Como elaborar um relatório científico da pesquisa Nance Beyer Nardi Departamento de Genética.
Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas.
Transcript of Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas.
![Page 1: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas.](https://reader035.fdocumentos.tips/reader035/viewer/2022081511/552fc12b497959413d8cf3a3/html5/thumbnails/1.jpg)
Departamento de Genética
DEPARTAMENTO DE GENÉTICA:perspectivas
![Page 2: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas.](https://reader035.fdocumentos.tips/reader035/viewer/2022081511/552fc12b497959413d8cf3a3/html5/thumbnails/2.jpg)
DEPARTAMENTO DE GENÉTICA
Unidade de Citogenética
Unidade de Genética Médica
Unidade de Genética Molecular
Unidade de Bioquímica
Genética
Unidade de Investigação e
Desenvolvimento
Núcleo deApoio
Departamento de Genética
![Page 3: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas.](https://reader035.fdocumentos.tips/reader035/viewer/2022081511/552fc12b497959413d8cf3a3/html5/thumbnails/3.jpg)
Núcleo de Apoio
• Articulação com as assessorias de apoio técnico especializado
• Gestão de recursos humanos do Departamento
• Gestão do plafond financeiro atribuído ao departamento
• Melhoria contínua da qualidade
• Registo de bases de dados
• Colaboração com o site do INSA, coordenação da formação (…)
• Apoio administrativo e laboratorial (…)
Funções:
Departamento de Genética
![Page 4: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas.](https://reader035.fdocumentos.tips/reader035/viewer/2022081511/552fc12b497959413d8cf3a3/html5/thumbnails/4.jpg)
Recursos Humanos
Recursos humanos por carreira
Auxiliar7%
Administrativa6%
Enfermagem2%
Técnico de diagnóstico e terapêutica
20%
Técnica Superior de Saúde+Técnica
superior25%
Médica Hospitalar4%
Investigação Cientifica
6%Bolseiros, estagiários
e voluntários30%
Distribuição por carreira e área geográfica
05
101520253035
InvestigaçãoCientifica
MédicaHospitalar
TécnicaSuperior de
Saúde+Técnicasuperior
Enfermagem Técnico dediagnóstico eterapêutica
Administrativa Auxiliar Bolseiros,estagiários evoluntários
Lisboa Porto
Departamento de Genética
![Page 5: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas.](https://reader035.fdocumentos.tips/reader035/viewer/2022081511/552fc12b497959413d8cf3a3/html5/thumbnails/5.jpg)
Genética Médica-Patologia genética-Diagnóstico pré-natal,…
Nutrição Psicologia Assistente Social
Enfermagem
Unidade de Genética Médica
Unidade de Genética MédicaFunção para cumprimento da missão: Prestação de Serviços
![Page 6: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas.](https://reader035.fdocumentos.tips/reader035/viewer/2022081511/552fc12b497959413d8cf3a3/html5/thumbnails/6.jpg)
Citogenética clássica:cariotipos Hibridação in situ
(FISH)
Hibridação Genómica Comparativa (CGH)
21
21
1813
XY
21
1318
X Y
21
18
13
X Y
2118
13X Y
21
1813
X
21
1813X
2118
13X
211813
X
Ex.: Trissomia 21
MLPA
Unidade de Citogenética Alterações cromossómicas: da convencional à molecular
Departamento de Genética
Unidade de CitogenéticaFunção para cumprimento da missão: Prestação de Serviços
![Page 7: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas.](https://reader035.fdocumentos.tips/reader035/viewer/2022081511/552fc12b497959413d8cf3a3/html5/thumbnails/7.jpg)
Unidade de Citogenética Oferta de serviços
Departamento de Genética
• Estudo cromossómico na população e no feto (DPN cromossómico);
• Estudo cromossómico de neoplasias (tumores sólidos e doenças hematológicas malignas);
• Análise molecular rápida de aneuploidias permite uma tomada de decisão terapêutica mais precoce;
• Estudos por hibridação in situ (FISH) contribuem para uma caracterização mais precisa em muitos casos de anomalia citogenética constitucional e oncológica.
