Decifrando o código da vida: Como a tecnologia da informação esta ajundando a entender os seres...
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Decifrando o código da vida: Como a tecnologia da informação esta ajundando a
entender os seres vivos? Alexandre dos Santos Cristino
Instituto de Matemática e Estatística - USPemail: [email protected]://www.ime.usp.br/~alexsc
Zilá Luz Paulino SimõesLaboratório de Biologia e Genética de Abelhas
FFCLRP-USP
Luciano da Fontoura CostaGrupo de Visão Cibernética
IFSC-USP
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A classificação dos seres:Aristóteles: organismos com sangue e sem sangue
Lineu: divisão em 2 reinos (animal e vegetal)
Haeckel: divisão em 3 reinos (animal, vegetal e protista)
Whittaker: divisão em 5 reinos (animal, vegetal, fungi, protista e monera)
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Os tipos de estrutura de dados em computação- Listas- Matrizes- Dicionários- Ordanações- Árvores
- Grafos
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A transformação da informação por meio de “botões”Ex: Bioinformática
Definição: Bioinformática consiste no uso de sistemas computacionais nas análises de caracterização molecular, integrando modelos matemáticos e estatísticos utilizados na interpretação e análise dos problemas biológicos.
As representações e os domínios do problema
Visão computacional Visão humana
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A extração de atributos, a modelagem e a classificação de um mini-mundo
# File: hello2.py
from Tkinter import *
class App:
def __init__(self, master):
frame = Frame(master)
frame.pack()
self.button = Button(frame, text="QUIT", fg="red",
command=frame.quit)
self.button.pack(side=LEFT)
self.hi_there = Button(frame, text="Hello", command=self.say_hi)
self.hi_there.pack(side=LEFT)
def say_hi(self):
print "hi there, everyone!"
root = Tk()
app = App(root)
root.mainloop()
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O programador se interessa por dados, já o usuário se interessa pela informação.
Informação: dados a respeito de alguém ou de algo
Informação genética: mensagem contida no ácido desoxirribonucléicoatravés da sequência dos seus nucleotídeos, e que se expressa pela síntesede proteínas e outras estruturas importantes na construção de um organismo.
Alguns veículos de informação:
- Televisão - Rádio- Jornais e revistas- Computadores e Internet
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O movimento “Open Source”- Novo modelo de desenvolvimento de software (Catedral e bazar)- Tem sua origem na cultura “hacker”- Linux é um projeto bem sucedido do movimento “Open Source”- A ciência e a indústria reconhecem e participam deste movimento
Concepção equivocada
Projeto desenvolvidos utilizando concepçõesde software livre.
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Integrando as áreas do conhecimentoBioinformática ou Biologia Computacional: - intersecção entre a Biologia, a Computação e a Matemática
d[A]/dt = k1 * B – g1 * A
d[B]/dt = k2 * B + k3 * A – g2 * B
d[C]/dt = k4 * A – k5 * B – g3 * C
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Muito obrigado!