“A gel-based proteomic method reveals several protein pathway

abnormalities in fetal Down syndrome brain”. Yanwei sun

Daniel vanegas elorzaJessica posada hernandez

Seminario molecularTercer semestre

Medicina- upb2011

INTRODUCTIONDown syndrome (DS): Is the most common

human genetic disorder that occurs at a rate of 1 in 700-800 live births. The individuals have an extra copy of the entire chromosome 21. DS involves dysmorphic features, hematological and endocrinal alterations, behavioral and cognitive deficits, mental retardation.

Proteomic: Is the large-scale study of proteins used to

determinate their structures and functions, and the regulation of biological systems.

DS is a genetic disorder that involves a extra chomosome generating 47 when in normal situation the number is 46. the extra one generates an increment of syntesis of protein what causes neurological and metabolic disorders. Thank proteomic is possible to know wich protein has and irregular function that causes me some desase in the syndrome.

General objectiveRecognize the proteins that are involved in

fetal Down syndrome brain discovered by the method of a gel based proteomic.

MATERIALES Y METODOSPreparación de la muestra: Para el estudio se utilizaron muestras de corteza

frontal las cuales se obtuvieron de 2 grupos de fetos , de los cuales 7 presentaban sindrome de down con trisomia del 21 y 7 fetos sanos.

Electroforesis en 2 dimensiones:

Técnica utilizada para la separación de proteínas según su morfologia, lo que permite su distinción y análisis.

En el estudio se realizó para la separación de las proteínas obtenidas en los tejidos de fetos normales y con síndrome de Down para su diferenciación.

Cuantificación de Proteínas: Se utiliza para determinar la comparación entre

el total de proteínas de la electroforesis (2D) y el porcentaje de puntos proteicos.

Esta cuantificación en el estudio permitió conocer la cantidad de proteínas presentes para asi poder compararlas y establecer los puntos proteicos que en el síndrome de Down se encuentran sobreexpresadas.

Análisis Péptidos Estudio y caracterización

de todo el conjunto de proteínas expresadas de un genoma;para identificar, categorizar y clasificalas según su función e interacción entre ellas.

Se utilizó para descubrir la diferencia que existia entre las proteinas de los fetos con y sin el DS , teniendo en cuenta que solo se estudiaron las que no compartian peptidos con otras proteinas.

Western Blot: Técnica utilizada para la identificación de

proteínas a partir de la electroforesis y posteriormente a la incubacion con anticuerpos que reaccionan contra estas. De este modo es posible reconocer la proteina contra la cual está dirigido el anticuerpo.

En el estudio esta técnica fue útil para la detección de proteínas anormales que confirman el síndrome de Down.

RESULTADOS

Fig. 2 – Amap of a typical 2-DE gel demonstrating the aberrantly expressed proteins is shown providing assignments of proteín spots to protein names (Coomassie staining).

Fig. 3 – Western blot images using specific antibodies against four of the dysregulated proteins confirming gel-based

proteomics results are shown.

Bauer J. and Kim SH The manifold decrease of creatine kinase B-type in fetal DS cortex may point to deficient energy metabolism that in turn may explain a series of cardinal central nervous system symptoms of DS

Yes

Lai MC RNA-binding protein 4B not only modulates alternative pre-mRNA splicing but also acts antagonistically to authentic serine/arginine rich proteins in splice site and exon selection.

Yes

De Parseval N. and Deininger PL.

In laboratory mice, 10% of spontaneous mutations are caused by retrotransposition, although in the human population, this percentage is much lower.

Yes

Engidawork E, Shin JH, Gulesserian T, Krapfenbauer K.

A series of proteins have been reported to be deranged by a comparable gel-based proteomic method.

No

CONCLUSIONS The proteomic and the gel-based

 electrophoresis are very important studies that provide and support protein information to diagnose genetic anormalities that produce pathologies.

  Proteins require specific methods like western

blot, 2DE and others mentioned before for identify them by their morphology, weight or function.

Proteins are macromolecules that  have different functions and they are specified according to where they are.

The altered concentrations of proteins due to poor expression of a gene set diagnostic differences between different genetic diseases, and lead to the diagnosis of these even before birth