CAPFITOGEN: ferramentas SIG para a conservação e ... · participantes deverão trazer os seus...
2
O objetivo principal da conservação é preservar a maior diversidade possível, tanto ao nível do número de espécies como ao nível da diversidade genética de uma mesma espécie. Porém, a informação genética raramente existe para a grande maioria das espécies e a diversidade ecogeográfica pode funcionar como um indicador pragmático desta diversidade genética. Assume-se, portanto, que uma espécie que ocupa cenários ecogeograficamente diferentes apresenta configurações genéticas distintas. Este workshop terá a duração de dois dias e pretende dotar os participantes com os conhecimentos necessários para aplicar a abordagem de caracterização ecogeográfica do terreno (ecogeographic land characterization, ELC) de espécies silvestres, nomeadamente de espécies silvestres aparentadas das espécies cultivadas (crop wild relatives, CWR) como base para um planeamento efectivo das acções de conservação ex situ e in situ. As ferramentas aprendidas no workshop irão contribuir para o planeamento das missões de colheita de germoplasma para conservação ex situ, estabelecimento de colecções nucleares, estabelecimento de redes de áreas de conservação in situ, bem como para a selecção de populações potencialmente adaptadas a stresses abióticos e que poderão ser utilizadas no melhoramento de cultivares. No workshop, os participantes irão essencialmente aprender a utilizar as ferramentas CAPFITOGEN (www.capfitogen.net ) desenvolvidas pelo CAPFITOGEN Programme for the Strengthening of Capabilities in National Plant Genetic Resources Programmes (www.planttreaty.org/capfitogen ) do Tratado Internacional sobre os Recursos Fitogenéticos para a Alimentação e Agricultura (FAO) (www.planttreaty.org ). ENQUADRAMENTO ENQUADRAMENTO ENQUADRAMENTO E OBJETIVOS OBJETIVOS OBJETIVOS TesTable : permite corrigir erros nas tabelas de passaporte de modo a possibilitar o uso destas tabelas nas outras ferramentas do programa. GEOQUAL : avalia a qualidade da georeferenciação dos dados de passaporte. SelecVar : permite seleccionar variáveis ecogeográficas com base em procedimentos estatísticos (análise de correlação, análise de componentes principais, ‘clustvarsel’, ‘random forest’) que poderão ser usadas posteriormente na produção de mapas de caracterização ecogeográfica do terreno (mapas ELC). ELC mapas : permite obter mapas de caracterização ecogeográfica do terreno (mapas ELC) que reflectem os potenciais cenários adaptativos de uma espécie num determinado país ou região. Representa : analisa a representatividade ecogeográfica de uma espécie numa colecção de germoplasma. ECOGEO : caracteriza, a nível ecogeográfico, os locais de colheita do germoplasma; o utilizador tem à sua disponibilização mais de 100 variáveis ecogeográficas. DIV mapas : permite elaborar mapas que mostram zonas de elevada variabilidade ecogeográfica, fenotípica e/ou genotípica, baseando-se na determinação de distâncias ecogeográficas, fenotípicas ou genotípicas. ColNucleo : estabelece colecções nucleares baseadas em mapas de caracterização ecogeográfica do terreno (mapas ELC). FIGS_R : aplica filtros de modo a seleccionar o germoplasma mais adaptado a stresses abióticos de interesse para o melhoramento de cultivares. Complementa : executa análise de complementaridade para o estabelecimento de áreas de conservação (estabelece o número mínimo de áreas necessárias para conservar o máximo número de espécies) ou para determinar o nível de protecção da rede de áreas de conservação existente. Igualmente, permite optimizar as actividades de colheita de germoplasma indicando as áreas de maior riqueza específica em reduzidas áreas de exploração. CAPFITOGEN: ferramentas SIG para a conservação e utilização dos recursos fitogenéticos em Portugal 22 e 23 junho 2015 22 e 23 junho 2015 22 e 23 junho 2015 ORGANIZAÇÃO: INIAV, I.P. - BANCO PORTUGUÊS DE GERMOPLASMA VEGETAL (BPGV) As ferramentas CAPFITOGEN representam um esforço para aproximar alguns avanços científicos e tecnológicos à comunidade de técnicos que conservam recursos fitogenéticos. Cada ferramenta está desenhada para realizar, de uma forma mais eficiente, determinado tipo de análise que, até agora, demorava bastante tempo e requeria conhecimentos avançados de programação em Java e R. As ferramentas estão desenhadas para facilitar a tomada de decisões relativas à conservação e utilização dos recursos fitogenéticos em países ricos nestes recursos (como é o caso de Portugal) e com recursos económicos limitados. Estas ferramentas facilitam o uso de metodologias de caracterização ecogeográfica e de sistemas de informação geográfica (SIG), reduzindo consideravelmente o tempo e esforço para a sua adopção e assegurando a sua validez científica. Isto só é possível porque o grupo de investigadores que tem vindo a denvolver estas metodologias está igualmente envolvido no desenho de cada ferramenta. As ferramentas chegam aos seus utilizadores, técnicos de Programas Nacionais e de outras instituições envolvidas na conservação da agrobiodiversidade, através de workshops presenciais (como é o caso deste workshop) bem como através da internet. As ferramentas CAPFITOGEN são as seguintes: As ferramentas CAPFITOGEN são as seguintes: As ferramentas distribuem-se de forma gratuita, podem ser copiadas e distribuídas livremente, sendo apenas necessário citá-las quando utilizadas no âmbito de algum projeto ou publicação. As ferramentas foram concebidas no âmbito do CAPFITOGEN Programme for the Strengthening of Capabilities in National Plant Genetic Resources Programmes (www.planttreaty.org/ capfitogen ) do Tratado Internacional sobre os Recursos Fitogenéticos para a Alimentação e Agricultura (FAO) (www.planttreaty.org ), com financiamento do Governo de Espanha.
