RELATRIO TCNICO FINAL

Ttulo do Projeto: Rastreamento e deteco de Salmonella enteritidis atravs do gene

invA, pela tcnica de PCR em tempo real, na Avicultura de corte e postura de ovos nas

granjas comerciais do Estado do Esprito Santo.

Nome do Coordenador do Projeto: Fabrcio Antonio Ferreira Martins No do Processo: 42798850/2008 Instituio (por extenso): Instituto Tommasi de Pesquisa e Desenvolvimento O projeto vem sendo apoiado pela FAPES/FINEP desde 12 / 2008 Perodo em que se refere o Relatrio: 04/2009 10/2009 Resumo das Atividades Executadas no Perodo de vigncia do auxlio. I - Principais objetivos do projeto original: Rastrear e detectar Salmonella enteritidis atravs do gene invA pela tcnica de PCR em

tempo real na Avicultura de corte e de postura de ovos nas granjas comerciais do

Estado do Esprito Santo, visando o mercado internacional (exportao) e o mercado

interno.

II - Principais etapas executadas no perodo visando ao alcance dos objetivos: II.1 Seleo das granjas, coleta e encaminhamento das amostras biolgicas:

A seleo dos avicultores, coleta e encaminhamento das amostras biolgicas foi

realizado pelo Mdico Veterinrio, Gabriel Silva Braga (CRMV:0780/VP), gerente de

veterinria da COOPEAVI (Cooperativa Agropecuria Centro Serrana Santa Maria de

Jetib).

II.2-Coleta de Ovos:

As coletas dos ovos foram realizadas na COOPEAVI pelo Mdico Veterinrio Gabriel

Silva Braga CRMV: 0780/VP. Entre o perodo de 10/12/2008 31/10/2009, foram

coletados um total de 798 ovos. (Fotos 01 e 02).

Foto 01: Chegada dos Ovos na COOPEAVI.

Foto 02: Coleta dos ovos pelo Mdico Veterinrio.

II.3-Coleta de Swab de Cloaca:

Foram coletados entre 12/2008 10/2009, 204 amostras de swabs de cloaca pelo

Mdico Veterinrio Gabriel Silva Braga CRMV: 0780/VP. A escolha dos Avicultores e

das aves foram aleatrios pelo prprio Mdico Veterinrio. (Fotos 03 e 04)

Foto 03: Vista interna de uma das granjas onde foi realizado a coleta de swab de cloaca

Foto 04: Coleta de swab de cloaca

II.4 Transporte e encaminhamento das amostras biolgicas: As amostras biolgicas foram acondicionadas em caixas devidamente identificadas e

encaminhadas diretamente para o Instituto Tommasi de Pesquisa e Desenvolvimento

(foto 05).

Foto 05: Caixa onde os Ovos e Swabs de cloaca foram acondicionados para serem encaminhados ao Laboratrio.

II.5 Realizao dos testes laboratoriais: Aps o recebimento das amostras no Instituto Tommasi de Pesquisa e

Desenvolvimento, foi realizado um cadastro no sistema do laboratrio, onde gerado

um registro de cada material a ser analisado de cada avicultor, fato importante na

rastreabilidade das amostras pesquisadas, que a grande novidade da avicultura

mundial nesta primeira dcada do sculo XXI. Na Unio Europia, onde o consumidor

muito mais exigente, o processo j comeou e foram criados vrios programas para

identificar toda a vida da ave at a venda da carne ou dos ovos no supermercado.

Aps o cadastro, os Swabs foram diretamente enriquecidos em gua peptonada e

posteriormente, de acordo com sugesto do consultor no relatrio parcial, foram

colocados em meio seletivo, inibindo o crescimento de outras bactrias (Selenito

Cistina). J os ovos foram colocados em um recipiente estril (gema, clara e casca), e

enriquecidos em gua peptonada e caldo BHI, e posteriormente foram semeados em

meio especfico de crescimento (meio SS - Salmonela Shiguella).

Para realizao das anlises moleculares e microbiolgicas, foi obtido junto ao Instituto

Adolfo Lutz (IAL) um controle positivo de Salmonella enteritidis, lote 03/07, utilizado

como controle padro positivo para todas as anlises realizadas. Todas as amostras

biolgicas foram realizado tanto anlise molecular como cultura microbiolgica. As fotos

abaixo (Foto 06 e 07) mostram a extrao da gema e clara dos ovos e posteriormente

as amostras enriquecidas em meio BHI, gua peptonada e meio seletivo selenito

cistina, sendo que aps determinado tempo foram semeadas em meio SS.

Foto 6: Extrao da gema e clara dos ovos para deteco de Salmonella enteritidis.

Foto 7: Amostras de swab enriquecidas em gua Peptonada e aps em meio seletivo Selenito Cistina.

