A experiência do Herbário SP na produção e divulgação de ... · Instituto de Botânica e...
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A experiência do Herbário SP na
produção e divulgação de imagens
do acervo
Maria Candida Henrique Mamede
Curadora de Fanerógamas
Instituto de Botânica
São Paulo, Brasil
Instituto de Botânica e Jardim Botânico de São Paulo
Instituto de Botânica e Jardim Botânico de São Paulo
Frederico Carlos Hoehne
Instituto de Botânica
Fundação: 9 Novembro 1938
Herbário (Instituto de Botânica)
Orquidário (Jardim Botânico)
Museu Botânico Barbosa Rodrigues
Instituto de Botânica e Jardim Botânico de São Paulo
Instituto de Botânica e Jardim Botânico de São Paulo
Herbário SP
Escola Politécnica
Plantas medicinais: A.
Usteri
Instituto de Botânica e Jardim Botânico de São Paulo
Instituto de Botânica e Jardim Botânico de São Paulo
Herbário SP
Comissão Geográfica e
Geológica de São Paulo,
1888-1903
A. Loefgren & G. Edwall
4.226 coleções
171 tipos
Instituto de Botânica e Jardim Botânico de São Paulo
Instituto de Botânica e Jardim Botânico de São Paulo
Herbário SP
Horto Oswaldo Cruz
Principal coleção de F.C.
Hoehne (1927-1938)
Instituto de Botânica e Jardim Botânico de São Paulo
Instituto de Botânica e Jardim Botânico de São Paulo
Organização
Herbário SP > 490.000 coleções
Staff: 33 pesquisadores, 100 estudantes (graduação e pós-graduação)
Biblioteca
Revistas
Hoehnea, Boletim do Instituto de Botânica
Livros
Flora Fanerogâmica do Estado de São Paulo
Flora Fanerogâmica da Ilha do Cardoso
Instituto de Botânica e Jardim Botânico de São Paulo
Organização
Fanerógamas: M. Candida H. Mamede
Pteridófitas: Jefferson Prado
Briófitas: Denilson Fernandes Peralta
Algas: Célia L. Sant’Anna
Fungos & Líquens: Michel N. Benatti
Palinoteca: Cynthia F.P. Luz
Xiloteca: Agnes E. Luchi
Instituto de Botânica e Jardim Botânico de São Paulo
Curadoria
Visitantes/ano: 100-150
Intercâmbio: todos os herbários cadastrados no
Index Herbariorum
Instituto de Botânica e Jardim Botânico de São Paulo
Bancos de dados
Brahms & Access
speciesLink
94.265 Fanerógamas
28.669 Algas
20.830 Briófitas
INCT Herbário Virtual
5.117 imagens Fanerógamas
Instituto de Botânica e Jardim Botânico de São Paulo
Coleção Tipo
Família Tipos
Orchidaceae 493
Leguminosae 220
Malpighiaceae 144
Myrtaceae 130
Melastomataceae 114
Begoniaceae 99
Bromeliaceae 90
Asteraceae 84
Rubiaceae 63
Euphorbiaceae 61
Lauraceae 57
Poaceae 52
Apocynaceae 48 http://splink.cria.org.br
2.413 tipos
1.782 imagens
Instituto de Botânica e Jardim Botânico de São Paulo
Coleção tipo
Scanner Epson
Global Plant Initiative - 2009
Instituto de Botânica e Jardim Botânico de São Paulo
INCT Herbário Virtual - 2011
Canon EOS 550D KISSX4
Canon Macro Ring Lite MR-14EX
Instituto de Botânica e Jardim Botânico de São Paulo
Escala de cores
Gretag Macbeth Mini ColorChecker
Escala com logotipo institucional
Código de barras do
espécime
Instituto de Botânica e Jardim Botânico de São Paulo
Configuração da máquina
Modo: Manual
Abertura do diafragma:
F4.5
ISO: 100
Foco automático:
multifoco
Imagem RAW (bruta)
Anti-choque
Disparo: 5 segundos
Instituto de Botânica e Jardim Botânico de São Paulo
Processamento da imagem
Transformar RAW em TIF
Selecionar área (Trim image)
Salvar o arquivo nomeando com o código de barras
Inserir o código de barras no banco de dados
Enviar para o CRIA
Imagens (ftp)
Banco de dados (splink)
Instituto de Botânica e Jardim Botânico de São Paulo
Processamento da imagem
Imagem original Imagem processada
2 minutos
Instituto de Botânica e Jardim Botânico de São Paulo
Estratégia 1
Digitalizar coleções científicas importantes (tipos e
históricas)
Tipos: 2.500-2.600 imagens
Comissão Geográfica e Geológica de São Paulo: 4.100
imagens
Instituto de Botânica e Jardim Botânico de São Paulo
Estratégia 2
Digitalizar toda a coleção
Annonaceae: digitalização simultanea à informatização
Início: 9/4/2012
Fim: 15/9/2012
Total de imagens: 1.222
Instituto de Botânica e Jardim Botânico de São Paulo
Estratégia 3
Digitalizar exsicatas representativas de cada táxon
Espécime com flor
Espécime com fruto
Identificação confiável (especialista)
Distribuição geográfica
Material identificado apenas ao nível de gênero?
MYRTACEAE: 525 imagens
Instituto de Botânica e Jardim Botânico de São Paulo
92.633 registros
2 imagens = 16.258 3 imagens = 24.387
Família Registros Imagens Taxa total
Taxa
imagens
Extra
BR
Extra
Neotrópicos
Leguminosae 17333 433 3159 194 908 873 2092
Myrtaceae 10754 708 1401 142 482 439 820
Malpighiaceae 10042 208 522 53 35 0 469
Melastomataceae 9349 278 1003 162 177 12 829
Rubiaceae 9546 236 1003 58 265 92 853
Euphorbiaceae 6915 154 846 41 205 123 682
Orchidaceae 6941 238 1789 183 162 98 1508
Apocynaceae 3978 205 621 112 116 89 420
Lauraceae 2553 97 344 45 67 35 264
Begoniaceae 1423 131 164 54 4 0 110
Phyllanthaceae 744 42 103 8 18 13 82
24/08/2012 8129
Fanerógamas: 400.000 coleções
Instituto de Botânica e Jardim Botânico de São Paulo
Perspectivas futuras
Coleções importantes
Tipos
Coleções históricas (Gardner, Regnell, Sellow, Blanchet,
Saint-Hilaire)
Coleções representativas dos taxa
Espécimes com flor e fruto
Distribuição geográfica
Instituto de Botânica e Jardim Botânico de São Paulo
Perspectivas futuras
Mecanismos de controle de qualidade
Qualidade da imagem
Consistência da informação
Instituto de Botânica e Jardim Botânico de São Paulo
Colaboradoras
Elaine Alves da Silva Fátima Souza Buturi
Renata de Almeida Scabbia