Organização Digital para Escrita Científica - Aula 2 - Open Access e Métricas Alternativas

Publicação acadêmica digital: Open Access

Atila Iamarino e Mário Henrique Barros

Parte I: os problemas e o acesso

Origem da Publicação Adadêmica

Como começa e quais os problemas

A criação dos periódicos

Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015

Philosophical Transactions (of the Royal Society of London) é criadoem 1665:• Inaugura o conceito de peer-

review• Estabelece prioridade de

descoberta

Arquivo das edições mais antigas:http://onlinebooks.library.upenn.edu/webbin/serial?id=philtransactions

Papel dos primeiros periódicos


• Cientista:

– resultados

• Periódicos:

– revisão

– edição

– distribuição

– arquivamento

Problemas: peer-review

Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015http://dx.doi.org/10.1126/science.1219861

Problemas: edição

Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015http://dx.doi.org/10.1111/eth.12282

Problemas: journal-affordability

• Publicação tradicional: ótima para poucasrevistas

• 2,5M artigos por ano em 2004*: quem paga?

– Não seriam viáveis a preço de custo

* Harnad, S., Brody, T., Vallières, F., Carr, L., Hitchcock, S., Gingras, Y., Oppenheim, C., et al. (2004). The Access/Impact Problem and the Green and Gold Roads to Open Access. Serials Review, 30(4), 310–314. doi:10.1016/j.serrev.2004.09.013


Com a distribuição digital


• Cientista:

– resultados

• Periódicos:

– revisão (email)

– edição (automatizada)

– distribuição (grátis)

– arquivamento (digital)

No entanto

Association of Research Libraries

http://www.arl.org/bm~doc/monser04.pdfAtila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015

• Cientista:

– resultados

• Periódicos:

– revisão (email)

– edição (automatizada)

– distribuição (grátis)

– arquivamento (digital)

No entanto


http://poeticeconomics.blogspot.ca /2012/01/enormous-profits-of-stm-scholarly.html

http://poeticeconomics.blogspot. com.br/2014/03/elsevier-stm-publishing-profits-rise-to.html

• Elsevier (2014): £826 milhões, lucro de 39%

• Springer (2010): € 294 milhões, lucro de 33,9%

• Wiley & Sons (2011): $106 milhões, lucro de 42%

Porque não discutimos

• Acesso à artigos em 2013: $ 93.872.151,111

– ~$32 milhões à Elsevier2

• ~$1,60 por artigo (desde 2005)3

[1] http://www.capes.gov.br/images/stories/download/Contas_Publicas/Relatorio-de-Gestao-2013.pdf[2] https://gowers.wordpress.com/2014/04/24/elsevier-journals-some-facts/[3] Almeida, E. C. E. de, Guimarães, J. A., & Alves, I. T. G. (2011). Dez anos do Portal de Periódicos da Capes: histórico, evolução e utilização. Revista Brasileira de Pós-Graduação, 7(13). Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015

Eis que

Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015http://www.michaeleisen.org/blog/?p=807

Eis que

Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015Timothy Gowers - http://gowers.wordpress.com/2012/01/21/elsevier-my-part-in-its-downfall/

Eis que

Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015http://thecostofknowledge.com/

Open Access

Acesso livre vs grátis

Acesso Grátis vs Acesso Aberto


Atribuição (by)

Atribuição - Compartilhamento pela mesma Licença (by-sa)

Atribuição - Não a Obras Derivadas (by-nd)

Atribuição - Uso Não Comercial (by-nc)

http://creativecommons.org.br/

Tipos de Open Access


• Green:– 6 meses a um ano para arquivamento próprio do

manuscrito submetido

• Gold:– Disponível imediatamente

– Quem paga entre $1000 e $5000?

