNAM Enero-Agosto 2011.

Participación como profesor en Curso Básico de Biología Molecular, Posgrado en Ciencia Bioquímicas. IBT/UNAM

Enero-Junio 2011

Helena Porta

Participación como invitada en el curso El RNA de interferencia: el mecanismo y sus aplicaciones: RNAi como

mecanismo de regulación post-transcripcional ¿Es un mecanismo de defensa inmune antiguo? 2011

Participación como invitada en el curso Mecanismos de Internalización y control del Tráfico de Proteínas de Membrana

en Animales y Plantas: Internalización de bacterias patógenas y sus toxinas 2011

Carlos Muñoz

Cuatro clases a nivel licenciatura. “canales ionicos en membranas biológicas”. Facultad de Ciencias Biológicas. UAEM

2011

Donativos* (2010-2011):

Alejandra Bravo

1. NHI, National Institutes of Health USA. S-000000142. 2005-2010 Mechanism of mosquitocidal action of Bacillus

thuringiensis. Colaboración con UC Riverside USA

2. PAPIIT DGAPA, IN206209. 2009-2011. Análisis molecular del proceso de oligomerización de las toxinas Cry

producidas por Bacillus thuringiensis.

3. NRI National Research Initiative. USA. USDA CREES 2008-03980. 2009-2012 Understanding and countering insect

resistance with modified Bt toxins. Colaboración con Arizona University USA

4. SEP - CONACYT 128883. 2011-2014 Análisis de las respuesta celular en insectos ante el ataque de las toxina

insecticidas de Bacillus thuringiensis.

5. CONACyT C0005-2011-01 164335 PRINV DST-CONACYT, MEXICO S&T Cooperation Programme Application for

Joint Research Proposals. Mechanism of resistance in pink bollworm to Cry 1Ac expressing Bt cotton and development

of molecular diagnostics tools for resistance monitoring. Colaboración con Arizona University USA

6. NHI National Institutes of Health. 2R01 AI066014-06 2010-2015 Mechanism of mosquitocidal action of Bacillus

thuringiensis. Colaboración con UC Riverside USA.

Helena Porta

67

PAPPIT IN218610, 2010 Caracterización del proceso de muerte celular en respuesta a las toxinas Cry1Ab en las larvas

de Manduca sexta y Cry11Aa en la línea celular de Anopheles gambiae 4A34,

Liliana Pardo

CONACyT J45863-Q. 2009-2012. Supresión de resistencia en insectos hacia las toxinas Cry de Bacillus thuringiensis

utilizando toxinas CryMod que no requieren de interacción con el receptor primario.

DGAPA-UNAM IN218409 2008-2011. Estudio de los cambios conformacionales de las toxinas Cry de Bacillus

thuringiensis al oligomerizar y al insertarse en la membrana.

Carlos Muñoz

PAPIIT-DGAPA IN222308 2007-2010. Estudio de la toxicidad celular de las proteínas Cry de Bacillus thuringiensis

mediante adquisición de imagen y registros electrofisiológicos.

SEP-CONACyT. 84648, 2008-2011. Caracterización de la respuesta intracelular vía segundos mensajeros inducida por

las toxinas Cry de Bacillus thuringiensis en células blanco.

Premios y Distinciones* (2010-2011):

Alejandra Bravo :

Premio L’oreal-UNESCO Awards for Women in Science 2010. 4 Marzo 2010

Helena Porta

Promoción Investigador Titular "B" TC Octubre 2011

Otras actividades relevantes* (2010-2011):

Alejandra Bravo :

1. Miembro de Steering Committee de Bacillus-ACT Desde 2011

2. Editor de ISRN Toxicology. Desde 2011

3. Editor PlosONE. Desde 2011

4. Coordinador de sección de Biología de la Academia Mexicana de Ciencias. Bienio 2010-2012

5. Miembro del Consejo Consultivo Científico de CIBIOGEM. Desde 2010

6. Miembro del jurado en el Premio AgroBio México 2010 y 2011

7. Miembro del “International cry Gene Nomenclature Committee” Desde 1999.

http://epunix.biols.susx.ac.uk/Home/Neil_Crickmore/Bt/index.html

8. Editor de Revista Colombiana de Entomología. Desde 2003.

9. Editor de Bioengineered Bugs. Desde 2008.

10. Editor de World Journal of Biological Chemistry. Desde 2009.

Liliana Pardo

Estancia Sabática en el Instituto Cochin en Francia 2011

.

68

Grupo Dr. Enrique Merino (Miércoles 14, de 13:15 a

13:45 hrs.).

Título de la Plática:

Regulación de la expresión génica basada en moléculas de RNA.

Los organismos vivos se caracterizan por su capacidad para responder a diferentes tipos de estímulos. Desde las bacterias unicelulares más sencillas, hasta los animales más complejos, los organismos son capaces de percibir cambios en su entorno y responder en consecuencia de manera adecuada. Muchas de estas respuestas incluyen cambios en los niveles de expresión de los genes: la expresión de los genes que se transcriben activamente puede ser reprimida, mientras que la expresión de otros que se encontraban en una etapa latente, pueden ser activados. En los organismos bacterianos, esta regulación se determina principalmente a nivel de la iniciación de la transcripción y es comúnmente mediada por proteínas reguladoras. Sin embargo, estudios genómicos recientes han revelado la existencia de diversos sistemas de regulación basados en moléculas de RNA que pueden actuar tanto en cis, como en trans. Referente a nuestros análisis de elementos de regulación que actúan en cis, presentaremos una nueva estrategia para la asignación funcional de los genes basada en la identificación de riboswitches bacterianos, con principal énfasis en el riboswitch T-box. Respecto a los elementos de regulación de RNA que actúan en trans, mostraremos nuestros resultados en la caracterización de RNAs pequeños (sRNAs) artificiales y el papel que tiene la chaperona de RNA Hfq en el reconocimiento de estos RNAs por sus mRNA blancos. En base a los resultados de los estudios antes mencionados, en la parte final de nuestra plática, presentaremos una nueva aproximación dentro de la Biología Sintética para el desarrollo de circuitos genéticos basados en moléculas de RNA.

Integrantes del Grupo (2010-2011):

Investigadores:

Alejandro Garciarrubio

Rosa María Gutiérrez

Enrique Merino

Técnicos Académicos:

María Luisa Tabche

Ricardo Ciria

Técnicos pagados por donativos:

Dávida Alejandro Abdala

Nancy Mena

Postdoctoral:

Raúl Noguez

Estudiantes de Doctorado Ana Gutiérrez

Blanca Itzel Taboada

Eugenio López

José Alfredo Morales

José Luis Rodríguez

Mario Alberto Martínez

Patricia Oliver

Ricardo Ciria

Zuemy Rodríguez

69

Estudiantes de Maestría:

Alejandro Granados

Alma Valle

Carlos Daniel Vázquez

Christian Eduardo Martínez.

Jorge Enrique Quintana

Karla

Viridiana Avila Magaña

Titulo de los Carteles:

Information processing in the Bacillus subtilis signaling network. A. Granados-Castro, W. Fontana and R. Gutiérrez-Ríos.

Publicaciones (2010-2011):

Taboada, B. Ciria, R. Martinez-Guerrero, C.E. Merino, E. 2011. ProOpDB: Prokaryotic Operon DataBase Nucleic

Acids Res, Nov 16. doi: 10.1093/nar/gkr1020

Guerra-Crespo,M. Perez-Monter,C. Janga,S.C. Castillo-Ramirez,S. Gutierrez-Rios, R.M. Joseph-Bravo, P. Prez-

Martinez,L. Charli,J.L. 2011. Transcriptional profiling of fetal hypothalamic TRH neurons BMC Genomics, 12, 222.

Medina-Aparicio,L. Rebollar-Flores,J.E. Gallego-Hernandez,A.L. Vazquez,A. Olvera,L. Gutierrez-Rios, R.M. Calva,E.

Hernandez-Lucas,I. 2011. The CRISPR/Cas immune system is an operon regulated by LeuO, H-NS and LRP in Salmonella

enterica serovar Typhi. J Bacteriol, 193, 2396-2407.

Taboada, B. Verde, C. Merino, E. 2010. High accuracy operon prediction method based on STRING database scores.

Nucleic Acids Res., 3812.

Martinez-Nunez, M.A. Pérez-Rueda, E. Gutierrez-Rios, R.M. and Merino, E. 2010. New insights into the regulatory

networks of paralogous genes. Microbiology, 156, 14-22.

Tesis Concluidas (2010-2011):

Christian Eduardo Martínez. Maestría. Maestría en Ingeniería y Ciencias Aplicadas del Centro de Investigaciones en

Ingeniería y Ciencias Aplicadas. Universidad del Estado de Morelos. Desarrollo de software bioinformático

(METAGRAPH) para la visualización de proteínas homólogas en metagenomas”. Fecha de titulación: 23 de Noviembre del

2011. Tutor: Enrique Merino.

Viridiana Avila Magaña. Maestría en Ciencias Bioquímicas-UNAM. Identificación in silico de nuevos sitos de entrada

internos para el ribosoma en genomas eucariontes. Fecha de titulación: 28 de octubre del 2011. Tutor: Enrique Merino.

Mario Alberto Martínez. Doctorado en Ciencias Bioquímicas-UNAM. Divergencia de los sistemas de regulación en

secuencias parálogas en bacterias: una perspectiva genómica Fecha de titulación: 26 de agosto del 2011. Tutor: Enrique

Merino.

Alejandro Granado. Licenciatura. Licenciatura en Ciencias Genómicas. UNAM. VATReS Visualization and statistical

tools for regulatory DNA sequences analysis. Fecha de titulación: 23 de febrero del 2011. Tutora: Rosa María Gutiérrez.

