2 º Guerra Mundial N ATHAN G ABRIEL M AMEDES N ATHAN G ABRIEL M AMEDES M ECÂNICA 1.
Introdução - GBIF · 2017. 9. 4. · Curso de formação: Publicação de dados de biodiversidade...
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Curso de formação:
Publicação de dados de biodiversidade através do GBIF
Rui Figueira
Nó Português do GBIF, Instituto Superior de Agronomia, Universidade de Lisboa
Introdução
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Curso de formação: Publicação de dados de biodiversidade através do GBIFISA, 4-6 Setembro 2017
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BLOCO 1 – INTRODUÇÃO GERAL
1.1. O panorama da informática para a biodiversidade e o papel do GBIF
1.2. Importância da publicação de dados através do GBIF
1.3. Ciência Aberta e Dados Abertos
1.4. Fluxo de publicação de dados através do GBIF
SUMÁRIO
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Curso de formação: Publicação de dados de biodiversidade através do GBIFISA, 4-6 Setembro 2017
GBIF EM NÚMEROS Dados de
ocorrência de espécies
Instituiçõespublicadoras
https://demo.gbif.org/the-gbif-network
783.732.6082.592.455
447.939
Global:
Para PT:
Por PT:
1.33416
Global:
De PT:
54 países / 40 participantes associados
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GBIF A NÍVEL NACIONAL
NÓNACIONAL
UNIVERSI-DADES
UNIDADES DE I&D MUSEUS CIÊNCIA
CIDADÃSECTORPRIVADO
INVESTI-GADORES
PUBLICAÇÃO / USO / FORMAÇÃOINST.
PÚBLICOS
USO / FORMAÇÃO
RIPORBIOTA
INFRAESTRUTURA PADRÕESFORMAÇÃO
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DADOS PUBLICADOS PELO GBIF
Baseados em Observações● Projectos científicos● Monitorização / amostragens /
inventários● Ciência Cidadã
Baseados em Espécimes● Coleções biológicas (incluindo HN)● Bancos de germoplasma / coleções
vivas
OCORRÊNCIAS E DADOS DE AMOSTRAGENS
CHECKLISTS
METADADOS
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PORTAIS de DADOSNACIONAL: http://dados.gbif.ptGLOBAL: http://www.gbif.org
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PUBLICAÇÃO PORINSTITUIÇÕES PORTUGUESAS
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VANTAGENS DA PUBLICAÇÃO DE DADOS ATRAVÉS DO GBIF
● Plataforma global: dados padronizados → indexação → pesquisa
● Fácil citação do uso através de DOI
● Mais citações → Maior impacto
● Preservação dos dados
● Rastreamento e informação sobre o uso dos dados
● Dados mantém a propriedade original
● Licença padrão: CC0, CC-BY, CC-BY-NC
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USO DOS DADOS
Palavras-chave de ~1900 artigos que citam o GBIFhttp://www.mendeley.com/groups/1068301/gbif-public-library/
4200 artigos científicos
108 para autores com afiliação portuguesa
2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016 20170
20
40
60
80
100
120
Portugal
2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016 20170
50010001500200025003000350040004500
Global
nº
art
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sIm
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Gar
cia
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http://www.biodiversityinformatics.org
ENQUADRAMENTO GLOBAL
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http://www.biodiversityinformatics.org
ENQUADRAMENTO GLOBAL
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http://www.biodiversityinformatics.org
ENQUADRAMENTO GLOBAL
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O PANORAMA GLOBAL
GBIF coopera com outras organizações ou iniciativas internacionais, que desenvolvem actividade complementar: - Catalogue of Life, Encyclopedia of Life, Biodiversity Heritage Library, BOLD, Plazi- LifeWatch, DISSCO, CETAF;- EEA- CBD, IPBES, UNEP-WCMC- comunidade: TDWG- desenvolvimento de um curriculum académico em informática para a biodiversidade
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Imag
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BLOCO 1 – INTRODUÇÃO GERAL
1.1. O panorama da informática para a biodiversidade e o papel do GBIF
1.2. Importância da publicação de dados através do GBIF
1.3. Ciência Aberta e Dados Abertos
1.4. Fluxo de publicação de dados através do GBIF
SUMÁRIO
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Curso de formação: Publicação de dados de biodiversidade através do GBIFISA, 4-6 Setembro 2017
PORQUÊ PUBLICAR DADOS ATRAVÉS DO GBIF?
Aumentar o impacto
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PORQUÊ PUBLICAR DADOS ATRAVÉS DO GBIF?
A disponibilidade dos dados da investigação científica decresce rapidamente com a idade
Vines, Timothy H et al.. 2014. “The Availability of Research Data Declines Rapidly with Article Age.” Current Biology 24 (1): 94–97. doi:10.1016/j.cub.2013.11.014.
Assegurar a preservação e acessibilidade dos dados
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PORQUÊ PUBLICAR DADOS ATRAVÉS DO GBIF?
Aumentar a visibilidade da colecção / bd
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PORQUÊ PUBLICAR DADOS ATRAVÉS DO GBIF?
Potenciar investigação inovadora
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PORQUÊ PUBLICAR DADOS ATRAVÉS DO GBIF?
Requisito do financiador
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PORQUÊ PUBLICAR DADOS ATRAVÉS DO GBIF?
