PubMed/Como pesquisar, exibir, fazer download e enviar

por email os resultados(módulo 4.1)

MÓDULO 4.1 PubMed/Como pesquisar,

exibir, fazer download e enviar por email os resultados

Instruções

• Esta parte do curso é uma demonstração em Power Point para introduzir os conceitos de Pubmed.

• Esta parte do módulo é off-line e deve ser usada como referência.

Tópicos

Conectar-se ao PubMed Navegar no PubMed Selecionar um banco de dados para pesquisa Pesquisar no PubMed Dúvidas de traduções Mostrar opções Imprimir, salvar e opções para email

Logging on to HINARI 1

Antes de entrar nos sites das editoras, é necessário conectar-se ao site do HINARI através da URL http://www.who.int/hinari . Mude para o site em português e clique no botão CONECTAR

Na página inicial do HINARI, encontra-se o link para a página do HINARI em português.

Para se conectar na página eletrônica, é necessário digitar o código do usuário HINARI (user name) e a a senha (password) nos campos correspondentes e clicar no botão “Login” Nota: É preciso se conectar corretamente para ter acesso aos artigos na íntegra.

Entrando na área de revistas HINARI

Para entrar na área de acesso às revistas, selecione a opção “revistas em texto completo, bases de dados e outros recursos” na coluna da esquerda da página principal do HINARI.

A partir da página de “revistas em texto completo, bases de dados e outros recursos" pode-se acessar o PubMed através do link “Buscar artigos das revistas do HINARI via PubMed (Medline)”.

PubMed home page 1

Bem-vindos à página eletrônica do PubMedEsta parte do módulo mostrará a interface de pesquisa, as opções de mostrar na tela (display) as referências, as opções de acesso às referências e como enviar por email dos resultados.

Other NCBI databases

A barra preta acima da caixa de pesquisa contem links para outras bases de dados NCBI. As bases de dados destacadas acima são: PROTEIN, OMIM e revistas do PubMed. Para mudar entre as bases de dados clique no nome da base de dados.

NCBI – OMIM database

Aqui esta a base de dados OMIM.Para voltar ao PubMed clique no link que está na barra de base de dados.

PubMed home page 2

Do lado esquerdo da página eletrônica do PubMed há links para outros recursos do PubMed, como por exemplo, uma visão geral do PubMed (overview) ajuda e perguntas mais frequentes (help & FAQ), um Tutorial e notícias.

Abaixo, do lado esquerdo da página do PubMed estão também links para outras facilidades do PubMed como a base de dados de revistas, a base de dados MeSH (Medical Subject Headings), pesquisas clínicas, LinkOut e funções de citações.

PubMed home page 3

A caixa de pesquisa no PubMed está ativada. Digite neste espaço o assunto de sua busca.

PubMed search box

Neste exemplo nós entramos com a busca “malaria infections in Africa” na caixa de pesquisa. Para processar a busca clique no botão “Go”.

Results - default display

Os resultados da busca são listados no corpo da página.

Existem duas guias adicionais para Free full text (texto integral e gratuito) e artigos HINARI (disponível desde 07 2007). Estas são as pesquisas MyNCBI que estão incluídas em todas as consultas HINARI/PubMed (ver módulo 4.5).

Dos 1854 articles, 687 estão disponíveis are via HINARI e 330 na guia Free full text (há sobreposição).

The Details link

Para ver como o PubMed processou a busca, pode-se clicar no link “Details” (detalhes) destacado abaixo da caixa de pesquisa.

Details page

PubMed usa um mapeamento automático de termos. O details (detalhes) mostra como o software do PubMed divide em partes o assunto da busca. Neste exemplo o PubMed buscou por Malaria como uma palavra do texto (text word) e como um termo MeSH devido a identificação automática de termos. Africa e Infections são também buscadas como palavras do texto e como termos MeSH (descritores de assunto).

Results – display options

Destacados abaixo da caixa de pesquisa estão as opções de mostrar na tela os resultados encontrados - display. Os registros são apresentados em formato resumido, de 20 em 20 de um total de 1854, mostrados e ordenados pelo número de identificação do registro no PubMed – PubMed ID number.

Display formats

Há diferentes formatos disponíveis para mostrar na tela os resultados da busca. A partir da lista de opções da função display pode-se ver os possíveis formatos de escolha.No PubMed pode-se selecionar tanto o formato Summary (resumido), Brief (curto), Abstract (resumo), Citation (citação), como o formato Medline. Os demais formatos são para outras bases de dados do NCBI.Normalmente, usa-se como padrão, o formato Summary . Para mudar o formato, clique no botão “Display” e selecione o formato desejado.

Summary format

O formato resumido (Summary) mostra os nomes dos autores, o título do artigo, a fonte de publicação da citação mostrada e o número de identificação do registro no PubMed - PubMed ID number.

Brief format

A partir das opções da função Display pode-se selecionar o formato curto para apresentação dos registros - “Brief”.

Brief format 2

O formato curto (brief) mostra o nome do primeiro autor, parte do título do artigo e o número de identificação do registro no PubMed - ID number.