70

Javier Morales-Barrera. Licenciatura en Ingeniería en Computación. Instituto Tecnológico de Zacatepec. Herramienta

gráfica para la representación y análisis de motivos de Regulación. GETMORE: Graphic. Environment Tool for MOtifs

REpresentation. Fecha de titulación: 24 de enero del 2010. Tutora: Rosa María Gutiérrez.

Docencia* (2010-2011):

- Rosa María Gutiérrez (responsable). Genomics and Bioinformatics: A Practical Course in Sequence Data Analysis.

Maestría y Doctorado en Ciencias Bioquímicas. 46 horas al semestre. Período: 16/08/2010 a 20/12/2010.

- Enrique Merino (expositor). Curso Teórico-Práctico. II Escuela regional de Microbiología. Instituto de Investigaciones

Biológicas “Clemente Estable” Montevideo, Uruguay. Período: 12 al 24 de setiembre del 2011.

- Rosa María Gutiérrez y Enrique Merino (Participación). Curso de Regulaciónde la Expresión Génica en Bacterias.

Maestría Doctorado en Ciencia Bioquímicas. 3 horas al semestre. Período: 26/05/2011 a 26/05/2011.

- Rosa María Gutiérrez (responsable). Herramientas bioinformáticas en el estudio de la regulacióntranscripcional en

procariotes. Maestría y Doctorado en Ciencias Bioquímicas. Período: 13/05/2011 a 20/05/2011.

- Rosa María Gutiérrez y Enrique Merino (Participación). Maestría y Doctorado en Ciencias Bioquímicas. 6 horas al

semestre 08/06/2011 a 09/06/2011.

Donativos* (2010-2011)

Entidad financiadora: CONACyT.

Título: Generacióny comparaciónde modelos de regulación transcripcional para la red de Escherichia coli y Bacillus

subtilis y su consistencia con análisis de datos de

expresiónglobal y experiementos de RT-PCR.

Responsable: Rosa María Gutiérrez.

Clave: 58840.

Monto: $ 876,537.00 Pesos

Inicio: 01/09/2008

Término: 01/09/20010

Entidad financiadora: DGAPA-UNAM

Título: Generación de modelos de regulación de la transcripción en Bacillus subtilis y Escherichia coli, análisis

comparativo y su corroboración experimental.

Responsable: Rosa María Gutiérrez

Clave: IN215808.

Monto: $ 563657.00 Pesos

Inicio: 01/01/2008

Término: 01/01/2011.

Entidad financiadora: DGAPA-UNAM

Título: Generación de modelos de regulación de la transcripción en Bacillus subtilis y Escherichia coli, análisis

comparativo y su corroboración experimental.

71

Responsable: Rosa María Gutiérrez

Clave: IN212708.

Monto: $ 200000.00 Pesos (del primer periodo)

Inicio: 01/01/2011

Término: 01/01/2013.

Entidad financiadora: Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología.

Título: Identificación in silico y caracterización molecular, estructural y cinética de elementos de regulación de la expresión

genética basada en riboswitches.

Responsable: Enrique Merino Pérez

Monto: $2,747,020.00

Clave: 60127

Inicio. 01/01/2008

Término. 01/01/2010.

Entidad financiadora: Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología.

Título: Riboswitches como blancos de nuevos agentes antimicrobiano

Monto: $1,542,867.00

Responsable: Enrique Merino Pérez

Clave: 68992

Inicio. 01/02/2008

Término. 01/03/2010.

Premios y Distinciones* (2008-2010) por 3 años fue top cited.

Top Cited Article 2008- 2010. Revista Plamid. Elsevier. Cevallos,M.A. Cervantes-Rivera,R. Gutierrez-Rios,R.M. 2008. The

repABC plasmid family Plasmid, 60, 19-37.

Otras actividades relevantes* (2010-2011)

Enrique Merino. Miembro del Comité local de evaluación de las becas posdoctorales PEW.

72

Grupo Dr. José Luis Puente (Jueves 15, de 9:00 a 9:30

hrs.).

ECP, una fimbria ubicua en Escherichia coli

Integrantes del grupo 2010-2011

Personal Académico

Dr. Víctor H. Bustamante Santillán. Investigador Titular A.

Dr. Alejandro Huerta Saquero. Investigador Asociado C.

Biol. Francisco J. Santana Estrada. Técnico Académico Titular A.

Dr. Javier Oviedo Boyso. Estancia Posdoctoral.

Dr. Víctor Antonio García Angulo. Estancia Posdoctoral Temporal.*

Estudiantes

Rafael Jiménez Mejía. Doctorado.*

Cristina Lara Ochoa. Doctorado.

Luary C. Martínez Chavarría. Doctorado (VHB).

Verónica I. Martínez Santos. Doctorado.

Abraham Medrano López. Doctorado.

Sara Berenice Martínez Luna. Doctorado.

Carmen A. Contreras García Doctorado

Aurora Labastida Martínez. Maestría.

Irene J. Palacios Velázquez. Maestría (VHB).

Jaime Enrique Bello Díaz. Maestría.

Andrés Escalera Maurer. Licenciatura (VIM).

Sara Betania Cruz Migoni. Licenciatura (RJM).*

Paola Sofía Kuri Rodríguez. Licenciatura (LMC).*

Claudia Denise Cruz Lara Estancia de investigación (VHB).*

73

Juan Antonio Huerta Cabrera Estancia de investigación (AHS).*

Wendy Bandera García Estancia de investigación (AHS).

Personal Administrativo

Amapola Blanco Zavala. Proyectos.

Rosalva González Arenas. Secretaria.

Elvira Villa Herrera. Laboratorista.

Héctor Díaz Estrada. Laboratorista.*

Miguel A. Trujillo González Laboratorista.*

Raúl Ríos Muñoz Laboratorista.

*Terminaron su estancia en el laboratorio en el periodo.

Resumen

En el laboratorio estamos interesados en el estudio de patógenos bacterianos entéricos

causantes de enfermedades gastrointestinales y sistémicas. Salmonella enterica es el agente causal

de la salmonelosis o de infecciones sistémicas como la fiebre tifoidea. Escherichia coli

enteropatógena (EPEC) es uno de los principales agentes causales de diarrea en niños menores de 6

meses, mientras que E. coli enterohemorrágica (EHEC) puede causar colitis hemorrágica que con

frecuencia deriva en el síndrome urémico hemolítico, el cual puede ser fatal. Sin embargo, otros

patotipos de Escherichia coli diarreogénica, tales como E. coli enteroagregativa (EAEC) y

enterotoxigénica (ETEC), son también una causa importante de diarrea en zonas endémicas, sobre

todo en la población pediátrica. Cepas de EAEC generalmente producen diarrea mucosa persistente

y se han convertido en un problema a nivel mundial debido a su prevalencia en pacientes VIH

positivos y su importancia se evidenció aún más a partir de los brotes causados en el verano de 2011

en el norte de Europa por una nueva cepa EAEC O104:H4 productora de la toxina Shiga, lo cual

destaca, sin lugar a dudas, la importancia de las especies patógenas de E. coli y la plasticidad de sus

genomas que permite la aparición de variantes con nuevas capacidades para causar enfermedad, así

como la necesidad de comprender mejor la función de los factores de virulencia putativos presentes

en el pangenoma de E. coli.

En colaboración con el grupo del Dr. Jorge Girón de la Universidad de Florida, hemos

determinado que la mayoría de las E. coli comensales y patógenas producen una fimbria denominada

ECP (E. coli Common Pili) la cual promueve la adhesión y colonización de células epiteliales

humanas y animales en cultivo, la interacción de patotipos de E. coli con hojas de vegetales de

consumo, así como la interacción entre las bacterias para formar biopelículas. El ensamblaje de esta

fimbria se cree que ocurre por la vía chaperona-usher, pero a diferencia de otras fimbrias como la tipo

1 y pap, la biosíntesis de ECP se distingue porque requiere de dos chaperonas independientes, EcpB

y EcpE, así como por la presencia de una subunidad adicional denominada EcpD en la punta del

filamento formado por la subunidad principal EcpA, la cual potencialmente funciona como adhesina.

74

Esto es consistente con la capacidad de EcpD de unirse a proteínas de la matriz extracelular como

fibronectina, laminina, y colágeno. Por otro lado, en colaboración con el grupo del Dr. Steve Matthews

del Imperial College London, se resolvió la estructura cristalográfica de EcpA que reveló el

entrelazamiento que se establece entre las subunidades, probable base de su papel en la formación

de biopelículas. A su vez, hemos determinado que la expresión del operón ecpRABCDE es regulada

positivamente por la proteína EcpR, producto del primer gen del operón, así como por los reguladores

globales H-NS e IHF en forma negativa y positiva, respectivamente. Este proyecto ha permitido

abordar de manera multidisciplinaria el estudio de la estructura, función y regulación de una fimbria

ubicua en E. coli.

Título de los carteles

“Mecanismos Moleculares que Regulan la Expresión de Genes de Virulencia en Salmonella

enterica serovar Typhimurium (STM)”. Presenta Víctor H. Bustamante (coautores Luary C.

Martínez, Irene Palacios).

"Sobre el papel de SepL y Tir en la regulación transcripcional y la secreción de proteínas translocadoras y efectoras en EPEC". Presenta Alejandro Huerta Saquero (coautores Abraham Medrano, Wendy Bandera).

Publicaciones

Deng W, de Hoog CL, Yu HB, Li Y, Croxen MA, Thomas NA, Puente JL, Foster LJ, Finlay BB. (2010). A comprehensive proteomic analysis of the type III secretome of Citrobacter rodentium. J Biol Chem. 285(9): 6790-6800.

