Linux aula
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Linux – uma alternativa diferente
Alessandra Faria Campos
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Sistemas operacionais
Um programa governo
Controla a interação entre:Usuários e hardwareOs diversos usuários
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Sistemas operacionais
Sistema operacional
Programas do sistema e usuários
Hardware
impressoramouseteclado monitor
usuário1 usuário2 usuário n
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Sistemas operacionais
WindowsUNIXDOSMacOSOS2LINUX
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Linux – breve histórico
• Desenvolvido por Linus Torvalds – Universidade de Helsinki – Finlândia
• Aprimorado com a participação de usuários de UNIX através da internet
• Primeira versão oficial liberada em 1991
• X-windows
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Linux - Vantagens
• É um software livre: pode ser copiado de outro usuário, descarregado da internet ou comprado de uma empresa que montou um pacote (ex: Linux - Conectiva)
• Roda com requerimentos de hardware mínimos (pode rodar em um 486 – 4 M de RAM! – *Windows Millenium requerimento mínimo: 128 M de RAM)
• É muito poderoso: roda com boa performance mesmo com vários programas rodando ao mesmo tempo e várias janelas abertas - Raramente aparece a terrível mensagem: Esse programa executou uma operação ilegal e vai ser fechado!!!!!!
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Linux - vantagens
• Os programas rodam individualmente – falhas em um programa não interferem com os demais processos e não obrigam a reiniciar o computador
• Suporte, programas e documentação livre, de graça e em grande volume disponível na internet
• Pode ser instalado junto com outros sistemas operacionais
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Linux e bioinformática
• Poderoso o suficiente para ser usado para lidar com ferramentas de bioinformática que lidam com grande volume de dados
• Utilizado em centros de bioinformática ao redor do mundo
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NCBI –Servidor de ftp
• Descarregar os programas na forma compactada para Linux ou outra plataforma
• Montagem de banco de dados local• Execução dos programas de manipulação e análise
de sequências localmente: velocidade e personalização
• Em projetos genoma as sequencias são inéditas e não estão depositadas em bancos de dados públicos