Unidade de CitogenéticaFunção para cumprimento da missão: Prestação de Serviços
![Page 8: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas.](https://reader035.fdocumentos.tips/reader035/viewer/2022081511/552fc12b497959413d8cf3a3/html5/thumbnails/8.jpg)
1 - Realizar testes genéticos de base molecular em diferentes doenças genéticas, no período pré-natal e pós-natal; Testes de diagnóstico, preditivos e de rastreio populacional
2 – Participação em programas de avaliação externa da qualidade laboratorial, prestação de assessoria científica e técnica
3 – Participação em actividade de formação e disseminação da cultura científica
4 – Implementação/manutenção da certificação de qualidade e acreditação dos ensaios laboratoriais
5 - Valorização científica dos resultados dos testes genéticos em conjugação com outras Unidades do DG, predominantemente com a I&D
Objectivos / Missão
Unidade de Genética Molecular
Departamento de Genética
Unidade de Genética MolecularFunção para cumprimento da missão: Prestação de Serviços
![Page 9: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas.](https://reader035.fdocumentos.tips/reader035/viewer/2022081511/552fc12b497959413d8cf3a3/html5/thumbnails/9.jpg)
Cancro da mama Cancro do cólonDiferenciação sexual e Inf. masculinaDoenças hemorrágicas hereditárias Doenças priónicasFactores genéticos de risco trombóticoFibrose quísticaHemocromatoseHemoglobinopatiasMalignidade hematológicaNeuroblastomaSíndrome de Lowe e doença de NorrieSíndrome de imunodef. por hiper IgMTrombofilias hereditárias,…
PortoLisboa
Atrofia muscular espinhalCardiomiopatiasDistrofias muscularesDeterminação de zigotiaHipertermia malignaHipotiroidismo congénitoMiopatias congénitasNeuropatiasAtraso mental ligado ao cromossoma XRastreio rápido de aneuploidiasSínd. Schwachman-Bodian-DiamondSínd. de Gilbert e de Crigler-NajjarSínd.de Cornélia de Lange,…
Departamento de Genética
Unidade de Genética MolecularFunção para cumprimento da missão: Prestação de Serviços
Unidade de Genética Molecular
PortoLisboa
![Page 10: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas.](https://reader035.fdocumentos.tips/reader035/viewer/2022081511/552fc12b497959413d8cf3a3/html5/thumbnails/10.jpg)
Departamento de Genética
Unidade de Bioquímica GenéticaFunção para cumprimento da missão: Prestação de Serviços
Doenças Hereditárias do Metabolismo (DHM)
lisossomal peroxissomal energético intermediário
Mucopolis-sacaridoses
Biogénese Défices da cadeia
respiratória mitocondrialAminoacidopatias
Oligos-sacaridoses
Défice enzimático ou de
proteínaGlicogenoses
Acidúrias orgânicas e défices da beta-oxidação
Esfingo-lipidoses
Défices da glicosilação
LipidosesDéfices da biosíntese do
colesterol
Défices do metabolismo dos neurotransmissores
Caracterização genotípica, haplotipica e fenotípica
Rastreio neonatal para terapêutica de restrição dietética
Diagnóstico pós-natal para terapêutica de suplementação enzimática
Estabelecimento de repositório de linhas celulares de DHM
Unidade de Bioquímica Genética
![Page 11: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas.](https://reader035.fdocumentos.tips/reader035/viewer/2022081511/552fc12b497959413d8cf3a3/html5/thumbnails/11.jpg)
Departamento de Genética
Laboratório de Proteómica
Unidade de Bioquímica GenéticaFunção para cumprimento da Missão: Prestação de serviços
(em implementação)
IP: Deborah Penque
Laboratório de Proteómica
Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado
InvestigaçãoInvestigação
• Doenças Crónicas Pulmonares (Fibrose quística, Asma, DPOC) (Projectos FCT: POCTI/MGI/40878/2001, POCI/ESP/44720/2002, POCTI/SAU-MMO/56163/2004))
• Doenças Hepáticas (Projecto APDF, Projecto FCT: POCTI/SAU-IMI/55112/2004 )
• Colabora em outros projectos (externos/internos ao INSA)
Serviços (em implementação)Serviços (em implementação)
• Análise de proteínas por gel 2D
• Identificação de proteínas por MALDI/TOF/TOF
• Diagnóstico/Prognóstico de doenças pela proteómica (Projecto QCAIII, Saude XXI/2005)
![Page 12: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas.](https://reader035.fdocumentos.tips/reader035/viewer/2022081511/552fc12b497959413d8cf3a3/html5/thumbnails/12.jpg)
Modelos biológicos
Linhas celulares
Plataforma TecnológicaPlataforma TecnológicaPlataforma TecnológicaPlataforma Tecnológica
Soro/plasma
Fibrose Quística, Asma, DPOC
Sistema
respiratório
Identificar proteínas diferencialmente expressas nestas doenças como potenciais biomarcadores de diagnóstico/prognóstico ou alvos terapêuticos alternativos
Identificar proteínas diferencialmente expressas nestas doenças como potenciais biomarcadores de diagnóstico/prognóstico ou alvos terapêuticos alternativos
Geís 2D/ MSGeís 2D/ MS SELDI-TOFSELDI-TOF LC/MSLC/MS
Modelos animais
Material biológico nativo
Departamento de Genética
Estratégias utilizadas no Estudo de Doenças Pulmonares Crónicas pela Proteómica
Unidade de Bioquímica GenéticaFunção para cumprimento da Missão: Prestação de serviços
(em implementação)
![Page 13: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas.](https://reader035.fdocumentos.tips/reader035/viewer/2022081511/552fc12b497959413d8cf3a3/html5/thumbnails/13.jpg)
Unidade de Investigação e Desenvolvimento (I&D)
Departamento de Genética
• Compreender a acção dos genes, as interacções entre si e com o ambiente, como se expressam e regulam e como contribuem para a variação fenotípica normal e patológica.