Jiménez, R., Cruz-Migoni, S.B. Huerta-Saquero, A., Bustamante, V.H. and Puente, J.L. (2010). Molecular characterization of GrlA, a specific positive regulator of ler expression in Enteropathogenic Escherichia coli. J. Bacteriol. 192 (18): 4627–4642.

Xicohtencatl-Cortes, J., Deng, W., Freer, E., Finlay, B.B., Puente, J.L. and Girón, J.A. (2010). Bacterial Macroscopic Amyloid-like Fibers with Cytotoxic and Adhesive Properties. J. Biol. Chem. 285(42): 32336-32342

Lara-Ochoa, C., Oropeza, R., Huerta-Saquero, A., (2010). Regulation of the LEE-pathogenicity island in attaching and effacing bacteria en: Mendez-Vilas,A. Current Research, Technology and Education Topics in Applied Microbiology and Microbial Biotechnology. Badajoz. Formatex Research Center. pags. 635-645.

Rojas-López, M., Arenas-Hernández, M.P., Medrano-López, A., Martínez de la Peña, C.F., Puente, J.L., Martínez-Laguna, Y. and Torres, A.G. (2011). Regulatory control of Escherichia coli O157:H7 lpf1 operon by H-NS and Ler. J. Bacteriol. 193: 1622-1632.

Martínez-Chavarría, L.C., Yakhnin, H., Camacho, M.I., Georgellis, D., Babitzke, P., Puente, J.L. and Bustamante, V.H. (2011). Integration of a complex regulatory cascade involving the SirA/BarA and Csr global regulatory systems that controls expression of the Salmonella SPI-1 and SPI-2 virulence regulons through HilD. Mol. Microbiol. 80(6):1637-1656.

Saldaña, Z., Sánchez, E., Xicohtencatl-Cortes, J., Puente, J.L. and Girón, J.A. (2011). Surface structures involved in plant stomata and leaf colonization by Shiga-toxigenic Escherichia coli O157:H7. Front. Microbio. 2:119. doi: 10.3389/fmicb.2011.00119

Bustamante, V.H., Villalba, M. García-Angulo, V.A., Vázquez, A., Martínez, L.C., Jiménez, R. and Puente, J.L. (2011). PerC and GrlA independently regulate Ler expression in enteropathogenic Escherichia coli. Mol. Microbiol. 82, 398-415.

75

Tenorio-Salgado, S., Huerta-Saquero, A., and Pérez-Rueda, E. (2011). New insights on gene regulation in archaea. Comput Biol Chem, 35, 341-346.

Cevallos, M.A. y Puente, J.L. (2011). La nueva epidemia: los pepinos presuntos culpables. ¿Cómo ves?. 154: 10-15.

Tesis concluidas

Licenciatura

Paola Sofía Kuri Rodríguez. Biología. Fac. de Ciencias, UNAM. Examen: 12 de septiembre de 2010 (Tutor M. en C. Luary C. Martínez).

Sara Betania Cruz Migoni. Biología. Fac. de Ciencias, UNAM. Examen: 29 de Mayo de 2009. (Tutor M. en C. Rafael Jiménez Mejía).

Doctorado

Rafael Jiménez Mejía. Doctorado en Ciencias Bioquímicas. Examen: 10 de Septiembre de 2010.

Luary C. Martínez Chavarría. Doctorado en Ciencias Bioquímicas. Examen: 15 de Diciembre de 2011 (Tutor Dr. Víctor H. Bustamante).

Docencia

José Luis Puente

Responsable y profesor del taller "La Biología a partir de las biomoléculas; nuevos paradigmas y aplicaciones", niveles I, II, III y IV. Licenciatura en Biología. Facultad de Ciencias, UNAM. Semestres 20010-2 a 2012-1.

Profesor y responsable de la asignatura optativa Fisiología Microbiana. Facultad de Ciencias, UNAM. Sem. 2010-2 y 2011-2 (junto con Ricardo Oropeza).

Participación en el Curso “Enfermedades emergentes”. Maestría en Salud Pública (responsable Dra. Victoria Pando), con el tema “Escherichia coli enterohemorrágica” Instituto Nacional de Salud Pública. Sem. 2011-2.

Participación en el Tópico “Mecanismos de Persistencia de Infecciones Bacterianas”. Doctorado en Ciencias Biomédicas (responsable Dra. Yolanda López-Vidal. con el tema "Escherichia coli enterohemorrágica". Fac. Medicina, UNAM. Sem. 2012-1.

Participación en el Tópico “Regulación bacteriana mediada por sistemas de dos componentes” Posgrado en Ciencias Bioquímicas (responsable Dr. Daniel Segura), con el tema "Cascadas reguladoras en Escherichia coli enteropatógena". IBt, UNAM. Sem. 2012-1.

Participación en el Curso “Bacteriología”. Maestría en Salud Pública (responsable Dra. Gabriela Echaniz), con el tema “Enterobacterias” Instituto Nacional de Salud Pública. Sem. 2012-1.

Víctor H. Bustamante

Participación en el curso básico de Biología Molecular con el tema Regulación de la expresión genética en procariontes. Posgrado Ciencias Bioquímicas. Sems. 2010-2 a 2012-1.

76

Responsable del Tópico “Mecanismos de regulación de la expresión génica en bacterias” (junto con Cinthia Núñez). Sem. 2011-2.

Participación en el tópico selecto “Regulación bacteriana mediada por sistema de dos componentes”, Posgrado Ciencias Bioquímicas. Sem. 2011-2.

Alejandro Huerta

Responsable del Tópico “Herramientas bioinformáticas en el estudio de la regulación transcripcional en procariotes” (junto con Ernesto Pérez Rueda). Posgrado en Ciencias Bioquímicas. Sem. 2011-2.

Participación en el Tópico “Enterobacterias”. Posgrado en Ciencias. Instituto Nacional de Salud Pública. Sem. 2011-1.

Participación en el Curso: “Ácidos Nucleicos”. Posgrado en Ciencias. Facultad de Ciencias, UAEM. Sem. 2011-1. Donativos

Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACyT). Clave 60796. 2007-2010 (JLP).

National Institutes of Health (NIH). Subaward Number: P451457. 2006-2011. (JLP en colaboración con el Dr. Jorge Girón, University of Florida).

Dirección General de Asuntos del Personal Académico (DGAPA). Clave IN227410. 2010-2012 (JLP).

Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACyT). Clave 154287. 2012-2014 (JLP).

Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACyT). Clave 83277. 2009-2012 (VHB).

Dirección General de Asuntos del Personal Académico (DGAPA). Clave IN210309-3. 2009-2012 (VHB).

Iniciativa de Apoyo Complementario a la Realización de la Obras Determinadas (IACOD-DGAPA). (AHS).

Distinciones

Luary C. Martínez. Corporate Activities Program Student Travel Grants, por su trabajo presentado en

el 4th Congress of European Microbiologists, FEMS 2011. Ginebra, Suiza. Junio de 2011.

-Víctor H. Bustamante. Definitividad. Septiembre de 2011.

-Víctor H. Bustamante. Miembro Emérito del Sistema Estatal de Investigadores. Consejo de Ciencia y

Tecnología del Estado de Morelos. Gobierno del Estado de Morelos. Febrero de 2010.

-José Luis Puente. Review Editor, Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. 2010.

-José Luis Puente. Fundador de la Rama y miembro del comité organizador del primer congreso

(junto con los Drs. Guadalupe Espín, Bertha González-Pedrajo, Edmundo Calva y Dimitris Georgellis).

2010

Otras actividades relevantes

Consejo Interno del Instituto de Biotecnología

Jefe del Departamento de Microbiología Molecular.

Presidente de la Comisión Permanente de Ingreso y Egreso al Posgrado (CPIEP), Instituto de

77

Biotecnología, UNAM.*

Subcomité Académico del Programa de Ciencias Bioquímicas, IBt, UNAM.*

Comisión Dictaminadora del PRIDE del Instituto de Ecología, UNAM.*

Comisión Dictaminadora del Centro de Ciencias Genómicas, UNAM.

78

Grupo Dr. Baltazar Becerril (Jueves 15, de 9:30 a 10:00

hrs.).