Transcript of CAPFITOGEN: ferramentas SIG para a conservação e ... · participantes deverão trazer os seus...
O objetivo principal da conservação é preservar a maior diversidade possível, tanto ao nível do número de espécies como ao nível da diversidade genética de uma mesma espécie. Porém, a informação genética raramente existe para a grande maioria das espécies e a diversidade ecogeográfica pode funcionar como um indicador pragmático desta diversidade genética. Assume-se, portanto, que uma espécie que ocupa cenários ecogeograficamente diferentes apresenta configurações genéticas distintas.
Este workshop terá a duração de dois dias e pretende dotar os participantes com os conhecimentos necessários para aplicar a abordagem de caracterização ecogeográfica do terreno (ecogeographic land characterization, ELC) de espécies silvestres, nomeadamente de espécies silvestres aparentadas das espécies cultivadas (crop wild relatives, CWR) como base para um planeamento efectivo das acções de conservação ex situ e in situ. As ferramentas aprendidas no workshop irão contribuir para o planeamento das missões de colheita de germoplasma para conservação ex situ, estabelecimento de colecções nucleares, estabelecimento de redes de áreas de conservação in situ, bem como para a selecção de populações potencialmente adaptadas a stresses abióticos e que poderão ser utilizadas no melhoramento de cultivares.
No workshop, os participantes irão essencialmente aprender a utilizar as ferramentas CAPFITOGEN (www.capfitogen.net) desenvolvidas pelo CAPFITOGEN Programme for the Strengthening of Capabilities in National Plant Genetic Resources Programmes (www.planttreaty.org/capfitogen) do Tratado Internacional sobre os Recursos Fitogenéticos para a Alimentação e Agricultura (FAO) (www.planttreaty.org).
ENQUADRAMENTO ENQUADRAMENTO ENQUADRAMENTO EEE OBJETIVOSOBJETIVOSOBJETIVOS
TesTable: permite corrigir erros nas tabelas de passaporte de modo a possibilitar o uso destas tabelas nas outras ferramentas do programa.
GEOQUAL: avalia a qualidade da georeferenciação dos dados de passaporte.
SelecVar: permite seleccionar variáveis ecogeográficas com base em procedimentos estatísticos (análise de correlação, análise de componentes principais, ‘clustvarsel’, ‘random forest’) que poderão ser usadas posteriormente na produção de mapas de caracterização ecogeográfica do terreno (mapas ELC).
ELC mapas: permite obter mapas de caracterização ecogeográfica do terreno (mapas ELC) que reflectem os potenciais cenários adaptativos de uma espécie num determinado país ou região.
Representa: analisa a representatividade ecogeográfica de uma espécie numa colecção de germoplasma.
ECOGEO: caracteriza, a nível ecogeográfico, os locais de colheita do germoplasma; o utilizador tem à sua disponibilização mais de 100 variáveis ecogeográficas.
DIV mapas: permite elaborar mapas que mostram zonas de elevada variabilidade ecogeográfica, fenotípica e/ou genotípica, baseando-se na determinação de distâncias ecogeográficas, fenotípicas ou genotípicas.
ColNucleo: estabelece colecções nucleares baseadas em mapas de caracterização ecogeográfica do terreno (mapas ELC).
FIGS_R: aplica filtros de modo a seleccionar o germoplasma mais adaptado a stresses abióticos de interesse para o melhoramento de cultivares.
Complementa: executa análise de complementaridade para o estabelecimento de áreas de conservação (estabelece o número mínimo de áreas necessárias para conservar o máximo número de espécies) ou para determinar o nível de protecção da rede de áreas de conservação existente. Igualmente, permite optimizar as actividades de colheita de germoplasma indicando as áreas de maior riqueza específica em reduzidas áreas de exploração.