• Estabelecer correlações genótipo/fenótipo, visando descobrir novos biomarcadores com potencial valor diagnóstico, prognóstico ou terapêutico e proceder à respectiva validação analítica e clínica.
• Esclarecer os mecanismos moleculares e celulares do cancro, assim como os efeitos genotóxicos associados à exposição ambiental, ocupacional ou acidental a agentes físicos, químicos e biológicos.
• Estudar a genética da susceptibilidade a doenças frequentes.
• Realizar estudos de epidemiologia genética nas populações residentes em Portugal ou outras populações de interesse.
• Identificar e priorizar necessidades de I&D em genética, de acordo com as prioridades estratégicas nacionais e internacionais.
Unidade de Investigação e DesenvolvimentoFunção para cumprimento da missão: Laboratório de Estado
![Page 14: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas.](https://reader035.fdocumentos.tips/reader035/viewer/2022081511/552fc12b497959413d8cf3a3/html5/thumbnails/14.jpg)
• Estabelecimento de plataformas instrumentais de análise multiplex e mecanismos analíticos recorrendo a nanotecnologias
• Aplicação de inteligência artificial na gestão do processo analítico e no diagnóstico diferencial
• Genotipar SNP para identificação do Varioma humano nas doenças hereditárias do metabolismo – contribuição para o registo e criação de bases de dados de nível global e de consulta universal
• Metabolómica na identificação de biomarcadores em fluidos fisiológicos humanos
• Proteómica na identificação de proteínas, modificações pós-translacionais, análise de péptidos e moléculas, no estabelecimento de mecanismos patofisiológicos em modelos in vitro (culturas celulares)
• Estudo da disfunção celular na etiologia das formas variantes ou atípicas versus formas clássicas das doenças
Departamento de Genética
Unidade de I&DFunção para cumprimento da missão: Laboratório de Estado
IP: Lucia Lacerda
Doenças Hereditárias do Metabolismo
![Page 15: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas.](https://reader035.fdocumentos.tips/reader035/viewer/2022081511/552fc12b497959413d8cf3a3/html5/thumbnails/15.jpg)
Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado
Estudo dos mecanismos fisiopatológicos primários e secundários de doenças lisossomais de sobrecarga (DLS)
Departamento de Genética
IP: Sandra Alves
Substrato
Produtos
1
2
Resultados:• Caracterização das variações genéticas causais de DLS na população portuguesa: Mucopolissacaridoses tipo II, IIIA, IIIB e IIIC, Mucolipidoses II e III, Sialidose e Galactosialidose;• Impacto das mutações encontradas ao nível do RNA mensageiro e na estrutura e função da proteína;• Correlações genótipo-fenótipo;• Desenvolvimento de métodos analíticos para detecção de alelos mutantes com vista à implementação de estratégias de diagnóstico molecular (Ex: diagnóstico pré-natal molecular e rastreio de portadores nas famílias em risco).
Bases celulares e bioquímicas das doenças de sobrecarga lisossomais 1. Enzima lisossomal com actividade catalítica reduzida ou mesmo nula.2. Falhas no transporte de enzimas lisossomais do complexo de Golgi para o lisossoma.