Resumen del grupo del Dr. Baltazar Becerril

Título de la presentación:

“Escudriñando la intimidad de los anticuerpos”

INTEGRANTES DEL GRUPO

Posdoctorales:

Lidia Riaño Rivelino Juárez

Técnicos Académicos:

Timoteo Olamendi, Ernesto Ortiz, Rosalba Sánchez y Leopoldo Guereca

Estudiantes de Licenciatura: Ilse Gómez Estudiantes de Posgrado: Santos Ramírez Myriam Villalba Everardo Rodríguez Oscar Luna Jonathan Arredondo Personal Administrativo: Linda Solaris Maria del Carmen Martínez Marisol Chévez Resumen de la presentación:

A partir de un banco de fragmentos de anticuerpos humanos de cadena sencilla (scFv) desplegados en fagos filamentosos y sometidos a diferentes ciclos de evolución dirigida, hemos generado una familia de variantes (familia 3F), capaces de neutralizar las principales toxinas y los venenos de alacranes mexicanos. En particular las variantes llamadas 6009F y 9004G, neutralizan cada una por sí misma los venenos de Centruroides noxius y Centruroides suffusus sufussus. Con el objeto mejorar las propiedades terapeúticas de esta familia de variantes, se implementaron dos estrategias. Por un lado se incorporó un residuo clave (F101 VH) de 6009F en 9004G dando lugar a la variante LR, la cual se vio mejorada tanto en su afinidad por la toxinas Cn2 y Css2 como en su estabilidad termodinámica. También mejoró su capacidad para neutralizar a los respectivos venenos. Por otro lado, se generó la forma dimérica de 6009F (dim6009F) con el propósito de contar con una variante equivalente a un anticuerpo completo en términos de su valencia (dos sitios de pegado por molécula). El dímero (dim6009F) resultó incapaz de neutralizar completamente los síntomas de envenenamiento en ratones a diferencia del monómero que sí lo logra. El dim6009F se sometió a varios ciclos de evolución dirigida obteniendo una variante llamada D4 la cual recuperó la capacidad de eliminar totalmente la sintomatología de envenenamiento. La secuencia de aminoácidos revela un solo cambio: E43G en el VH. Cuando este cambio se

79

introdujo en la variante LR se obtuvo LER, la cual tiene la capacidad de neutralizar 2LD50 de la toxina Cn2 en una relación molecular 1:1 (anticuerpo: toxina). La determinación de la estabilidad termodinámica de las variantes involucradas en este estudio por medio de calorimetría diferencial de barrido, reveló el siguiente orden: LER>D4>6009F>dim6009F. En su conjunto, estos resultados indican que el cambio de E a G mejora tanto la estabilidad como la afinidad independientemente del formato (monómero/dimero). El uso de herramientas de modelado y dinámica molecular nos permitieron dar una probable explicación del efecto de esta mutación: un rearreglo de redes de puentes de hidrógeno en la vecindad del residuo 43 VH. Otra familia de variantes (Familia C1), obtenida de manera similar a la familia 3F, es capaz de neutralizar a las principales toxinas (Cll1 y Cll2) del alacrán de Morelos y Guerrero (Centruroides limpidus limpidus), con una historia muy parecida. Asumimos que una mezcla de los mejores scFvs obtenidos hasta el momento, tenga la capacidad de neutralizar el veneno de alacranes del género Centruoides.

Título del cartel: Estudio de las bases estructurales y moleculares asociadas a las propiedades biofísicas y fibrilogénicas de las cadenas ligeras lambda 3 y 6. Resultados de los M. en C. Oscar Daniel Luna Martínez y Miryam Villalba. Presentado por el M. en C. Oscar Daniel Luna Martínez

Publicaciones:

1. Alejandra Hernández-Santoyo, Luis del Pozo Yauner, Deyanira Fuentes-Silva, Ernesto Ortiz, Enrique Rudiño-Piñera, Rosana Sánchez-López, Eduardo Horjales, Baltazar Becerril, Adela Rodríguez-Romero. 2010 A single mutation at the sheet switch region results in conformational changes favoring λ6-light-chain fibrillogenesis. J. Mol. Biol. 396: 280-292.

2. Medecigo M, Manoutcharian K, Vasilevko V, Govezensky T, Munguia ME, Becerril B, Luz-Madrigal A, Vaca L, Cribbs DH, Gevorkian G. 2010 Novel amyloid- beta specific scFv and VH antibody fragments from human and mouse phage display antibody libraries. J. Neuroimmunol. 223:104-114

3. Lidia Riaño-Umbarila, Gabriel Contreras-Ferrat, Timoteo Olamendi-Portugal, Citlalli Morelos-Juarez, Gerardo Corzo, Lourival D. Possani, and Baltazar Becerril. 2011. Exploiting cross-reactivity to neutralize two different scorpion venoms with one single-chain antibody fragment. J. Biol. Chem. 286:6143-6151.

4. Juan Carlos Canul-Tec , Lidia Riaño-Umbarila, Enrique Rudiño-Piñera, Baltazar Becerril, Lourival D. Possani and Alfredo Torres-Larios (2011). Structural basis of neutralization of the major toxic component from the scorpion Centruroides noxius Hoffman by a human derived single chain antibody fragment. J. Biol. Chem. 286:20892-20900.

5. Itzel Amaro, Lidia Riaño-Umbarila, Baltazar Becerril, Lourival D. Possani.2011. Isolation and characterization of a human antibody fragment specific for Ts1 toxin from Tityus serrulatus scorpion. Immunol. Lett. 139:73-79.

6. V. Quintero-Hernández, E. Ortiz, M. Rendón-Anaya, E.F. Schwartz, B. Becerril, G. Corzo and L.D. Possani (2011). Scorpion and spider venom peptides: Gene cloning and peptide expression. Toxicon 58, 644–

663.

Tesis:

Para la obtención del título de Ingeniero en Biotecnología. Universidad Politécnica de Morelos. Caracterización de las variantes del scFv C1 que reconocen a las toxinas Cll1 y Cll2 del alacrán Centruroides limpidus limpidus. Presentada por Jonathan Noé Arredondo López, 5 de abril de 2011. La Dra. Lidia Riaño Umbarila fue la tutora principal

Para la obtención del grado de Maestro en Ciencias Bioquímicas. Optimización de la capacidad neutralizante del dímero 6009F contra la toxina Cn2 del veneno del alacrán C. noxius mediante evolución dirigida. Presentada por Everardo Remi Rodríguez Rodríguez el 18 de marzo del 2010. La Dra. Lidia Riaño Umbarila fue la tutora principal.

80

Docencia:

Biología Molecular. Participación en este curso dos veces cada año. Métodos en Biotecnología. Participación una vez durante 2010. Herramientas Bioinformáticas y Experimentales para el estudio de la estructura y función de las proteínas. Maestría y Doctorado en Ciencias Bioquímicas 5 horas a la semana (Responsable) Impartido en el IBT, UNAM de 10/08/2010 a 03/12/2010 Donativos: Proyecto IN217510 DGAPA-UNAM. Evaluación de la estabilidad termodinámica y de la fibrilogénesis in vitro de mutantes sitio específicas de las cadenas ligeras 6aJL2 y AR para explicar la alta tendencia a la agregación amiloide de la familia lambda VI. Duración 3 años . Fecha de Inicio 01/01/2010 Monto: $ 600, 000 Pesos ($ 200, 000 por año en 2010 y 2011).

Donativo de la Compañia Silanes (Instituto Bioclon) “Obtención de un antiveneno recombinante humano contra la picadura de alacranes mexicanos” $450,000 pesos por año durante 2010 y 2011. Proyecto CONACyT CB 155099 Convocatoria 2010. Modificación in vitro de la especificidad de dos anticuerpos (C1 y 3F): De reconocer a la toxina Cn2 a reconocer a las toxinas Cll1 y Cll2 Monto aprobado $ 1´556, 755 pesos Duración: 3 años

Patentes:

L. Riaño-Umbarila, E. Rodríguez, B. Becerril y L.D.Possani “Familia de variantes de anticuerpos recombinantes humanos que neutralizan a las toxinas de alacrán Cn2 y Css2 así como a los venenos respectivos: Centruroides noxius y Centruroides suffusus suffusus” , registrada bajo número de solicitud: Expediente MX/a/2011/009885, folio

MX/E/2011/065741 del 21 de septiembre de 2011, en México (IMPI).

Premios y distinciones:

Premio CANIFARMA 2010 en Investigación Tecnológica. “ Herramientas para el desarrollo de anticuerpos terapeúticos: bases estructurales de la neutralización del veneno del alacrán Centruroides noxius Hoffmann por medio de un anticuerpo tipo scFv” Otorgado por Cámara Nacional de la Industria Farmaceútica. MEXICO. 30/06/2011

81

Grupo Dr. Gustavo Pedraza (Jueves 15, de 10:00 a 10:30

hrs.).

Resumen Semana Académica Dic. 2011.

Consorcio de Neuroinmunobiología Dr. Gustavo Pedraza Alva

Título de la Plática: El inflamasoma: amigo o enemigo?

Resumen de la plática:

La inflamación es una respuesta homeostática fundamental, activada tanto por agentes externos (patógenos)

como internos (señales de alarma) durante alguna infección o daño tisular, respectivamente. Contrario a lo que

originalmente se pensaba, esta respuesta no es exclusiva del sistema inmune ya que ningún tejido, órgano o

aparato del cuerpo esta exento de este proceso.

En general la inflamación inicia con la producción de las citocinas pro-inflamatorias IL-1β e IL-18, a través de un

mecanismo dependiente de la activación de caspasa-1. A su vez, la activación de caspasa-1 es regulada por

un complejo multiproteico conocido como inflamasoma, este se ensambla cuando moléculas asociadas a

patógenos o a señales de daño son censadas por receptores intracelulares de la familia NLR (Nucleotide

binding and oligomerization domain (NOD)-, Leucine rich repeats (LRR)-containing Receptors) como NOD2,

NALP1 o NALP3. La interacción de los NLRs con sus ligandos promueven su asociación con la molécula

adaptadora ASC y con caspasa-1, llevando a la activación de esta última y promoviendo así la inflamación.

Una vez eliminado el patógeno o reparado el daño tisular se inician distintos procesos que controlan y

eventualmente terminan el proceso inflamatorio recuperándose la homeostasis. Sin embargo, cuando la

inflamación aguda es muy intensa y descontrolada puede ser fatal. En la exacerbación del proceso inflamatorio

también esta implicado el inflamasoma, ya que además de promover la producción de IL-1, también puede

iniciar un tipo de muerte celular conocido como piroptosis. Este último se caracteriza por la liberación del

contenido celular al espacio extracelular, generándose así una plétora de moléculas de alarma (nucleótidos,

ácido úrico, proteínas de choque térmico, proteínas de la familia de la HMBG1, entre otras) que incitan aún más

el proceso inflamatorio, resultando en la pérdida de la homeostasis y eventualmente en la muerte. Por el

contrario, cuando se da un proceso inflamatorio crónico, este puede contribuir al desarrollo de distintas

enfermedades como el síndrome metabólico, el cáncer e incluso, patologías neurodegenerativas como la

enfermedad de Alzheimer. A diferencia de la inflamación aguda, los mecanismos moleculares que inician y

mantienen la inflamación crónica que conlleva a estas patologías se desconocen en su mayoría.