• Preprints e repositórios– ArXiv - http://arxiv.org/

Open Access: Acesso ao Público


Fausto, S., Machado, F. A., Bento, L. F. J., Iamarino, A., Nahas, T. R., & Munger, D. S. (2012). Research Blogging: Indexing and Registering the Change in Science 2.0. PLoS ONE, 7(12), e50109. doi:10.1371/journal.pone.0050109

https://twitter.com/Myrmecos/statuses/301832901979430913

https://twitter.com/Myrmecos/statuses/301832901979430913

Open Access: Citações

Harnad, S., Brody, T., Vallières, F., Carr, L., Hitchcock, S., Gingras, Y., Oppenheim, C., et al. (2004). The Access/Impact Problem and the Green and Gold Roads to Open Access. Serials Review, 30(4), 310–314. doi:10.1016/j.serrev.2004.09.013


Open Access: Citações


Eysenbach, G. (2006). Citation advantage of open access articles. PLoS biology, 4(5), e157. doi:10.1371/journal.pbio.0040157

Para a PNAS, artigos OA:

• Citado antes

• Mais chances de sere citados pelo menos 1 vez

• Mais citações

https://twitter.com/ethanwhite/status/308987352808820738

https://twitter.com/ethanwhite/status/308987352808820738

Open Access: Periódicos


http://plos.org/

• PLOS ONE• PLOS Biology• PLOS Medicine• PLOS Genetics• PLOS Computational

Biology• PLOS Pathogens• PLOS Neglected

Tropical Diseases



http://www.biomedcentral.com/



http://www.nature.com/srep/index.html



http://advances.sciencemag.org/



https://peerj.com/



http://www.jnrbm.com/

Cuidado!

• Alguns periódicos adotam as práticas predatórias de publicação

http://scholarlyoa.com/publishers/


Fonte: The Scientist

http://www.the-scientist.com/?articles.view/articleNo/32426/title/Predatory-Publishing/

Cuidado!

http://scholarlyoa.com/2014/11/20/bogus-journal-accepts-profanity-laced-anti-spam-paper/http://www.scs.stanford.edu/~dm/home/papers/remove.pdf Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015

Para mais:

Open Access: An Introduction

http://www.ercim.eu/publication/Ercim_News/enw64/jeffery.html

Wiki sobre OA

http://oad.simmons.edu/oadwiki/Main_Page

Blog do Kuramoto: Blog brasileiro sobre OA

http://kuramoto.blog.br/

Editorial Reformando a Ciência da Infection and Imunnity

http://iai.asm.org/content/80/3/891.full



http://www.ercim.eu/publication/Ercim_News/enw64/jeffery.html

http://oad.simmons.edu/oadwiki/Main_Page

http://kuramoto.blog.br/



Publicação acadêmica digital: Altmetrics


Parte II: os dados gerados

Fator de Impacto

O que podemos medir não é tudo que há para medir

O Fator de Impacto


Como saber a relevância de um artigo?

• Eugene Garfield propõe em 1955 a contagem de citações

• Em 1961 começa o Science Citation Index proposto poGarfield e Irving H. Sher

Garfield, E. (2006). The history and meaning of the journal impact factor. JAMA : the journal of the American Medical Association, 295(1), 90–3. doi:10.1001/jama.295.1.90

Como funciona o IF


Quantas citações cada periódico recebeu nos dois anos anteriores/ total de artigos publicados no período

“Correspondence, letters, commentaries, perspectives, news stories, obituaries, editorials, interviews, and tributes are not included in the JCR’s denominator.”

Artigos de 2013 Artigos de 2012 Artigos de 2011

FI 2013 FI 2012 FI 2011

Garfield, E. (2006). The history and meaning of the journal impact factor. JAMA : the journal of the American Medical Association, 295(1), 90–3. doi:10.1001/jama.295.1.90

Problemas com o IF


• Nem todas áreas concentram citações em 2 a 3 anos

– Nature: sim Ecology: 7 a 8 anos*

• É tão acurado quanto a base de dados (Web of Science)

– 25 a 35% das citações contém erros*

• Pune áreas de interesse específicas

• Se aplica à revista, e não ao artigo

*Vanclay, J. K. (2011). Impact factor: outdated artefact or stepping-stone to journal certification?

Scientometrics, 92(2), 211–238. doi:10.1007/s11192-011-0561-0

http://www.springerlink.com/index/10.1007/s11192-011-0561-0

Problemas com o IF


Seglen, P. O. (1997). Why the impact factor of journals should not be used for evaluating research. BMJ (Clinical research ed.), 314(7079), 498–502.