CAPFITOGEN: ferramentas SIG para a conservação e utilização dos recursos fitogenéticos em Portugal
22 e 23 junho 201522 e 23 junho 201522 e 23 junho 2015 ORGANIZAÇÃO: INIAV, I.P. - BANCO PORTUGUÊS DE GERMOPLASMA
VEGETAL (BPGV)
As ferramentas CAPFITOGEN representam um esforço para aproximar alguns avanços científicos e tecnológicos à comunidade de técnicos que conservam recursos fitogenéticos. Cada ferramenta está desenhada para realizar, de uma forma mais eficiente, determinado tipo de análise que, até agora, demorava bastante tempo e requeria conhecimentos avançados de programação em Java e R. As ferramentas estão desenhadas para facilitar a tomada de decisões relativas à conservação e utilização dos recursos fitogenéticos em países ricos nestes recursos (como é o caso de Portugal) e com recursos económicos limitados. Estas ferramentas facilitam o uso de metodologias de caracterização ecogeográfica e de sistemas de informação geográfica (SIG), reduzindo consideravelmente o tempo e esforço para a sua adopção e assegurando a sua validez científica. Isto só é possível porque o grupo de investigadores que tem vindo a denvolver estas metodologias está igualmente envolvido no desenho de cada ferramenta. As ferramentas chegam aos seus utilizadores, técnicos de Programas Nacionais e de outras instituições envolvidas na conservação da agrobiodiversidade, através de workshops presenciais (como é o caso deste workshop) bem como através da internet.
As ferramentas CAPFITOGEN são as seguintes:As ferramentas CAPFITOGEN são as seguintes:
As ferramentas distribuem-se de forma gratuita, podem ser copiadas e distribuídas livremente, sendo apenas necessário citá-las quando utilizadas no âmbito de algum projeto ou publicação. As ferramentas foram concebidas no âmbito do CAPFITOGEN Programme for the Strengthening of Capabilities in National Plant Genetic Resources Programmes (www.planttreaty.org/capfitogen) do Tratado Internacional sobre os Recursos Fitogenéticos para a Alimentação e Agricultura (FAO) (www.planttreaty.org), com financiamento do Governo de Espanha.
O workshop tem 25 vagas disponíveis.
As ferramentas serão entregues a todos os participantes durante o workshop em memórias USB Flash Drive e incluem dados de passaporte e outro tipo de informação que serão utilizados como exemplo com o qual se poderão realizar diferentes análises demonstrativas das ferramentas.
Para poder participar nas sessões práticas do workshop, os participantes deverão trazer os seus computadores portáteis com sistema Windows (não necessita de ligação à internet) onde irão instalar e usar as ferramentas.
Pede-se aos participantes que instalem previamente o software DIVA-GIS (disponível gratuitamente em http://www.diva-gis.org/).
Os almoços, ficam a cargo dos participantes.
Segunda-feira, 22 junho 2015
9:00
Sessão de abertura (Nuno Canada – Presidente do INIAV,I.P.)
Visão geral e objetivos do Workshop (Benvindo Maçãs –Diretor da UEIS de Biotecnologia e Recursos Genéticos)
9:15
Introdução ao Programa CAPFITOGEN Bases da aplicação de ecogeografia na conservação e
utilização de recursos fitogenéticos (M. Parra Quijano*) Instalação das ferramentas CAPFITOGEN e descrição das
funções básicas
11:00 Pausa para café
11:15 Preparação dos dados de passaporte
13:15 Almoço
14:15 Introdução à ferramenta TesTable Utilizando TesTable
15:00 Introdução à ferramenta GEOQUAL Utilizando GEOQUAL
16:10 Pausa para café
16:25 Introdução à ferramenta SelecVar Utilizando SelecVar
18:00 Introdução à ferramenta ELC mapas
18:30 FIM
Terça-feira, 23 junho 2015
9:00 Utilizando ELC mapas
10:00 Introdução à ferramenta Representa
Utilizando Representa 11:30 Pausa para café
11:45 Introdução à ferramenta ColNucleo
Utilizando ColNucleo 13:15 Almoço
14:15 Introdução à ferramenta FIGS_R
Utilizando FIGS_R 15:45 Pausa para café
16:00 Introdução à ferramenta Complementa
Utilizando Complementa
17:30 Esclarecimento de dúvidas
18:00 FIM DO WORKSHOP e SESSÃO DE CONCLUSÕES
PROGRAMAPROGRAMA
No final do workshop os participantes deverão: Entender como o estudo da ecogeografia poderá ser aplicado à conservação e utilização dos recursos fitogenéticos.
Saber preparar os dados de passaporte para usar na análise ecogeográfica.
Estar familiarizados com o uso das ferramentas CAPFITOGEN, nomeadamente: TesTable, GEOQUAL, SelecVar, ELC mapas, Representa, ColNucleo, FIGS_R e Complementa.
Saber interpretar os resultados obtidos com a utilização destas ferramentas.
INSCRIÇÕES GRÁTIS até dia 11 de junho 2015
FORMULÁRIO ON-LINE
Apresentações e sessões práticas a cargo de:
Mauricio Parra Quijano, PhD - Coordenador do Programa CAPFITOGEN
Tratado Internacional sobre os Recursos Fitogenéticos para a Alimentação e Agricultura, FAO
Email: [email protected]
Blog: http://www.agrobiodiversidad.org/blog
Auditório do BPGV, Quinta de S. José S. Pedro de Merelim, 4700-859 BRAGA
Quinta de S. José, S. Pedro de Merelim - 4700-859 Braga Tel: (+351) 253 300 963 | E-mail: [email protected]
(*)