Aquí revisaremos el papel del inflamasoma en la muerte de macrófagos inducida por la toxina letal de Bacillus

anthracis; así como, su posible implicación en la muerte de neuronas colinérgicas mediada por péptidos

amiloides y en la inflamación inducida por obesidad.

82

Integrantes del Grupo (2010-2011):

Académicos:

Dra. Lourdes Álvarez Arellano (Postdoctorado)

Oswaldo López Gutiérrez (Técnico)

Estudiantes:

Alan Fabricio Mendoza Peralta

Maestría en Ciencias Bioquímicas, UNAM

Cecilia Martínez Campos

Maestría Ciencias Bioquímicas, UNAM

Laura Montero León

Maestría en Medicina Molecular, IPN

Mireille Santamaría Herrera

Licenciatura, Facultad de Ciencias Biológicas, UAEM

Alfredo Núñez Rivera

Licenciatura, Facultad de Ciencias, UAEM

Lisi Flores Aguilar

Licenciatura, Facultad de Ciencias, UAEM

Yaxem López Sevilla

Licenciatura, Facultad de Ciencias, UNAM

Ana Laura Valdez Hernández

Licenciatura, Facultad de Ciencias, UNAM

Gabriela Figueroa Miranda

Residencia Profesional, Tecnológico de Estudios Superiores de Ecatepec

Christian Lizzet Ortiz de Ora Ortiz

Residencia Profesional, Universidad Politécnica del Estado de Moleros

Marco Antonio Rivas Pedraza

Servicio Social, Universidad Politécnica del Estado de Moleros

Administrativos

Clara Maritza Díaz Aldama

Manuel Saucedo Ramírez

María del Carmen Gante Villa

Titulo del Cartel: LOS microRNAs: PEQUEÑOS GRANDES REGULADORES DEL DESARROLLO, LA HOMEOSTASIS Y PATOLOGÍAS DEL SISTEMA NERVIOSO CENTRAL. Meza Sosa Karla, López Sevilla Yaxem y Díaz de León Sol.

Publicaciones (2010-2011):

Días de León, S., Pedraza-Alva, G. and Pérez-Martínez, L. (2011) In sickness and in health: the role of MeCP2 in the central nerveous system. Eur. J. of Neuroscience. 33, 1563-1574.

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Meza-Sosa, K. F., Valle-García, D. Pedraza-Alva, G. and Pérez-Martínez, L. (2011) The role of microRNAs in the central nerveous system development and fucntion. J. of Neuroscience Research Epub 2011 Sep 15. Pedraza-Alva, G., Mérida, L.B., del Rio, R., Fierro, N.A., Cruz-Muñoz, M.E., Olivares, N., Melchi E., Ingras, V., Holländer, G.A., Burakoff, SJ and Rosenstein, Y. (2011) CD43 regulates the thresholds for T cell activation by targeting Cbl functions. IUBMB Life. 63, 940-8

Tesis Concluidas (2010-2011):

Maestría:

Cecilia Martínez Campos, Programa de posgrado en Ciencias Bioquímicas. Instituto de Biotecnología, UNAM. Titulo de Tesis: Participación de la molécula CD43 en el rescate de la anergia inducida por las señales del TCR en linfocitos T. Mayo 2010 Laura Montero León, Maestría en Biomedicina Molecular. Escuela Superior de Medicina y Homeopatía, Instituto Politécnico Nacional. Titulo de tesis: El papel de la MAP cinasa p38 en la regulación del inflamasoma en macrófagos susceptibles y resistentes a la toxina letal de Bacillus anthracis Julio 2011 Licenciatura: Mireille Santamaría Herrera, Universidad Autónoma del Estado de Morelos, Facultad de Biología.

Titulo de Tesis: Participación de la molécula CD43 en la infección por Salmonella Typhimurium. Septiembre 2010 Alfredo Núñez Rivera, Universidad Autónoma del Estado de Morelos, Facultad de Ciencias. Titulo de Tesis: CD43 promueve proliferación celular a través de la vía de PI3K/AKT en tumores no-linfoides. Septiembre 2010 Lisi Flores Aguilar. Universidad Autónoma del Estado de Morelos, Facultad de Ciencias.

Titulo de Tesis: El papel del inflamasoma en la muerte de neuronas colinérgicas en respuesta a péptidos amiloides. Noviembre 2011 Docencia (2010-2011):

Coordinación del Curso Biología Celular. Semestres 2010-1, 2011-1

Participación en el Curso Biología Celular Semestres 2010-1, 2010-2, 2011-1, 2011-2

Tópico Selecto: Mecanismos moleculares que regulan la activación del sistema inmune innato. Semestre 2011-2

Participación en el Taller de la Facultad de Ciencias, UNAM: La Biología a partir de las biomoléculas: nuevos paradigmas y aplicaciones. Donativos (2010-2011): CONACYT 51198-M DGAPA IN227510 Divulgación: Video “La Magia de Merlin y los MicroRNAs” de Yaxem López Sevilla Enviado al concurso Proyecta tu Ciencia, tu pasión 2011, organizado por Mas Ciencia por México.

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Grupo Dr. Enrique Rudiño (Jueves 15, de 11:00 a 11:30

hrs.).

Título de la presentación:

“Usando heterodoxamente a la determinación estructural de rayos X”

INTEGRANTES DEL GRUPO

Estancia Sabática:

Rosario Adelaida Muñoz Clares (Fac. de Química, UNAM, 2010-2011)

Posdoctorales:

Martiniano Bello Ramírez Alejandro Torres Gavilán

Técnicos Académicos:

Sonia Patricia Rojas Trejo

Estancias Edar Onam Pech Santiago (UniMar, 2011) Fátima Ugalde Mercado (UPEMOR, 2011) Norman Antonio Morales Costales (UPEMOR, 2011) Servicio Social José Ramón Ruiz Martínez (UAEM, 2011) Estudiantes de Licenciatura: Mónica Patricia Mejía López (Graduada, Marzo 2010) Nizaa Jiménez Arroyo Estudiantes de Posgrado: Eleuterio Benítes Zaragoza (Maestría-Graduado, enero 2010) Adam Andrés Campos Acevedo (Maestría) Eduardo Rosas Benítez (Maestría) Eugenio De la Mora Lugo (Doctorado) Hugo Javier Serrano Posada (Doctorado) Andrés Zarate Romero (Doctorado) Alonso Alexis López Zavala (Doctorado conjunto CIAD-Hermosillo) Personal Administrativo: Irma Verónica Aldama Flores Graciela Blancas Naranjo (hasta 2011) Juan Monroy Mendoza Mariana Ortiz Ramirez Resumen de la presentación:

La cristalografía de rayos X se ha consolidado, a nivel mundial, como la técnica más exitosa para determinar la estructura tridimensional de macromoléculas biológicas –particularmente de proteínas-, siendo utilizada en el

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85.5 % de las casi 70,000 estructuras depositadas en el Protein Data Bank (PDB). Sus resultados son de gran importancia para cualquier estudio biológico o químico moderno, desde ciencia básica hasta aplicaciones biotecnológicas, en el que alguna enzima esté involucrada. Desafortunadamente, la aportación nacional al número total de estructuras proteicas determinadas por medio de esta técnica es marginal –menos de 90 estructuras determinadas y depositadas en el PDB-. Por lo que el desarrollo de esta actividad debería ser prioritario en el marco de la ciencia bioquímica mexicana. El uso de la técnica dista mucho de ser simple: una vez que los problemas relacionados con la obtención del espécimen fueron superados –purificación de la muestra y cristalización de la misma- es necesario predeterminar el método de obtención de fases que se empleara, y con base en él, diseñar el experimento de colecta de datos. Si se cuenta con un modelo que se presume es homologo estructural de la molécula problema, el reemplazo molecular (RM) es la técnica de selección. En fechas recientes el grupo de programas habituales para determinar fases por RM (Xplor, CNS, Amore, etc.) se ha expandido con una serie de programas que incluyen nuevas técnicas como las “locked self rotation functions” (el cual permite sacar provecho de la detección temprana de simetrías no cristalográficas –SNC-) y funciones de “maximun likelihood” que han permitido expandir las capacidades reales de la técnica (MolRep, Phaser, Queen of Spades, Phenix, etc.). En caso de que no se cuente con un modelo inicial de búsqueda, la determinación de fases depende de la utilización de métodos isomórficos (SIR, MIR, RIP), o bien, de extracción de señal anómala (SAD, MAD). Sin embargo, la filosofía de trabajo al enfrentar cada una de estas técnicas es completamente diferente a la que se emplea en RM. Más aun, el número de casos en que el uso de estas técnicas no da como resultado el grupo correcto de fases no es despreciable, por lo que la combinación de señales parciales provenientes de diferentes fuentes, con el fin de determinar una estructura, va en aumento (SIRAS, MIRAS, MRSAD, RIPAS). Por otro lado el uso de estos “métodos directos”, implica la necesidad de aumentar el tiempo de exposición de los cristales a los rayos X, ya sea para completar el grupo de pares de Bijvoet (SAD, MAD), o bien para colectar la señal a diferentes longitudes de onda (MAD). Como consecuencia directa de estos procedimientos, el uso cada vez más común de radiación sincrotrón, y la presencia (natural o artificial) de átomos “pesados” (Se para MAD; Hg, Pt, Au, Ag, Cu, Fe, etc.), los problemas de decaimiento en la señal de difracción debidos a la dosis de radiación depositados en el cristal son cada vez más importantes y constantes, incluso a temperaturas de 100 K. Dentro de la cascada de eventos desencadenados por diferentes dosis de radiación en un cristal proteico, la generación de radicales libres es determinante de la vida útil de un cristal dado. Dentro de estas especies generadas, la presencia de “electrones hidratados” es muy importante. Por lo tanto en cualquier estructura determinada por rayos X, la reducción efectiva del sistema es un hecho consumado. Adicionalmente, en el caso de que la proteína en cuestión presente centros metálicos, los efectos de la dosis de radiación se concentran alrededor del mismo. Permitiendo de esta manera que el sitio metálico y sus alrededores concentren el efecto reductor. Sin embargo, el uso de colectas múltiples (utilizando más de un cristal por experimento) y la construcción de grupos de difracción con dosis ascendentes de rayos X absorbidos, da la posibilidad de estudiar in situ al proceso de reducción química, y por lo tanto los estadios en los procesos de óxido-reducción particularmente en enzimas con sitios metálicos –por medio del estudio de los cambios en las densidades electrónicas-. Adicionalmente, y a pesar del uso de las variaciones recién descritas, es un hecho que la cristalografía de rayos X da como resultado estructuras que son un promedio espacial y temporal. Por este detalle se pretende coordinar la colecta de datos de difracción con estudios espectroscópicos UV-visibles y de fluorescencia (XANES, X-ray absorption Near Edge Structure). De esta manera se estudiara el proceso de reducción química y el cambio de estado de oxidación de los centros metálicos al mismo tiempo. Describiéndose el proceso de reducción química de una enzima con metales, tanto por los cambios producidos en las densidades electrónicas a diferentes dosis de rayos X, como por los estados de oxidación de los metales implicados y la aparición de ciertos intermediarios detectados por espectroscopia UV-visible.