Objectivo: Estudar os factores genéticos que afectam a formação e/ou transporte de enzimas lisossomais – estudos moleculares, bioquímicos e funcionais
Alves S et al. (2006) J Inherit Metab Dis, 29:743-54.
Mangas M et al. (2008) Clin Genet, 73:251-6.
Coutinho MF et al.(2008) Clin Genet, 74:194-5.
![Page 16: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas.](https://reader035.fdocumentos.tips/reader035/viewer/2022081511/552fc12b497959413d8cf3a3/html5/thumbnails/16.jpg)
Investigação em doenças raras: Doenças lisossomais de sobrecarga
Departamento de Genética
Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado
IP: Olga Amaral
Dvir et al; Premkumar et al
Mutações com origens comuns em doenças raras? Fundadores portugueses?
0%
20%
40%
60%
80%
100%
Portugal
: 200
4, u
npublished
Spain: 1
995,
Cor
man
d et a
l
Spain: 2
001,
Alfo
nso e
t al
Italy
: 200
2, F
iloca
mo e
t al
Franc
e: 1
998,
Ger
mai
n et a
l
Greec
e: 1
995,
Mic
helak
akis
et a
l
Great
Brit
ain/
Irela
nd: 199
7, H
atto
n et a
l
Germ
any:
199
7, le
Coutre
et a
l
Holland:
199
7, B
oot et a
l
Poland: 1
996,
Tyl
ki-S
zym
ansk
a et
al
Jewis
h: 199
5, G
rabowsk
i, NIH
,
Ashke
nazi t
ype
1: 2
000,
Kopr
ivic
a
Amer
ican
, non-J
ewis
h type
1: 2
000,
Kopriv
ica
et a
l
Austra
lasi
an (m
ixed
): 19
94, L
ewis
et a
l
Japan
: 199
7, Id
a et
al
Argen
tina
(mix
ed):
1998
, Corm
and e
t al
mu
tan
t al
lele
s
0
20
40
60
80
100
0 200 400 600
% a
cti
vit
y r
em
ain
ing
Objectivo: >compreender mecanismos patogénicos > potencial para novas abordagens > melhorar a capacidade de prognóstico e de resposta
• Caracterizar as mutações encontradas nos genes dos doentes e a disfunção proteica originada• Epidemiologia genética
Investigar as disfunções a nível proteico
Esclarecer mecanismos patológicos e permitir prever as consequências fenotípicas
Frisch et al, 2004 ; Diaz et al, 2000 e 1999; Colombo, 2000 ; Amaral et al, 1997, 1999 e 2000; Marí et al, 2001
![Page 17: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas.](https://reader035.fdocumentos.tips/reader035/viewer/2022081511/552fc12b497959413d8cf3a3/html5/thumbnails/17.jpg)
Investigação na Lipofuscinose Ceróide Neuronal
Departamento de Genética
Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado
IP: Maria Gil Ribeiro
COPII
LE
EE
N
L
ER
G
CLN1/ CLN2/ CLN5/ CLN7/ CLN10
CLN6/ CLN8RE
CLN2/ CLN3
CLN2/ CLN3
CLN6/CLN8
CLN2/ CLN3/ CLN6/ CLN8
CLN2/ CLN3/ CLN6/ CLN5/ CLN8LR
Grupo de doenças genéticas neurodegenerativas progressivas e fatais que apresentam semelhanças clínicas e patológicas (acumulação de um lipopigmento no lisossoma)
Estas doenças estão associadas a 8 proteínas (lisossomais e não lisossomais) com função celular desconhecida
Estudo dos mecanismos moleculares patogénicos primários e análise funcional:
Caracterização de mutações e estudos de expressão génica ao nível do RNA e proteína (processamento, modificações pós-traducionais, localização, tráfego intracelular e interacção com outras proteínas CLN)
Bessa et al. (2008) Mol Genet Metab 93:67-73
Identificação de alterações moleculares secundárias (ao nível da transdução de sinal mediada por lípidos) com importância fisiopatológica e/ou terapêutica
Teixeira et al. (2006) Biochim Biophys Acta 1762:637-646
Objectivo:
Ferramentas:- Análise in silico- PCR, RT-PCR, qRT-PCR, Sequenciação- Silenciamento de genes (RNAi)- Análise por Western blot- Imunocitoquímica- Análise lípidos (TLC e microscopia de fluorescência) - Análogos lipídicos fluorescentes
Golgi
Endosomes
C
CLN6
![Page 18: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas.](https://reader035.fdocumentos.tips/reader035/viewer/2022081511/552fc12b497959413d8cf3a3/html5/thumbnails/18.jpg)
Grupo heterogéneo de doenças clínicas, que têm na sua origem alterações do metabolismo energético celular
