CARACTERÍSTICAS DA POPULAÇÃO ACTUAL DOS OVINOS … · Evolução da consanguinidade Controlo dos...

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CARACTERÍSTICAS DA POPULAÇÃO ACTUAL DOS OVINOS DA RAÇA OVINA CHURRA DO CAMPO (Portugal): Efeitos ambientais fixos, consanguinidade e variabilidade José Pedro Fragoso de Almeida Luís Figueira Carlos Sousa C Rebelo Andrade

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CARACTERÍSTICAS DA POPULAÇÃO

ACTUAL DOS OVINOS DA RAÇA

OVINA CHURRA DO CAMPO

(Portugal):

Efeitos ambientais fixos,

consanguinidade e variabilidade

José Pedro Fragoso de Almeida

Luís Figueira

Carlos Sousa C Rebelo Andrade

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Síntese

Introdução

Raça

História

Programa recuperação

Material e métodos

A população actual – Parâmetros estudados

Considerações finais

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Raça

- Solar: Penamacor, Norte do Concelho de Idanha-a-Nova, e Este Concelho do Fundão

- Explorada em regime extensivo, caracteriza-se pela sua tripla função carne, leite e lã sem

ser especializada

Nível de ameaça:

-Grau A

Dados da raça:Rebello de Andrade, C.S.C., 2013. Raça Ovina Churra do Campo, Caraterização da população atual.

Edições IPCB, Castelo Branco, Portugal, 70pp, ISBN: 978-989-8196-30-9

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História

- 1996, 400 fêmeas,

- 2004, dada como extinta (DRABI, 2004),

- 2006, Projecto Transfronteiriço, ao abrigo do programa INTERREG III – Rotas da

Transumância, a Câmara Municipal de Penamacor em parceria com a Escola Superior

Agrária de Castelo Branco,

- 2007, criado o LIVRO GENEALÓGICO da raça com 85 fêmeas e 5 machos em 2

criadores e Programa de recuperação

- 2016, efetivo atual de 447 fêmeas e 19 machos em 6 criadores.

- 1972, a raça Churra do Campo

representava 2,6 % do total ovino

nacional (62.250 cabeças),

LG adultos

Ano

2006 2008 2010 2012 2014 2016

anim

ais

0

100

200

300

400

500

600

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História

INDICADORES CHURRA DO

CAMPO

15 populações

nacionais

3 populações

exóticas

Nº de Animais

por população

93 31 40

Nº Loci tipificados 25 25 25

He

Média±DP

0,689

±0,0227

0,735

±0,026

0,686

± 0,019

Ho

Média±DP

0,626

±0,0101

0,677

±0,029

0,641

± 0,008

Nº Alelos

Média±DP

7,4

±0,026

8,1

±0.908

6,0

± 0,54

Nºefectivo de alelos

Média±DP

3,6

±1,2

4,3

±0,389

3,5

±0,119

Fis global (23 Loci)

Significancia

0,0876

*

0,067

*

0,049

*

(Silva et al., 2011)Caracterização genética por microssatélites - 2008

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História

(Silva et al., 2011)

Arvore de distâncias genéticas standard de Nei (Ds), método de Neighbor-Joining

das 16 raças nacionais - 2008.

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Objectivos

Avaliar o efeitos dos factores ambientais fixos na produção

Evolução da consanguinidade e da variabilidade

Indicadores de apoio ao programa de recuperação

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Material e métodos

Dados do Livro Genealógico:

- 523 lactações (2 explorações, 2007 a 2014)

- 1329 Pesos e GMD (8 explorações, 2006 a 2015)

- Consanguinidade de 456 animais (2008 a 2016, 260 com mais de 6

ascendentes confirmados).

Produção de leite: contrastes mensais sobre 2 ordenhos, método fleischman;

normalização para 120 dias de lactação

Peso ao nascimento: pesagem directa criadores

Pesos aos 30 e 70 dias de idade: interpolação de pesagens quinzenais; GMD a partir

dos pesos estimados

Coeficiente de consanguinidade individual (Fi) e grau de parentesco entre indivíduos

(aij) (Gama, 2002):

aij = ½ (ai . Pai de j + ai . Mãe de j)

aij = aji

aii = 1+ Fi

Fi = ½ a(Pai de i . Mãe de i)

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Material e métodos

Efeito dos factores ambientais fixos: análise univariada (GLM; idade ao parto como

covariante na produção de leite).