II.6 - Deteco e amplificao do material gentico:

Saber quais sero as necessidades da indstria avcola no futuro um desafio

constante e, para isso, o Instituto Tommasi, junto com a FAPES/FINEP e a COOPEAVI,

utilizou o que h de mais moderno em tecnologia nas granjas do estado do Esprito

Santo, diagnstico molecular metodologia PCR em tempo real, para termos um

produto livre de Salmonelose para o consumidor. Esta metodologia identifica o DNA

alvo com maior sensibilidade, uma vez que a deteco da amplificao feita atravs

da captao de fluorescncia. Esta tcnica tambm apresenta maior especificidade,

devido utilizao de uma sonda especfica para o fragmento alvo na reao.

A amplificao e a deteco do DNA so realizadas simultaneamente em um sistema

fechado, dispensando procedimentos adicionais como a corrida eletrofortica dos

produtos em gel de agarose e fotodocumentao. Com a eliminao destas etapas, os

resultados obtidos pelo PCR em tempo real so mais rpidos (menos de 24 horas,

desde a extrao do DNA at o resultado final), quando comparada com a PCR

convencional.

Para amplificao e deteco do material gentico de Salmonella enteritidis, utilizamos

um conjunto de Primers (iniciador e reverso) e uma sonda especficos para amplificar o

gene invA, que tem a funo de aumentar a capacidadade de invaso das Salmonelas,

pois, sorotipos que no possuem o gene invA so incapazes de expressar invABC,

dessa maneira so deficientes para invadir clulas de mamferos, indicando que o

operon invABC tem um papel importante na invaso bacteriana nas clulas.

Alm do controle positivo de Salmonella enteritidis obtido junto ao Adolfo Lutz, toda

corrida de amplificao foi acompanhada de um Controle Interno de Reao (IPC), que

vai validar a amplificao molecular.

As reaes de PCR so realizadas em um PCR em tempo real (7300 real time PCR

System - Applied Biosystems) (Foto 08).

FOTO 08 7300 Real Time PCR System

II.7 Cronograma de atividades:

Tabela 01: Cronograma de atividades.

Atividade Trimestre I Trimestre II Trimestre III Trimestre IV Seleo das granjas que iro participar do projeto

X

Treinamento dos tcnicos para coleta e logstica das amostras

X

Coleta das amostras nas granjas

X X X X

nalise molecular das amostras selecionadas

X X X X

Relatrios parciais

X

Divulgao dos resultados para controle da doena para a Coopeavi

X X X X

Divulgao dos resultados na mdia (Jornais, revistas, congressos etc.)

X

Relatrio final X

Tabela 02: Cronograma de coleta de ovos e swabs de cloaca no 1 semestre.

Tabela 03: Cronograma de coleta de ovos e swabs de cloaca no 2 semestre.

III - Apresentao e discusso sucinta dos resultados obtidos, deixando claro o

avano, terico, experimental ou prtico obtido pela pesquisa (os resultados

formais - publicaes - so solicitados no item VIII).

III 1: Resultados das anlises moleculares:

Todas as anlises moleculares das amostras pesquisadas como ovo (tanto a gema

como a clara), casca dos ovos e swabs de cloaca foram indetectveis para Salmonella

enteritidis. O que foi confirmado com as culturas microbiolgicas (segue em anexo

laudos de 2 avicultores).

As fotos 09 e 10 mostra o resultado da anlise molecular de Salmonella enteritidis de 3

avicultores, mostrando a ausncia de Salmonela nas amostras analisadas (ovos e

swabs). O nmero 1 o controle positivo de Salmonella enteritidis do Instituto Adolfo

Lutz, mostrando uma curva de amplificao do material gentico alvo, e o nmero 2 as

amostras de ovos (gema, clara e casca), swab de cloaca e controle negativo, onde no

houve curva de amplificao, ou seja, no houve deteco de Salmonella enteritidis.

Dezembro/2008 Janeiro/2009 Fevereiro/2009 Maro/2009 Abril/2009 Maio/2009 1 Quinzena

10/12/2008 OK

15/01/2009 OK

05/02/2009 OK

05/03/2009 OK

08/04/2009 OK

06/04/2009 OK

2 Quinzena

22/12/2008 OK

22/01/2009 OK

19/02/2009 OK

18/03/2009 OK

22/04/2009 OK

20/04/2009 OK

Junho/2009 Julho/2009 Agosto/2009 Setembro/2009 Outubro/2009 1 Quinzena

04/06/2009 OK

14/07/2009 OK

13/08/2009 OK

10/09/2009 OK

09/10/2009 OK

2 Quinzena

25/06/2009 OK

30/07/2009 OK

27/08/2009 OK

24/09/2009 OK

29/10/2009 OK

Foto 09: 1) Controle positivo de Salmonela enteritidis (Adolfo Lutz). 2) Amostras de

swab de cloaca do Avicultor Elimar Schwambach e controle negativo indetectvel para

Salmonela.

Foto 10: 1) Controle positivo de Salmonela enteritidis (Adolfo Lutz). 2) Amostras de

swab de cloaca do Avicultor Manfredo Kruger, ovos do Avicultor Edgar Agner e controle

negativo indetectvel para Salmonela.

Para verificarmos a eficincia de deteco molecular no ovo, foi realizado uma corrida

de amplificao (foto 11) atravs de uma amostra de ovo contaminado pelo controle

positivo de Salmonella