autosómica recessiva autosómica dominante
X-linked maternal
esporádica
A cadeia respiratória mitocondrial é o resultado da interacção de dois genomas física e funcionalmente separados, ADN nuclear (nADN) e ADN mitocondrial (mtADN)
Estas doenças afectam pessoas em qualquer idade, com quaisquer sintomas e qualquer modo de hereditariedade
Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado
Doenças Mitocondriais
Departamento de Genética
IP: Laura Vilarinho
![Page 19: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas.](https://reader035.fdocumentos.tips/reader035/viewer/2022081511/552fc12b497959413d8cf3a3/html5/thumbnails/19.jpg)
Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado
Polineuropatia Amiloidótica Familiar
Departamento de Genética
IP: Paulo Pinho e Costa
Foco
Epidemiologia PAF Outras amiloidoses hereditárias
Fisiopatologia Anemia e função renal
Novas abordagens Prevenção - DGPI Terapêutica – Ensaios Clínicos
Foco
Epidemiologia PAF Outras amiloidoses hereditárias
Fisiopatologia Anemia e função renal
Novas abordagens Prevenção - DGPI Terapêutica – Ensaios Clínicos
Investigadores Doutorados
Paulo Pinho e Costa, MD, PhD Luisa Lobato, MD, PhD
Outros Idalida Beirão, MD Luciana Moreira, MSc
Investigadores Doutorados
Paulo Pinho e Costa, MD, PhD Luisa Lobato, MD, PhD
Outros Idalida Beirão, MD Luciana Moreira, MSc
Internacionalização
U. Florença, IT P. Romagnani – Centro DENOthe
H. Univ. Charité, Berlim, DE C. Bachmann - Institut für Vegetative Anatomie
Internacionalização
U. Florença, IT P. Romagnani – Centro DENOthe
H. Univ. Charité, Berlim, DE C. Bachmann - Institut für Vegetative Anatomie
Colaborações Institucionais
Universidade do Porto UMIB – ICBAS F. Medicina
Centro Hospitalar do Porto HGSA
Colaborações Institucionais
Universidade do Porto UMIB – ICBAS F. Medicina
Centro Hospitalar do Porto HGSA
Produção científica 2007-2008 3 artigos em revistas de circulação internacional Numerosas comunicações em congressos
Produção científica 2007-2008 3 artigos em revistas de circulação internacional Numerosas comunicações em congressos
![Page 20: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas.](https://reader035.fdocumentos.tips/reader035/viewer/2022081511/552fc12b497959413d8cf3a3/html5/thumbnails/20.jpg)
Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado
Doenças crónicas e degenerativas de genética complexa
Departamento de Genética
IP: Paulo Pinho e Costa
Foco Doenças neurológicas, inflamatórias
e auto-imunes seleccionadas Esclerose Múltipla Epilepsia Lúpus Eritematoso Sistémico Artrite Reumatóide Dislipidemia e aterosclerose
Imunogenética MHC e extra-MHC
Biologia dos sistemas Análise de redes de interacção genética
Foco Doenças neurológicas, inflamatórias
e auto-imunes seleccionadas Esclerose Múltipla Epilepsia Lúpus Eritematoso Sistémico Artrite Reumatóide Dislipidemia e aterosclerose
Imunogenética MHC e extra-MHC
Biologia dos sistemas Análise de redes de interacção genética
Investigadores Doutorados
Berta Martins da Silva, PhD Paulo Pinho e Costa, MD, PhD
Outros Pedro Lacerda Cláudia Carvalho, MSc
Investigadores Doutorados
Berta Martins da Silva, PhD Paulo Pinho e Costa, MD, PhD
Outros Pedro Lacerda Cláudia Carvalho, MSc
Internacionalização SLE
Karolinska Institute, SE – Marta Alárcon U. Tel-Aviv, IL – Y. Schoenfeld
EM U. Cambridge, UK – Alastair Compston U. Navarra, ES – Pablo Villoslada
Epilepsia U. Utrecht, NL – Dick Lindhout
Bioinformática – Biologia dos sistemas U. Geneve, CH – José M Nunes, Alicia Mawas U. Navarra, ES – Pablo Villoslada
Internacionalização SLE
Karolinska Institute, SE – Marta Alárcon U. Tel-Aviv, IL – Y. Schoenfeld
EM U. Cambridge, UK – Alastair Compston U. Navarra, ES – Pablo Villoslada
Epilepsia U. Utrecht, NL – Dick Lindhout
Bioinformática – Biologia dos sistemas U. Geneve, CH – José M Nunes, Alicia Mawas U. Navarra, ES – Pablo Villoslada