Compromisso assumido por Portugal, através da Declaração do Rio de Janeiro (2003),durante a cimeira de MCT da CPLP, de partilha e disponibilização, por via digital, do patrimóniocientífico nacional com origem nos países da CPLP.
Responder à missão da instituição/ Responsabilidade social
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PORQUÊ PUBLICAR DADOS ATRAVÉS DO GBIF?
Ciência cidadã / participação social
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PRINCIPAIS MOTIVAÇÕES PARA A PUBLICAÇÃO DE DADOS
Aumentar do impacto científico
Aumentar a exposição a nível global, valorizando
Facilitar a revisão das colecções por especialistas
Assegurar a preservação dos dados
Responder a compromissos internacionais
Responder ao interesse de comunidades específicas
Cumprir requisitos do financiador
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PRINCIPAIS MOTIVAÇÕES PARA A PUBLICAÇÃO DE DADOS
Executar a decisão política - adopção de acesso aberto
● Maximizar o reconhecimento pelo uso dos dados
● Potenciar nova investigação
● Promover a boa gestão de recursos naturais
Melhorar a qualidade dos estudos de impacte ambiental
Promover a capacitação
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BARREIRAS À PUBLICAÇÃO DE DADOS
Psicológicas e culturais
– falta de conhecimento
– falta de vontade
– qualidade dos dados
Institucionais
– privacidade
– autorização
Capacidade e recursos
– tempo / planificação
– capacidade
Práticas
– fundos / RH
– infraestrutura
Sharon Grant. Foundations for the BID Workshop – Biodiversity Data Mobilization. Kigali 2016
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BLOCO 1 – INTRODUÇÃO GERAL
1.1. O panorama da informática para a biodiversidade e o papel do GBIF
1.2. Importância da publicação de dados através do GBIF
1.3. Ciência Aberta e Dados Abertos
1.4. Fluxo de publicação de dados através do GBIF
SUMÁRIO
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Curso de formação: Publicação de dados de biodiversidade através do GBIFISA, 4-6 Setembro 2017
CIÊNCIA ABERTA / DADOS ABERTOS
FAIR
Findable, Accessible, Interoperable, Reusable.
http://www.ciencia-aberta.pt/
FACILITATE OPEN SCIENCE TRAINING FOR EUROPEAN RESEARCH
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Curso de formação: Publicação de dados de biodiversidade através do GBIFISA, 4-6 Setembro 2017
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BLOCO 1 – INTRODUÇÃO GERAL
1.1. O panorama da informática para a biodiversidade e o papel do GBIF
1.2. Importância da publicação de dados através do GBIF
1.3. Ciência Aberta e Dados Abertos
1.4. Fluxo de publicação de dados através do GBIF
PARTE 1.4
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TIPOS DE DADOS PUBLICADOS ATRAVÉS DO GBIF
DA
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Def
ense
Adv
ance
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Pro
ject
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genc
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)
● Metadados de recursos de dados
● Lista de espécies (Checklists)
● Dados de ocorrênciaCORE: OCORRÊNCIA
● Dados baseados em eventos de amostragens ou inventários
CORE: EVENTO
Os dados podem ser apenas publicados por INSTITUIÇÕES ou ORGANIZAÇÕES.
Os cidadãos podem publicar através de projectos de ciência cidadã
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TIPOS DE DADOS PUBLICADOS ATRAVÉS DO GBIF
DA
RP
A -
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Adv
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Pro
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)
Fontes de dados:
- colecções zoológicas, de herbário, microbianas, de tecidos, de ADN, bancos de germoplasma, colecções vivas;
- dados de satélite, armadilhas, câmaras fotográficas ou vídeo automáticas;
- teses, relatórios, literatura;
- bases de dados de observações, programas de monitorização, estudos de impacte ambiental;
- projectos de ciência cidadã;
- listas de espécies, checklists, listas vermelhas.
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TIPOS DE DADOS PUBLICADOS ATRAVÉS DO GBIF
DA
RP
A -
Def
ense
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Pro
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genc
y (D
AR
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)
https://www.gbif.org/sampling-event-data
Dados baseados em eventos de amostragem ou inventários - estrutura
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FLUXO DE PUBLICAÇÃO DE DADOS ATRAVÉS DO GBIF
DA
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Adv
ance
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Pro
ject
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genc
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AR
PA
)
1. Estabelecer acordos/autorizações institucionais
2. Fazer o registo e solicitar o aval pelo Nó:https://www.gbif.org/become-a-publisher
- Tomar conhecimento do Acordo de Publicação de dadoshttps://www.gbif.org/terms/data-publisher - Tomar conhecimento do Acordo de Uso de dadoshttps://www.gbif.org/terms/data-user
3. Seleccionar as ferramentas de publicação e estabelecer a infraestrutura
Pode usar-se o serviço IPT.GBIF.PT para alojamento dos dados
4. Preparar os dados para publicaçãoFormatar segundo o padrão de dados, fazer verificação de qualidade
5. Seleccionar uma licença (CC0, CC-BY, CC-BY-NC) (pode ser definida para cada dataset)
PASSOS INSTITUCIONAIS (1ª vez)
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PREPARAÇÃO DE UM CONJUNTO DE DADOS
Dados Padronização(DwC)
Descrição(metadados)
Validação
Publicação de dados
Publicação de metadados
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Curso de formação: Publicação de dados de biodiversidade através do GBIFISA, 4-6 Setembro 2017
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