Abstract format 1

A opção Abstract (resumo) foi selecionada.

Abstract format – full text links

O formato “Abstract” destacado dentre as opções de display apresentará os "links" para as páginas eletrônicas dos editores que podem disponibilizar o texto completo do artigo. Neste exemplo, conectamos a página da editora Elsevier e ao lado encontramos o ícone HINARI que identifica o direito de acesso para as instituições registradas.

Abstract format – Affiliation information

O formato Abstract também fornece informações adicionais. Estes dados são somente do primeiro autor listado no artigo, e não de todos os autores.

AbstractPlus Example

Este é um exemplo do formato AbstractPlus. Note the realocação dos ícones HINARI e Elsevier.

Citation format 1

A opção de formato “Citation” (citação) é similar ao formato resumo (abstract), mas mostra algumas informações adicionais, como termos MeSH e nomes de substâncias.

Formato Citação – Informação MeSH

Aqui pode-se ver os termos MeSH (descritores de assunto) designados para este registro na indexação feita pela National Library of Medicine (NLM).

MEDLINE format 1

Aqui, selecionou-se a opção do formato “MEDLINE”.

MEDLINE field identifiers

O formato “MEDLINE” mostra todos os campos de um registro MEDLINE com o identificador do campo em cada linha.Este formato é o melhor para ser usado na exportação de registros para um software de gerenciamento de referências.

Number of records displayed

Há algumas opções de quantidade de referências a serem mostradas por página ( de 5 a 500 referências).

É aconselhável listar o máximo de referências possíveis por página para economizar tempo na mostra dos resultados, eliminando a necessidade de passar por inúmeras páginas.

Neste exemplo foi selecionada a opção “200” na caixa. Para mudar o número mostrado, clique em uma outra opção na mesma caixa.

Results pages

A página de resultados está agora listando os registros de 1 a 200 dos 1854 registros encontrados na busca.

Os artigos aparecem de 10 em 10.

Sorting options

Os resultados podem ser ordenados alfabeticamente por autor ou por título da revista, ou ainda pela data de publicação. Neste exemplo usou-se a opção “Journal” (revista). Para alterar a ordem alfabética, clique sobre uma das opções no menu.

Sorting by journal title

Pode-se ver os resultados de 1-200 mostrados em ordem alfabética pelo título da revista.

Selecting references

Para selecionar referências a partir dos resultados, marca-se o quadrado que aparece ao lado esquerdo dos registros.

Selecting references 2

Os resultados de 1 a 4 desta página foram marcados e estão selecionados.

Send to Text option 1

Os resultados selecionados podem agora ser formatados para impressão selecionando a opção “text” a partir das opções da função “send to” (enviar para).

Send to Text option 2

Esta é uma boa opção de formato de impressão.

Send to File 1

Para salvar os resultados selecionados em um disquete, CD, disco removível ou em seu computador, selecione a opção “file” a partir do menu da função “send to”

Send to File 2

Abra o arquivo ("open with notepad") e acrescente a extensão.txt (de texto). Para salvar o arquivo, selecione a opção Save File.

Send to Email 1

Para enviar os resultados selecionados por email escolha a opção email a partir do menu da função “send to”.

Send to Email 2

A partir desta tela pode-se escolher um formato e a forma de ordenar os resultados selecionados, e ainda acrescentar um texto de observação.

Send to Email 3

Digite um endereço de email na linha oferecida à frente do item E-mail.

Send to Email 5

Ao retornar à tela dos resultados, aparecerá uma barra de mensagem informando que o email foi enviado do servidor do PubMed para o endereço de email de um usuário.

Send to Clipboard 1

Os resultados selecionados também podem ser enviados para uma área de trabalho. Selecione a opção “Clipboard” a partir do menu da função “Send to”.

Send to Clipboard 2

Uma barra de informação aparecerá indicando o número de itens enviados para a área de trabalho, o limite de tempo que ficarão disponíveis até serem apagados e o número máximo de itens permitidos na área de trabalho.

Uma vez usada a guia HINARI e controlados os cinco itens, estes vão para a área de trabalho.

Send to Clipboard 3

Para recuperar os itens colocados na sua área de trabalho, clique na opção Clipboard que está abaixo da caixa de pesquisa.

Send to Clipboard 4

Dentro da área de trabalho pode-se reformatar e listar os resultados da mesma forma e com as mesmas opções oferecidas a partir da página principal dos resultados. Aqui, foi escolhida a opção Abstract (resumo).

Send to Clipboard 5

Para remover um item da área de trabalho, selecione o item a ser removido e escolha a opção “Clip Remove” a partir do menu da função “Send to”.

Send to Clipboard 6

Uma barra de informação aparecerá confirmando quantos itens foram removidos da área de trabalho.

This is the end of Module 4 Part 1

Este é o fim do módulo 4 parte 1

Há um caderno de exercícios que acompanha esta parte do módulo. O caderno traz exercícios práticos sobre os temas apresentados neste módulo.

Atualizado 01 2009