Colaborações Institucionais Universidade do Porto
UMIB - ICBAS F. Farmácia
Centro Hospitalar do Porto HGSA
IGC
Colaborações Institucionais Universidade do Porto
UMIB - ICBAS F. Farmácia
Centro Hospitalar do Porto HGSA
IGC
Produção científica 2007-2008 3 artigos em revistas de circulação internacional 1 capítulo de livro Numerosas comunicações em congressos
Produção científica 2007-2008 3 artigos em revistas de circulação internacional 1 capítulo de livro Numerosas comunicações em congressos
![Page 21: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas.](https://reader035.fdocumentos.tips/reader035/viewer/2022081511/552fc12b497959413d8cf3a3/html5/thumbnails/21.jpg)
Departamento de Genética
Investigação em Atraso Mental ligado ao cromossoma X
O atraso mental (AM) afecta ~2% da população mundial. Foram já identificados mais de 25 genes associados a formas de atraso mental ligado ao cromossoma X sindrómico (MRX) e não sindrómico (XLMR). Deste grupo salienta-se o gene FMR1 responsável pela Síndrome de X-Frágil e a Síndrome de ataxia e tremor (FXTAS). A maioria das formas de AM continua ainda por caracterizar molecularmente.
Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado
IP: Paula Jorge
OBJECTIVOS
Criação/implementação de base de dados de doentes com atraso mental
Gene FMR1:• Análise do tripleto repetitivo [CGG];• Pesquisa de outras mutações;
Gene FMR2:• Caracterização dos alelos intermédios e pré-mutados na população Portuguesa;
Identificação de outros genesIn: Hagerman PJ and Hagerman RJ (2007) Fragile X-associated tremor/ataxia syndrome—an older face of the fragile X gene, Nat Clin Pract Neurol 3: 107–112
![Page 22: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas.](https://reader035.fdocumentos.tips/reader035/viewer/2022081511/552fc12b497959413d8cf3a3/html5/thumbnails/22.jpg)
Departamento de Genética
Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado
Objectivo: Em células eucarióticas, o processo de expressão génica envolve múltiplos passos, desde a transcrição até às modificações pós-traducionais da proteína nascente, em que os RNA mensageiros (mRNAs) são o intermediário fulcral. O pré-mRNA é transcrito a partir do DNA e processado, com excisão dos intrões e adição da estrutura cap e cauda poli(A). O mRNA maduro é então transportado para o citoplasma, onde é traduzido para proteína e finalmente degradado. Sabe-se hoje que a maioria dos passos do processo de expressão génica, se não todos, podem ser regulados, o que permite o controlo espácio-temporal da expressão génica.
A grande complexidade da expressão génica torna o processo vulnerável a erros. No entanto, existem mecanismos celulares de controlo de qualidade que asseguram a fidelidade da expressão génica.
No âmbito das nossas actividades de I&D, estamos interessados em estudar um destes mecanismos - o mecanismo de nonsense-mediated mRNA decay, e de que modo este mecanismo reflecte a complexidade da maquinaria traducional.
Estudo do mecanismo de nonsense-mediated decay (NMD) do mRNA da a-globina humana
IP: Luísa Romão
![Page 23: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas.](https://reader035.fdocumentos.tips/reader035/viewer/2022081511/552fc12b497959413d8cf3a3/html5/thumbnails/23.jpg)
Estudo do mecanismo de nonsense-mediated decay (NMD) do mRNA da a-globina humana
Departamento de Genética
Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado
IP: Luísa Romão
Pereira FJC, et al. (2006). Brit J Haematol, 133: 98-102. Silva AL, et al. (2006), RNA, 12: 2160-2170.
Qual o efeito da sequência e comprimento da grelha de leitura do mRNA da a-globina Qual o efeito da sequência e comprimento da grelha de leitura do mRNA da a-globina humana no mecanismo de NMD? humana no mecanismo de NMD?
