BIOINFORMTICABiologia Marinha e Biotecnologia/ESTM

3Ano

15 TP + 30 P + 6 OT

Patrcia Abrantespatricia.abrantes@estm.ipleiria.pt

Gabinete 18

Segunda-feira: 11h00-12h00

Quinta-feira: 11h00 13h00

Programa da Unidade Curricular1. Bases de dados biolgicos: bases de sequncias de cidos

nuclecos e protenas. Ferramentas e bases de dados da EBI e

NCBI, entre outras.

2. Ferramentas de anlise de sequncias e prospeco de dados.

3. Alinhamento de sequncias, sequncias homlogas, programas

BLAST e FASTA.

4. Identificao de motivos.

5. Predio de genes e anotao genmica.

6. Anlise estatstica de sequncias protecas.

Avaliao

Terico-prtica 60% da nota final

teste final nota mnima superior a 9,5 valores

Nota Final = 60%(Nota do Teste) + 40%(componente prtica)

C

O

N

T

N

U

A

Prtica 40% da nota final

Participao e assiduidade s aulas 40%

Elaborao de relatrios/exerccios - 40%

Discusso de artigos cientficos 20%

Nota mnima

superior a 9,5

valores

Terico-prtica 60% da nota final (nota mnima superior a 9,5 valores)

Prtica 40% da nota final

Avaliao escrita e oral (nota mnima superior a 9,5 valores)

E

X

A

M

E

Nota Final = 60% Exame + 40% Avaliao escrita e oral

Avaliao

Lesk, A. (2005). Introduction to Bioinformatics, Oxford, Oxford

University Press.

Baxevanis, A. & Ouellette, B. (2004). Bioinformatics: A Practical

Guide to the Analysis of Genes and Proteins, 3rd edition, Wiley-

Interscience.

Jones, N. & Pevzner, P. (2004). An Introduction to Bioinformatics

Algorithms, Cambridge, The MIT Press.

Mount, D. (2004). Bioinformatics: Sequence and Genome Analysis,

2nd edition, New York, Cold Spring Harbor Laboratory Press.

Pevsner, J. (2003). Bioinformatics and Functional Genomics, John

Wiley & Sons.

Bibliografia

Calendarizao das aulasFEVEREIRO

I 17 20 TP N.1 II 23 27 CARNAVAL CARNAVAL

MARO

III 2 6 TP N.2 Aula Prtica N.1

IV 9 13 TP N.3 Aula Prtica N.2

V 16 20 TP N.4 Aula Prtica N.3

VI 23 27 TP N.5 Aula Prtica N.4

ABRIL

VII 30 3 TP N.6 Aula Prtica N.5

VIII 6 8 TP N.7 Aula Prtica N.6

IX 13 17 FRIAS FRIAS

X 20 24 TP N.8 Aula Prtica N.7

XI 27 1 TP N.9 Aula Prtica N.8

MAIO

XII 4 8 TP N.10 Aula Prtica N.9

XIII 11 15 SEMINRIO SEMINRIO

XIV 18 22 TP N.11 Aula Prtica N.10

XV 25 29 TP N.12 Aula Prtica N.11

JUNHO

XVI 1 5 TESTE TESTE

XVII 8 12 FRIAS FRIAS

XVIII 15 19 TP N.13 Aula Prtica N.12

Avaliao UC