-Produção de leite: exploração, ano parto, mês parto, número parto

-Pesos: exploração, ano nascimento, mês nascimento, sexo

Consanguinidade entre anos de nascimento, análise univariada (GLM), teste

Bonferroni

Correção das produções individuais, através dos modelos lineares (GLM) aditivos:

𝑃𝑙𝑒𝑖𝑡𝑒 120𝑖 = 𝜇 + 𝑎 𝑎𝑛𝑜 𝑝𝑎𝑟𝑡𝑜 𝑖 + 𝑏 𝑚ê𝑠 𝑝𝑎𝑟𝑡𝑜 𝑖 + 𝑐(𝑛º 𝑙𝑎𝑐𝑡𝑎çã𝑜)𝑖

𝑃𝑒𝑠𝑜 70 𝑑𝑖𝑎𝑠𝑖 = 𝜇 + 𝑎 𝑒𝑥𝑝𝑙𝑜𝑟𝑎çã𝑜 𝑖 + 𝑏 𝑎𝑛𝑜 𝑛𝑎𝑠𝑐𝑖𝑚𝑒𝑛𝑡𝑜 𝑖 + 𝑐(𝑚ê𝑠 𝑑𝑒 𝑛𝑎𝑠𝑐𝑖𝑚𝑒𝑛𝑡𝑜)𝑖+𝑑(𝑠𝑒𝑥𝑜)𝑖

Análise dos componentes da variância (GLM, Anova) e teste Levene para igualdade

da variância entre anos de nascimento

Covariante – (idade ao parto)i

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Resultados – Estrutura etária efectivo

Idade (anos) F M Total

>7 16% 5% 15%

6 6% 21% 7%

5 11% 5% 11%

4 8% 32% 9%

3 24% 21% 24%

2 18% 11% 17%

1 5% 5% 5%

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Resultados – Produção leite

n MeanStd.

DeviationMinimum Maximum

P. leite total (l)* 523 50,3 20,1 11,7 116,5

Duração lactação (dias) 523 134,0 27,6 16,0 218,0

P. normalizada (120 dias) 523 45,7 18,0 11,5 96,1

P. ordenhada (l) 523 28,6 13,5 4,1 85,7

Duração ordenha (dias) 523 85,0 23,5 14,0 160,0

Inicio Ordenha (dias pós-

parto)523 49,1 16,3 2,0 95,0

* r PT, DL= 0,334 (P<0,01)

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Resultados – Produção leite

Causas

variaçãogl

Produção

total

Duração

Lactação

P.

120

dias

P.