Resultados:
• Mutações nonsense perto do codão de iniciação da tradução inibem o NMD do mRNA da a-globin humana.
• A inibição da re-iniciação da tradução inibe parcialmente o NMD da a-globin humana, contrariamente ao que acontece com a b-globina.
• Os transcritos da a-globina humana portadores de uma mutação nonsense na região 3’ do exão 1, escapam parcialmente ao NMD,
supostamente devido a um efeito combinado da re-iniciação da tradução e do tamanho e sequência da grelha de leitura do transcrito.
2x a
WT
aWT
a27 40
5’U
TR
b/a
WT
5’U
TR
b/a
27
5’U
TR
b/a
40
bWT
26/a
b26/
a
Nív
eis
rela
tivo
s d
e m
RN
A
2x b
WT
bWT
b26
b39
5’U
TR
a/b
WT
5’U
TR
a/b
26
5’U
TR
a/b
39
aWT
27/b
a27/
b
puroRmRNA
globina mRNA
Nív
eis
rela
tivo
s d
e m
RN
A
![Page 24: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas.](https://reader035.fdocumentos.tips/reader035/viewer/2022081511/552fc12b497959413d8cf3a3/html5/thumbnails/24.jpg)
Objectivos: Aprofundar o conhecimento sobre a fisiopatologia das hemoglobinopatias e sobre os factores genéticos moduladores dos fenótipos hematológico e clínico.
A compreensão das relações genótipo / fenótipo pode contribuir para a tomada de decisão clínica, orientação de tratamento e adopção de medidas preventivas de algumas manifestações clínicas.
Exemplo de resultados:- Os doentes drepanocíticos que co-herdem um número elevado de
repetições TA no promotor do gene UGT-1A1 têm elevada probabilidade de desenvolverem hiperbilirrubinémia e colelitíase, mesmo em idade jovem.
- Concluímos que o polimorfismo de repetição TA no promotor UGT-1A1 representa um modificar importante das manifestações clínicas desta patologia.
Referências :Martins R et al . Early modification of sickle cell disease clinical course by UDP-glucurosyltransferase 1A1 gene promoter polymorphism. Journal of Human Genetics 2008, 53:524-8.
Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado
Estudo de factores genéticos modificadores dos fenótipos das hemoglobinopatias (talassémias e drepanocitose)
Departamento de Genética
IP: Paula Faustino
![Page 25: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas.](https://reader035.fdocumentos.tips/reader035/viewer/2022081511/552fc12b497959413d8cf3a3/html5/thumbnails/25.jpg)
Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado
Estudo de epidemiologia molecular, de caracterização de novas mutações e de regulação da expressão de genes associados a Hemocromatose Hereditária
Objectivos: Aprofundar o conhecimento sobre a base molecular da Hemocromatose Hereditária em Portugal, efectuar estudos funcionais de novas mutações e contribuir para o conhecimento do envolvimento da HFE no metabolismo do ferro e, quando mutada, no desenvolvimento da patologia. Pretende-se, ainda, contribuir para o conhecimento dos mecanismos envolvidos na regulação génica pós-transcricional.
Exemplo de resultados:- A análise mutacional efectuada nos genes HFE, TFR2, HJV e
HAMP, num grupo de 215 indivíduos portugueses com hemocromatose hereditária não-clássica revelou algumas mutações novas nestes genes. Apesar disso, dada a sua baixa frequência, concluiu-se que a pesquisa dessas mutações na corrente prestação de serviços laboratoriais de apoio à clínica apresenta um baixo nível custo-benefício.
Referências :Mendes A. I. et al . Non-classical hereditary hemochromatosis in Portugal: novel mutations identified in iron metabolism-related genes.Ann Hematol 2008, in press (DOI 10.1007/s00277-008-0572-y)
H63D
C282Y
Y230F
(adaptado de Fleming & Sly, 2002)
Representação esquemática da proteína HFE e localização de uma das mutações novas encontradas (Y230F)
Departamento de Genética
IP: Paula Faustino
![Page 26: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas.](https://reader035.fdocumentos.tips/reader035/viewer/2022081511/552fc12b497959413d8cf3a3/html5/thumbnails/26.jpg)
Departamento de Genética
Sinalização em células tumorais
GrowthFactor
Receptor
ReceptorFactor
Crescimento
EG
F
Ras
B-RafMEK
ERK1/2
Rasmut
BRafmut
Rac1b
adenoma carcinoma
adenoma serreado carcinoma
Via clássica de progressão tumoral
Via alternativa de progressão tumoral
Proliferação celular
Foi identificado um novo subgrupo de tumores do cólon ( ~15%) que contem uma mutação oncogénica em BRAF associada à sobre-expressão da GTPase Rac1b (Matos et al. (2008) Gastroenterology, in press). A combinação destas alterações constitui uma via de tumorigénese alternativa à via clássica do oncogéne KRAS e representa um alvo terapêutico específico para este subgrupo de tumores.
Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado
IP: Peter Jordan
![Page 27: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas.](https://reader035.fdocumentos.tips/reader035/viewer/2022081511/552fc12b497959413d8cf3a3/html5/thumbnails/27.jpg)
Departamento de Genética
Toxicologia Genética
Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado
IP: Maria João Silva
Projectos
Metafase mostrando uma translocação recíproca, um cromossoma dicêntrico e um fragmento acêntrico ()
• Caracterização dos efeitos mutagénicos da deficiência da poli(ADP-ribose) polimerase em ratinhos transgénicos
• Minas de urânio e seus resíduos. Efeitos genotóxicos na população e influência de polimorfismos genéticos
• Avaliação dos efeitos na saúde associados à exposição crónica a contaminantes da água com potencial genotóxico
• Exposição ambiental ao fumo do tabaco em estabelecimentos de restauração: efeitos genotóxicos e mecanismos moleculares subjacentes a doenças respiratórias
Micronúcleos em linfócitos com bloqueio da citocinese ()
Lesões no DNA evidenciadas pelo “comet assay”
Equipa 1 investigador, 1 TSS, 2 estudantes mestrado, 1 estudante doutoramento
![Page 28: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas.](https://reader035.fdocumentos.tips/reader035/viewer/2022081511/552fc12b497959413d8cf3a3/html5/thumbnails/28.jpg)
Análise aprofundada de mutações no gene CFTR • Caracterização das mutações encontradas no gene CFTR• Estratégias para recuperar a função da CFTR mutada• Identificação de proteínas com um papel no tráfego e activação da CFTR
Análise da CFTR ao nível celular e fisiológico• Caracterização de mutações do gene CFTR (localização, tráfego e actividade)
Dase de dados para Mutações no CFTR (EuroCareCF)
Estudo do “Folding proteico” utilizando C. elegans• Produção de linhas trangénicas de nematodos (identificação de factores responsáveis pela degradação/”folding da CFTR)• Rastreios por RNAi do genoma completo• Construção de proteínas humanas quiméricas (ex. CFTR e proteínas multi-resistentes a drogas )• Identificação de ortologos humanos
Controlo de qualidade proteica• “Folding” e tráfego da proteína CFTR• Tráfego membranar• Degradação pelo proteassoma
DNA chips• Extracção, purificação e amplificação• Sensor magnético para detecção por single nucleotide polymorphism (SNP)
Ferramentas Genéticas e Moleculares-“Microarray” / análise in silico-Mutagénese-Silenciamento de genes (RNAi)-PCR & RT-PCR
Ferramentas ao nivel celular e fisiológico-Confocal e Vídeo Fluorescence Mic-Imunohistoquímica-Electrofisiologia (patch-clamp e câmaras de Ussing)
Investigação em Fibrose Quística
Departamento de Genética
Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado
IP: Margarida Amaral
![Page 29: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas.](https://reader035.fdocumentos.tips/reader035/viewer/2022081511/552fc12b497959413d8cf3a3/html5/thumbnails/29.jpg)
Investigação em Patologias do Desenvolvimento Sexual
Departamento de Genética
Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado
Infertilidade masculina: caracterização do padrão de metilação das regiões CpG dos genes DAZL(3p24) e DAZ(Yq11.23) em espermatozóide provenientes de homens normozoospérmicos e oligozoospérmicos.
Projectos a decorrer:
Diferenciação sexual: pesquisa de alterações moleculares no gene CYP11B1 em doentes com hiperplasia supra-renal congénita e com suspeita de deficiência em 11 beta-hidroxilase.
IP: João Gonçalves
![Page 30: Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas.](https://reader035.fdocumentos.tips/reader035/viewer/2022081511/552fc12b497959413d8cf3a3/html5/thumbnails/30.jpg)
Obrigado!