Título del cartel:

1. Cambios redox inducidos por la dosis acumulada de rayos X en cristales de la tioredoxina de camarón blanco. Presentado por Adam Andrés Campos Acevedo. 2. Estudios estructurales del proceso de reducción inducida por rayos X en el sitio activo de la CAT-3 de N. crassa. Presentando por Andrés Zarate Romero. Publicaciones:

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1. Serrano-Posada, H., Valderrama, B., Stojanoff, V. and Rudiño Piñera, E. 2011. Thermostable multicopper oxidase from Thermus thermophilus HB27: crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of apo and holo forms. Acta Crystallographica Section F, 67, 1595-1598.

2. Gil-Alvaradejo, G., Ruiz-Arellano, R. R., Owen, C., Rodríguez-Romero, A., Rudiño Piñera, E., Antwi, M. K., Stojanoff, V. and Moreno, A. 2011. Novel Protein Crystal Growth Electrochemical Cell For Applications In X-ray Diffraction and Atomic Force Microscopy, Crystal Growth & Design, 11, 3917-3922.

3. Antillón, A., de la Rosa, G., Juárez, A., Moreno, M., Mustre, J., Napsuciale, M. and Rudiño Piñera, E. 2011. First Mexican Synchrotron Radiation Users Meeting. Synchrotron Radiation News, 24, 2-5.

4. Díaz-Sánchez, A. G., González-Segura, L., Rudiño-Piñera, E., Lira-Rocha, A., Torres-Larios, A. and Muñoz-Clares, R. A. 2011. Novel NADPH-cysteine covalent adduct found in the active site of an aldehyde dehydrogenase. Biochem J, 439, 443-452.

5. Canul-Tec, J. C., Riaño-Umbarila, L., Rudiño-Piñera, E., Becerril, B., Possani, L. D. and Torres-Larios, A. 2011. Structural basis of neutralization of the major toxic component from the scorpion centruroides noxius hoffmann by a human-derived single chain antibody fragment. J Biol Chem,286, 20892-20900.

6. De la Mora, E. , Carmichael, I. and Garman, E. F. 2011. Effective scavenging at cryotemperatures: further increasing the dose tolerance of protein crystals J Synchrotron Radiat, 18, 346-357.

7. Portillo-Téllez, M. D., Bello ,M., Salcedo, G., Gutiérrez, G., Gómez-Vidales, V. and García-Hernández, E. 2011. Folding and Homodimerization of Wheat Germ Agglutinin Biophys J, 101, 1423-1431.

8. Bello, M., Portillo-Téllez, M. D. and García-Hernández, E. 2011. Energetics of ligand recognition and self-association of bovine b lactoglobulin: Differences between variants A and B Biochemistry, 50, 151-161.

9. Hernández-Santoyo, A., Del Pozo Yauner, L., Fuentes-Silva, D., Ortiz, E., Rudiño-Piñera, E., Sánchez-López, R., Horjales, E., Becerril, B. and Rodríguez-Romero, A. 2010. A single mutation at the sheet switch region results in conformational changes favoring lambda 6-light-chain fibrillogenesis. J Mol Biol, 396, 280-292.

Tesis:

M.C. Eleuterio Benites, Estudios estructurales en mutantes de mono TIM que complementan la actividad de TPS en cepas de E. coli. Tutor Dr. Enrique Rudiño, 23/03/10.

“Refinamiento de estructuras cristalográficas en lacasas depositadas en el Protein Data Bank”. Adam Andrés Campos Acevedo, Facultad de Ciencias, UNAM, graduado UNAM (biólogo) 2010. Nivel Licenciatura. Docencia:

E. Rudiño Piñera: invitado a dar temas específicos en diversos tópicos de posgrado (Bioingeniería, Métodos en Biotecnología, Estructura de Proteínas, Fluorescencia, Bioinformática, Determinación estructural de estructura de Proteínas) y de licenciatura (Facultad de Ciencias, UNAM y Licenciatura en Ciencias Genómicas, CCG-UNAM) desde 2001 a la fecha. Coordinador y responsable del Tópico de Cristalografía de Proteínas (Impartido tres veces entre 2010 y 2011, junto con De la Mora, Serrano Posadas y Zarate Romero). Participante desde 2001 (a la fecha) como profesor en el curso básico de bioquímica (IBT-UNAM). En particular con los temas de cristalografía y purificación de proteínas. Profesor en el X6a Workbench, National Synchrotron Light Source, 16 a 19 de marzo y 15 al 18 de junio de 2010, Upton, NY. Estados Unidos. Donativos: ICyT del D.F., convocatoria Ciudad Saludable, INFLUENZA, “Propuesta de diseño de nuevos inhibidores de Neuraminidasa del virus de Influenza”, $800,000 pesos en un año, inicio 2009-2010.

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CONACyT Ciencia Básica 102370 “Estudios estructurales en sistemas proteicos con centros metálicos”, $996,000 pesos en tres años, inicio 2010.

PAPIIT-UNAM IN204611 “Estudios estructurales en sistemas proteicos con grupo Hemo”, $600,000 pesos en tres años, inicio 2011.

Premios y distinciones:

E. Rudiño-Piñera: premio CANIFARMA 2010 en Investigación Tecnológica. “Herramientas para el desarrollo de anticuerpos terapeúticos: bases estructurales de la neutralización del veneno del alacrán Centruroides noxius Hoffmann por medio de un anticuerpo tipo scFv” Otorgado por Cámara Nacional de la Industria Farmaceútica. MEXICO. 30/06/2011. Definitividad y Promoción a Investigador Titular B, noviembre de 2011. Integrante de la Comisión Permanente de Ingreso y Egreso del posgrado (CPIEP) del Instituto de Biotecnología, UNAM, desde enero de 2008 a la fecha. Responsable de Docencia del Instituto de Biotecnología de la UNAM, desde octubre de 2009 a la fecha. Integrante del Consejo Interno del Instituto de Biotecnología de la UNAM, desde octubre de 2009 a la fecha. Integrante del Comité Académico del Posgrado de Maestría y Doctorado en Ciencias Bioquímicas de la UNAM, desde octubre de 2009 a la fecha. Editor invitado en Protein and Peptide Letters (2011).

Sonia P. Rojas: promoción de Tec. Acad. Asoc. "C" TC a Tec. Acad. Titular "A" TC., mayo-2010. Definitividad mayo-2010. PRIDE de nivel "B" a nivel "C" agosto-2011. Organización de Congresos: Co-Chair, junto con los Dres. Armando Antillón, Mauro Napsuciale, Antonio Juárez-Reyes, José Mustre y Enrique Rudiño-Piñera del “First Mexican Synchrotron Radiation User´s Meeting”, realizado en el Holiday Inn, Cuernavaca, Morelos del 4 al 6 de mayo de 2011. En el evento se contó con la asistencia de 74 participantes y se impartieron 24 pláticas de investigadores de México, España, Inglaterra, Estados Unidos y Canadá (http://indico.nucleares.unam.mx/conferenceDisplay.py?confId=541).

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Grupo Dr. Lourival Possani (Jueves 15, de 11:30 a 12:00

hrs.).