Problemas com o IF


Rossner, M., Epps, H. Van, & Hill, E. (2007). Show me the data. Cell, 179(6), 1091–1092. doi:10.1371/journal

Propriedade da Thomson Scientific e não é reproduzidohttp://noctique.deviantart.com/art/Fog-on-road-175259064

Problemas com o IF


Fang, F. C., & Casadevall, A. (2011). Retracted science and the retraction index. Infection and immunity, 79(10), 3855-9. doi:10.1128/IAI.05661-11

Fator de impacto


É o que tem

É o que tem?

Altmetrics

Medidas individuais de artigos e pesquisadores

Métricas alternativas: o que medir


Altmetrics

Priem, J., Piwowar, H. A., & Hemminger, B. M. (2012). Altmetrics in the wild: Using social media to explore scholarly impact. http://arxiv.org/abs/1203.4745 Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015

Métricas alternativas: agilidade

Eysenbach, G. (2011). Can tweets predict citations? Metrics of social impact based on Twitter and correlation with traditional metrics of scientific impact. Journal of medical Internet research, 13(4), e123. doi:10.2196/jmir.2012

• Menções no Twitter: - menos de 2 dias

• Mais twetados: - mais downloads

• 11x mais chances de serem bem citados


Métricas alternativas: agilidade


Priem, J., Piwowar, H. A., & Hemminger, B. M. (2012). Altmetrics in the wild: Using social media to explore scholarly impact. http://arxiv.org/abs/1203.4745

Tags associadas

Métricas alternativas: abrangência

Priem, J., Piwowar, H. A., & Hemminger, B. M. (2012). Altmetrics in the wild: Using social media to explore scholarly impact. http://arxiv.org/abs/1203.4745 Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015


Priem, J., Piwowar, H. A., & Hemminger, B. M. (2012). Altmetrics in the wild: Using social media to explore scholarly impact. http://arxiv.org/abs/1203.4745

A: Citados e lidosB: Lidos e pouco citadosC: PopularesD: Escolhidos por especialistasE: Pouco impacto por estas medidas



http://blog.impactstory.org/2012/09/14/31524247207/


Métricas por artigo: quem perde

Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015Lariviere, V., Lozano, G. A., & Gingras, Y. (2013). Are elite journals declining?, 12. Digital Libraries. Retrieved from http://arxiv.org/abs/1304.6460

Métricas por artigo: quem perde

Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015http://www.nature.com/news/science-publishing-the-golden-club-1.13951?WT.ec_id=NEWS-20131022

Problemas com o glamour

Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015[1] http://www.nature.com/news/retraction-challenges-1.16023?WT.ec_id=NATURE-20141002

“Why the sudden pulse of Nature retractions in 2013 and 2014? […] We can only speculate.“1

Métricas alternativas: como fazer?

http://altmetric.com/


Métricas alternativas: como fazer?

Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015http://impactstory.org/

Programas de organização


Leitura


• Pocket

– http://getpocket.com/

• Instapaper

– http://www.instapaper.com/

• Readability

– http://www.readability.com/

• Evernote Web Clipper

http://getpocket.com/

http://www.instapaper.com/

http://www.readability.com/

Captura


• Web

• Ideias

• Fotos

• Arquivos

• PDFs

http://evernote.com/evernote/

Captura e organização de artigos

Atila Iamarino | ICB-5721-2 9 Março 2015

• Captura automática de artigos

• Páginas Web

• Acesso offline

• Anotação

• Sincronização

• PDFs

• Reference Managerhttp://www.zotero.org/

Captura e organização de artigos


• PDFs

• Acesso offline

• Anotação

• Sincronização

• Reference Manager

• Rede social

• Compartilhamentohttp://mendeley.com/

Para aula prática:

Montar caderno de notas do Evernote com:

• Uma nota com PDF anotado

• Uma nota com áudio

• Uma nota com um links

• Uma nota com link para arquivo do computador

• Uma nota com a resenha de um programa relacionado à disciplina

• Uma nota descrevendo seu projeto e como um dos programas poderiaajudar

• Uma nota de laboratório (documentação de arquivo, foto de gel, etc)


Organização Digital para Escrita Científica - Aula 2 - Open Access e Métricas Alternativas

Science

Transcript of Organização Digital para Escrita Científica - Aula 2 - Open Access e Métricas Alternativas