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01. DNA Structure and Organization
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Informação adicional: 1. Densidade da molécula nativa muito alta
2. Decomposição da molécula nativa em nucleótidos resultava em que as proporções dos diferentes componentes eram sempre: Guaninas = Citocinas Adeninas = Timinas 3. A molécula nativa tinha um diâmetro constante (20 Å)
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Estabilidade do DNA
Interações hidrofóbicas entre as bases que resultam na sua orientação principalmente perpendicular ao eixo da molécula.
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Desnaturation e renaturation do DNA
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DNA melting curves
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Southern blotting
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Estrutura secundaria do DNA
Linear DNA molecule
Região de dupla simetria com sequencias repetidas invertidas
Positive supercoiling
Link number = 0
Link number = 3
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Nucleossoma
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Modelos da organização da cromatina
Bead on a string 11 nm
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Modelos da organização da cromatina
Solenoid 30 nm
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Remodelação da cromoatina
Dependente do ATP
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Diversas proteínas interatuam com o DNA
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C-terminal das histonas
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O Código epigenético
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O Código epigenético
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1 6-7 40 680 1.2 x 10
4
Packing ratio
Organização do DNA nu núcleo
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Scaffold Matrix Mitotic Interphase (nucleus)
The chromosome Scaffold
Remover DNA com nucleases e DNA com NaCl Proteínas não histonas Topoisomerase II Structural Maintenance of Chromosomes SMCs
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Codensin is involved in the organization of mitotic chromosomes
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Cohesin maintains sister chromatids together from G1 to end of Mitosis
DNA Condensin Cohesin
Cornelia de Lange Syndrome (1/10,000) severe developmental deffects
Mutations at SMC1/3 or SCC2 (chaperone of SCC1)
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O Genoma de um organismo
1 N = Haploide 2 N = Diploide
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Chromosome territories in human cells
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Gene localization changes within the nucleous in response to transcription
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Genomics
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DNA complexity
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25,000
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Repeats Transpose Repeat
TE
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Transposons
Barbara McClintock 1902-1992 Nobel prize of Physiology and Medicine 1983
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Transposition
- Normalmente reprimida - Pode ser activada - Induz alterações em genes - Induz quebras cromossomicas
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Transposons “copy paste via RNA or DNA”
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Transposons
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Heterocromatina
Eucromatina
Telómero Centrómero Telómero
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O Genoma humano
SINEs: Short Interspersed Nuclear Elements - Short <500 b - Transcribed by RNA pol III - Non-coding - Alu sequences (280 b) cut RE Alu - 1,5 M copies - Use TEs for mobilization
LINEs: Long Interspersed Nuclear Elements - Heterogenous in lenght - Transcribed by RNA pol II - Code for reverse transcriptase and endonuclease - 500,000 copies - Move by coping so enlarge the genome
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