Título de la Plática:

Péptidos del veneno de alacranes: Bloqueadores de canales iónicos y su neutralización por anticuerpos

Responsable: Dr. Lourival Domingos Possani Postay

Integrantes del Grupo (2010-2011):

Investigadores asociados: Dra. Georgina Gurrola Briones y Dr. Gerardo Corzo Burguete;

Posdoctorandos: Dra. Rita Restano-Cassulini, Dra. Verónica Quintero Hernández, Dra. Maria Martha Pedraza Escalona,

Dra. Lidia González Morales, Dr. Ramón Cervantes Rivera;

Técnicos académicos: Dr. Fernando Zamudio Zuñiga, Fredy I. Coronas Valderrama

Estudiantes: Licenciatura: Rosby del Carmen Nájera Mesa, Leonel Vargas Jaime; Maestría: Martha Rosalia Rendon

Anaya, Lorenzo Sánchez Vásquez, Omar Piña Barraza;

Doctorado: Juana Maria Jimenez Vargas, Juan Carlos Canul Tec, Itzel Amaro Estrada, Rodolfo Rodríguez Ravelo, Kenya

Hernández Salgado, Ligia Luz Corrales García, Alexis Rodríguez Solis, Francia García García.

Administrativos: Biól. Cipriano Balderas Altamirano, Linda Solaris Espinosa

Gerente de proyecto: CP. Carmen Martínez Segura

Resumen de la plática: (máximo 500 palabras).

En los últimos 37 años mi laboratorio ha trabajado de forma preponderante varios aspectos que se refieren a los

componentes del veneno de alacranes. Existen dos razones principales que motivan este estudio: la importancia médica y el

interés científico. La primera es obvia por el elevado número de accidentes que ocurren anualmente (más de un cuarto de

millón de personas picadas) en México y el segundo porque durante los 450 millones de la historia evolutiva de estos

arácnidos ellos han tenido tiempo suficiente para desarrollar y perfeccionar ligandos moleculares que reconocen receptores

específicos y blancos importantes en las áreas relacionadas con la comunicación celular. Estos componentes del veneno son

usados por el alacrán para subyugar sus presas o para defenderse de atacantes. En los dos últimos años hemos continuado el

estudio de los componentes tóxicos del veneno de alacranes, cuyos resultados fueron publicados en 18 artículos en revistas

indizadas, un capítulo de libro internacional, cuatro patentes de invención y seis tesis de estudiantes terminadas. Las

especies Mexicanas estudiadas fueron Centruroides elegans, Centruroides noxius , Cetruroides suffusus suffusus, Vejovis

mexicanus y otras tres nuevas especies: Tityus trivittatus de Argentina, Rhopalurus junceus de Cuba y Opisthacanthus

cayaporum de Brasil. El estudio de toxinas del veneno de la tarántula Grammostola rosea completa este trabajo. Los

componentes de mayor relevancia estudiados fueron la escorpina de Mesobuthus eupeus, algunos péptidos bloqueadores de

canales de potasio (ergtoxina), sodio y calcio, los péptidos con función anti-biótica y defensinas. Esto contó con la

colaboración de investigadores de mi grupo (Drs. Georgina Gurrola y Gerardo Corzo y sus respectivos estudiantes), así

como de los Drs. Adolfo de Roodt de Argentina, Enzo Wanke de Italia, Sunny Zhou de China, Jan Tytgat de Bélgica,

Elisabeth Schwartz de Brasil, Hector Valdivia de los EEUU, Muriel Delepierre del Instituto Pasteur de Paris, el estudiante

Rodríguez-Ravelo de Cuba y la participación importante de los Drs. Baltazar Becerril, Lidia Riaño, Enrique Rudiño,

Alejandro Alagón de nuestro Instituto y Dr. Alfredo Torres del Instituto de Fisiología Celular de la UNAM, y Dr. Federico

del Rio del Instituto de Química de la UNAM. Tres aspectos aplicados que ocuparon mucho tiempo y esfuerzo de nuestro

grupo todavía aguardan registro de patentes para poder ser publicados posteriormente, entre los cuales está el trabajo

realizado para la expresión heteróloga de toxinas del veneno de alacranes Americanos y Africanos para la producción de

mejores anti-venenos, gracias a donativos otorgados por el Instituto Bioclón S.A. de C.V. y Laboratorios Silanes S.A. de

C.V. y el desarrollo de una estrategia para la obtención de una vacuna en contra de la gripe aviar (en colaboración con la

Dra. Susana Lopez y Dr. Baltazar Becerril) financiado por el Instituto de Ciencia y Tecnología del D.F. Está pendiente de

publicación el trabajo realizado con los péptidos inmuno-modulares, comprometidos por la UNAM con una compañía

farmacéutica (patente registrada en cerca de 50 países). Así mismo, hay que resaltar el trabajo realizado con el donativo de

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la Fundación Bill y Melinda Gates direccionado al estudio de los péptidos bloqueadores de canales de potasio que actúan

sobre las fases esporogónicas del Plasmodium, causador del paludismo (en colaboración con el Dr. Humberto Lanz del

Instituto Nacional de Salud Pública y el Dr. Enrique Reynaud de nuestro Instituto). Finalmente otra actividad importante

que en este momento estamos preparando para publicar se refiere: Al análisis del transcriptoma de glándula de veneno del

alacrán Centruroides noxius Hoffmann, conducido por la alumna Martha Rosalía Redón Anaya, con la participación importante

del Dr.Alfredo Herrera Estrella del CINVESTAV- Irapuato.

Titulo de los Carteles: Mínimo 1, máximo 2, especificando el, la o los responsables de la presentación del mismo.

1. Bases estructurales de la neutralización de la toxina Cn2 de Centruroides noxius por el fragmento de anticuerpo de

cadena sencilla 9004G. Responsable: Juan Carlos Canul-Tec, con los siguientes autores: Juan Carlos Canul-Tec,

Lidia Riaño-Umbarila, Enrique Rudiño-Piñera, Baltazar Becerril, Alfredo Torres-Larios y Lourival D. Possani.

2. Diseño de nuevos péptidos sintéticos antimicrobianos. Responsable: Lorenzo Sánchez-Vásquez, con los siguientes

autores: Sánchez-Vásquez, L., Silva-Sánchez, J., Rodríguez-Romero, A., Muñoz-Garay, C., Possani, L.D. y

Gurrola-Briones, G.

Publicaciones* (2010-2011):

Revistas indizadas:

1. Roodt, A.R., Coronas, F.I.V., Lago, N., González, M.E., Laskowicz, R.D., Beltramino, J.C., Saavedra, S., López, R.A., Reati,

G., Vucharchuk, M.G., Bazán, E., Varni, L., Salomon, O.D. and Possani, L.D. General biochemical and immunological

characterization of the venom from the scorpion Tityus trivittatus of Argentina. Toxicon 55, 307-319 (2010).

2. Redaelli, E., Restano-Casulini, R., Fuentes-Silva, D., Clement H., Schiavon, E., Zamudio, F.Z., Odell G., Arcangeli, A., Clare,

J., Alagón, A., Rodríguez de la Vega, R., Possani, L.D., Wanke, E. Target promiscuity and heterogeneous effects of tarantula

venom peptides affecting Na+ and K

+ ion channels. J. Biol. Chem. 285:4130-4142(2010), y correción vol 285:13314-13314

(2010).

3. Zhu, S., Gao, B., Aumelas, A., Rodríguez, M.C., Lanz-Mendoza, H., Peigneur, S., Diego-Garcia, E., Martin-Eauclaire, M.F.,

Tytgat, J., Possani, L.D. MeuTXK 1, a scorpion venom-derived two-domain potassium channel toxin-like peptide with

cytolytic activity. B.B.Acta, Proteins and Proteomics, 1804:872-883 (2010).

4. Georgina B. Gurrola, E. Michelle Capes, Fernando Zamudio, Lourival Possani and Héctor H. Valdivia. Imperatoxin A, a

Cell-Penetrating Peptide from Scorpion Venom, as a Probe of Ca2+-Release Channels/Ryanodine Receptors. Pharmaceuticals.

(Basel), 3: 1093-1107, (2010).

5. Rodríguez de la Vega, R.C., Schwartz, E.F., Possani, L.D. Mining on scorpion venom biodiversity. Toxicon 56: 1155-

1161(2010).

6. Vandendriessche,T., Olamendi-Portugal, T., Zamudio. F.Z., Possani. L-D-. Tytgat, J. Isolation and characterization of two

novel scorpion toxins: the α-toxin-like CeII8, specific for Nav1.7 channels and the classical anti-mammalian CeII9, specific for

Nav1.4 channels. Toxicon 56:613-623(2010).

7. Hernández-Aponte, C.A., Silva-Sánchez, J. Quintero-Hernández, V., Rodríguez-Romero, A., Balderas, C., Possani, L.D.,

Gurrola, G.B.Vejovine, a new antibiotic from the scorpion venom of Vaejovis mexicanus. Toxicon 57:84-92 (2011).

8. Rodríguez, A.,Villegas, E., Satake,H., Possani, L.D. Gerardo Corzo. Amino acid substitutions in an alpha-helical

antimicrobial arachnid peptide affect its chemical properties and biological activity towards pathogenic bacteria but improve its

therapeutic index. Amino Acids 40, 61-68 (2011).

9. Corrales-Garcia, L.L., Possani, L.D. and Corzo, G. Expression systems of human -defensins: vectors, purification and

biological activities. Amino Acids 40, 5-14 (2011).

90

10. Jimenez-Vargas, J.M., Restano-Cassulini, R., Quintero-Hernández, V., Gurrola, G.B.y Possani, L.D. Recombinant

expression of the toxic peptide ErgTx1 and role of Met35 on its stability and function. Peptides 32:560-567 (2011).

11. Estrada, G., Restano-Cassulini, Ortiz, E., Possani, L.D., Corzo, G. Addition of positive charges at the C-terminal peptide

región of CssII, a mammalian scorpion peptide toxin, improves its affinity for sodium channels Nav1.6. Peptides 32:75-79

(2011).