Ordenhada

Duração

Ordenha

Inicio

Ordenha

Exploração 1 ns ns ns ns ns ns

Ano de parto 7 ** *** *** ** *** ***

Mês de parto 6 ns *** * *** *** ***

Número Parto 5 ns * ns ns ns ns

Ano x Mês

parto24 *** *** *** *** *** ***

Exploração x

Ano parto5 ns ns ns ns ns ***

Modelo 49 *** *** *** *** *** ***

R2 0,42 0,568 0,439 0,371 0,489 0,775

ns Não significativo * P<0,05 **P<0,01 ***P<0,001

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Resultados – Pesos e GMD

Idade dos Pesos Sexo N Mean (kg) Std. Deviation

Nascimento

F 724 2,6 0,6

M 605 2,8 0,7

T 1329 2,7 0,6

30 dias

F 531 6,8 1,5

M 484 7,3 1,7

T 1015 7,1 1,6

70 dias

F 239 11,6 2,2

M 208 12,7 2,7

T 447 12,1 2,5

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Resultados – Pesos e GMD

Idades ao GMD Sexo N Mean (g) Std. Deviation

0 - 30 dias

F 531 142 49

M 484 161 62

T 1015 151 56

30-70 dias

F 233 115 38

M 202 127 49

T 435 121 44

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Resultados – Pesos e GMD

Causas

variaçãogl

Peso

Nascimento

Peso 30

dias idade

Peso 70

dias idade

GMD 0-30

dias

GMD 30-

70

Exploração 7 *** *** ns *** **

Ano de

nascimento9 ns *** ns *** **

Mês de

nascimento

9

(8)a* *** ** *** ***

Sexo 1 *** *** *** *** ***

Ano x

Exploração37 ns *** *** *** ***

Modelo 49 *** *** *** *** ***

R2 0,128 0,345 0,426 0,442 0,531

a 9 gl para Peso ao Nascimento, 8 gl para restantes

ns Não significativo * P<0,05 **P<0,01 ***P<0,001

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Ano Nascimento

Número de ascendentes confirmados por análise DNA

Total0 1 2 3 4 5 6

2006 0 1 6 0 0 0 0 7

2007 0 24 5 0 4 0 0 33

2008 0 27 6 2 8 0 3 46

2009 1 0 10 10 17 2 13 53

2010 0 3 3 6 19 7 15 53

2011 0 0 7 3 20 8 21 59

2012 0 1 5 2 15 10 28 61

2013 0 0 0 8 27 29 77 141

2014 0 0 0 3 11 12 62 88

2015 0 0 0 0 3 4 41 48

Total 1 56 42 34 124 72 260 589

Resultados – genealogias

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Resultados – Evolução dos coeficientes de consanguinidade

Ano nascimento

2008 2009 2010 2011 2012 2013 2014 2015

Fx

0,00

0,01

0,02

0,03

0,04

0,05

0,06

0,07

ns

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Resultados – Variabilidade Produção leite (120 dias) corrigida factores fixos

2 explorações analisadas

Evolução das Médias PN 120 dias e das Variâncias

Ano de nascimento

2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011

PN

12

0c

0

20

40

60

80

100

PN

12

0 c

(lit

ros)

0

10

20

30

40

50

Símbolos – médias PN 120 corrigidas

2 EP

Tracejado – 95% Intervalos confiança das médias

Barras – Variâncias observadas

Levene Statistic df1 df2 Sig.

Based on Mean 3,367 6 163 ,004

Based on Median 2,781 6 163 ,013

Based on Median and with adjusted df 2,781 6 138,564 ,014

Based on trimmed mean 3,140 6 163 ,006

Variance Estimates

Component: Estimate

Var(Ano Nascimento) 9,174 (15%)

Var(Residual) 52,712 (85%)

Dependent Variable: PN120cGLM

Method: ANOVA (Type III Sum of Squares)

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Símbolos – médias PV 70 dias corrigidas

2 EP

Tracejado – 95% Intervalos confiança das médias

Barras – Variâncias observadas

Levene Statistic df1 df2 Sig.

Based on Mean 13,993 5 301 ,000

Based on Median 13,212 5 301 ,000

Based on Median and with adjusted df 13,212 5 271,240 ,000

Based on trimmed mean 14,001 5 301 ,000

Variance Estimates

Component Estimate

Var(Ano Nascimento) 0,206 (13%)

Var(Residual) 1,435 (87%)

Dependent Variable: P70cGLM

Method: ANOVA (Type III Sum of Squares)

Evolução das Médias PV aos 70 dias e das Variâncias

Ano de nascimento

2007 2008 2009 2010 2011 2012

P7

0c

0,0

0,5

1,0

1,5

2,0

2,5

3,0

3,5

PV

70

c (

kg

)

0

2

4

6

8

10

12

14

Resultados – Variabilidade Peso vivo (70 dias) corrigido factores fixos

8 Explorações analisadas

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Considerações finais

Deverá ser prestada atenção aos seguintes aspectos:

Evolução da consanguinidade Controlo dos movimentos animais

entre explorações

Estratégia de emparelhamentos

Variabilidade inter-rebanhos

Variabilidade das produções Critérios para escolha dos animais

de substituição

Estimativa dos parâmetros genéticosContinuação…