12. Riaño-Umbarila, L., Contreras-Ferrat, G., Olamendi-Portugal, T., Morelos-Juárez, C., Corzo, G., Possani, L.D. and Becerril,

B. Exploiting cross-reactivity to neutralize two different scorpion venoms with one single.chain antibody fragment. Journal

Biological Chemistry 286:6143-6151(2011).

13. Espino-Solis, P.G., Estrada, G., Olamendi-Portugal, T., Villegas, E., Zamudio, F., Cestele, S., Possani, L.D., Corzo, G.

Isolation and molecular cloning of beta-neurotoxins from the venom of the scorpion Centruroides suffusus suffusus. Toxicon

27:739-746(2011).

14.Canul-Tec, J-C., Riaño-Umbarila, L., Rudiño-Pinera, E., Becerril, B., Possani, L.D., Torres-Larios, A. Structural basis of

neutralization of the major toxic component from the scorpion Centruroides noxius Hoffmann by a human-derived single chain

antibody fragment. J. Biol. Chemistry, 286:20892-20900 (2011).

15.García-Gómez, B.I., Coronas, F.I., Restano-Cassulini, R., Rodríguez-Ravelo, R., Possani, L.D. Biochemical and molecular

characterization of the venom from the Cuban scorpion Rhopalurus junceus. Toxicon, 58:19-27 (2011).

16. Amaro, I., Riaño-Umbarila, L., Becerril, B. Possani, L.D. Isolation and characterization of a human antibody fragment

specific for Ts1 toxin from Tityus serrulatus scorpion. Immunology Letters 139:73-79(2011).

17. Camartos, T.S., Restano-Cassulini, R., Possani, L.D., Peigneur, S., Tytgat, J., Schwartz, C.A., Alves E.M., Freitas, S.M.,

Ferroni Schwartz, E. The neew kappa-KTx2.5 from the Opisthacanthus cayaporum. Peptides, 32:1509-1517(2011.

18. Quintero-Hernández, V., Ortiz, E., Rendón-Anaya, M.R., Schwartz, E.F., Becerril, B., Corzo, G., Possani, L.D. Scorpion and

spider venom peptides: Gene cloning and peptide expression. Toxicon, 58:644-663 (2011).

Capítulo de libro:

Ricardo C. Rodríguez de la Vega, Nicolas Vidal y Lourival D. Possani. Scorpion venom peptides. Second edition of

Handbook of Biologically Active Peptides, Editora Elsevier (en prensa, 2011).

Innovación* (2010-2011):

Patentes de invención

1. Inmunógeno, anti-veneno y vacuna contra el veneno de la araña viuda negra. Autores: Lourival Domingos Possani Postay,

Alejandro Alagón Cano, Georgina Gurrola Briones, Grishin Eugene Vasilevich, Lipkin Alexey Valerevich, Volysnski Kirill

Eugenevich, Solicitud PA/A/1999/011191, aceptado por el Instituto Mexicano de la Propiedad Industrial el 23 de septiembre de

2010, México.

2. Uso de un péptido antibiótico proveniente del alacrán Centruroides suffusus suffusus y sus composiciones farmacéuticas

obtenidas con antibióticos comerciales. Autores: Gerardo Alfonso Corzo Burguete,Francia Garcia Garcia, Lourival Domingos

Possani Postay y Elba Cristina Villegas Villarreal, solicitud Expediente: MX/a/2011/005274, folio MX/E/2011/032782,

aceptado por el Instituto Mexicano de la Propiedad Industrial el 19 de mayo de 2011.

3. Nuevo péptido antibiótico híbrido y sus variantes. Autores: Georgina Gurrola Briones, Lorenzo Sánchez Vásquez, Jesús Silva

Sánchez y Lourival Domingos Possani Postay, solicitud expediente: MX/a/2011/007177, folio MX/E/2011/044744, aceptado

por el Instituto Mexicano de la Propiedad Industrial el 1 de julio de 2011.

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4. Familia de variantes de anticuerpos recombinantes humanos que neutralizan a las toxinas de alacrán Cn2 y Css2 así como a

los venenos respectivos: Centruroides noxius y Centruroides suffusus suffusus, por los autores L. Riaño-Umbarila, E. Rodríguez,

B. Becerril y L.D.Possani, registrada bajo número de solicitud: Expediente MX/a/2011/009885, folio MX/E/2011/065741 del 21

de septiembre de 2011, en México.

Tesis Concluidas* (2010-2011):

Tesis de licenciatura:

1. Para la obtención del título de Químico Farmacéutico Biólogo de la Facultad de Ciencias Químicas de la Universidad de

Colima: “Análisis proteómico y actividad biológica de los componentes del veneno de alacrán Centruroides tecomanus

Hoffmann, 1932 (Scorpiones: Buthidae)”, por Luis José Guadalupe Zamora Pizano. La directora de tesis fue la Dra. Laura

Leticia Valdez Velázquez. Yo fungí como Asesor Externo, pero la tesis fue realizada en mi laboratorio en el IBT, UNAM.

Fecha: abril de 2010.

2. Para la obtención del título de Ingeniero Biotecnólogo del Centro de Biociencias, campus IV de la Universidad Autónoma de

Chiapas: “Síntesis química de variantes del péptido Hadrurina con actividad antimicrobiana aislado del veneno del alacrán

Hadrurus gertschi”, por Rosby del Carmen Najara Meza. El tutor principal fue el Dr. Fernando Zamudio Zuñiga: Fecha: enero de

2011.

Tesis de posgrado:

1. Para la obtención del grado de Maestro en Ciencias Bioquímicas del Instituto de Biotecnología – UNAM “Identificación de

eventos moleculares asociados a la intoxicación con la toxina Cn2 mediante electroforesis bidimensional”, por Dora Luz Gómez

Utrera, bajo la tutoría de la Dra. Georgina Gurrola Briones, Fecha: 28 de octubre de 2010.

2. Para la obtención del grado de Maestro en Ciencias Bioquímicas del Instituto de Biotecnología – UNAM “Análisis del

transcriptoma de glándula de veneno del alacrán Centruroides noxius Hoffmann”, por Martha Rosalía Redón Anaya. El

Dr.Alfredo Herrera Estrella fue co-tutor de la tesis. Fecha: 16 de agosto de 2011.

3. Para la obtención del grado de Maestro en Ciencias Bioquímicas del Instituto de Biotecnología – UNAM “Diseño de nuevos

péptidos sintéticos antimicrobianos”, por el Q.F.B. Lorenzo Sánchez Vázquez, bajo la tutoría de la Dra. Georgina Gurrola

Briones. Fecha: 31 de octubre de 2011.

4. Para la obtención del grado de Doctor en Ciencias (Centro de Investigación en Biotecnología, Universidad Autónoma del

Estado de Morelos: “Caracterización bioquímica y molecular de los componentes del veneno del ciempiés Scolopendra viridis

Say”, por Lidia González Morales. La tutora oficial de esta tesis fue la Dra. Maria del Carmen Gutiérrez Villafuerte y la co-

tutora Dra. Elia Diego García, pero la mayor parte del trabajo experimental incluyendo la escritura de la publicación fue hecho

en mi laboratorio, bajo mi responsabilidad. Fecha de presentación: 11 de febrero de 2010.

Docencia* (2010-2011): Se refiere a cursos en licenciatura, posgrado, servicios sociales, estancias, entrenamientos,

etc.

1. Participación en el curso básico de Bioquímica de nuestro posgrado. En este el Dr. Gerardo Corzo fungió como

responsable.

2. Participación en Tópico Selecto de la carrera de Ciencias Genómicas del Campus Cuernavaca (4 horas).

3. Además el Dr. Gerardo Corzo participó en otros cursos (véase su informe).

Donativos* (2010-2011):

1. Proyecto IN204110 de DGAPA-UNAM (2010-12): Caracterización

química-funcional de componentes del veneno de alacranes.

2. Proyecto SEP-CONACyT, todavía no firmado (2011-2013): Eventos moleculares asociados a la intoxicación por veneno

de alacranes: un análisis por biología de sistemas.

3. Compañía Silanes/Bioclón S.A. de C.V.

Expresión de toxinas recombinantes para producción de sueros inmunes

92

4. Fundación Bill y Melinda Gates

Bloqueadores de canales de potasio para el control del paludismo.

5. Instituto de Ciencia y Tecnología del D.F.

Una nueva estrategia para generación de vacuna aviar, mediante el uso de anticuerpos contra receptores de células

dendríticas

Premios y Distinciones* (2010-2011):

Premio CANIFARMA 2010, trabajo del alumno de doctorado Juan Carlos Canul Tec, realizado en colaboración con los

Drs. Baltazar Becerril Luján, Lidia Riaño Umbarila y Enrique Rudiño del IBT-UNAM y Dr. Alfredo Torres Larios del

Instituto de Fisiología Celular-UNAM, entregado el 30 Junio de 2011

Otras actividades relevantes* (2010-2011): Se refiere a participación en comités editoriales, comités, consejos,

coordinaciones, organización de eventos, etc.

1. Comité editoriales:

- Revista Toxicon – Board de editores

- Revisor ad hoc para innumerables revistas como: Biochemistry, British Journal Pharmacology, Peptides, Biochimica et

Biophysica Acta, FEBS Journal, J. Proteomics y otras más.

2. Consejo Universitario:

- Consejero suplente del Consejo Universitario de la UNAM por parte del IBT con participación efectiva en la Comisión de

Honor.

3. Comisión dictaminadoras:

- Comisión dictaminadora del SNI, CONACyT para revisar los casos de inconformidades presentado en el área II (Biología

y Química).

- Instituto de Ciencias Física - Cuernavaca