Marcador molecular

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UNIVERSIDADE DO ESTADO DE MATO GROSSO

CAMPUS UNIVERSITÁRIO DE CÁCERES “JANE VANINI”

BIOLOGIA MOLECULAR

Marcadores Moleculares

Discente: Taniele Oliveira

Marcadores Moleculares de

Expressão

Surgiram recentemente com o advento dabiologia molecular;

Nível alto de polimorfismo para cada locoestudado;

Neutros em relação a efeitos fenotípicos;

Em geral, são co-dominantes, contendo maiorquantidade de informação genética por loco;

Podem ser usados para caracterizar o genótipode um indivíduo a partir de amostras de célulasou de tecidos e, em qualquer estádio dedesenvolvimento da planta.

Marcadores derivados de

sequencias

expressas: SNP SNP - Single Nucleotide Polymorphism ou

Polimorfismos de Nucleotídeos Únicos

Polimorfismo baseados na alteração de uma

única base no genoma.

Marcadores derivados de

sequencias

expressas: SNP Tipos mais comuns de

SNPs:

Transição: base púrica é

substituída por outra

púrica A-T, G-C.

Transversão: púrica

substituída por pirimídica

ou vice-versa : A-C, G-T,

A-C e C-T.

SNP: variação >1%

Mutação: variação <1%

Marcadores derivados de

sequencias

expressas: SNP Vantagens:

Abundância no genoma

Elevado grau de polimorfismo

Detecção de diferentes alelos para genes de

interesse

Desvantagem:

Sequenciamento de DNA em grande escala.

Marcadores derivados de

sequencias

expressas: SNP Aplicações:

Construção de mapas genéticos

Mapeamento de características de interesse

Análise de populações

Identificação de cultivares

Utilização:

Identificação e validação de marcadores

moleculares INDEL e SNP lipoxigenases de

sementes de soja.

Marcadores derivados de

sequencias

expressas: ESTP ESTP - Expressed sequence tag polymorphism

ou Sequencia expressa de polimorfismo.

Sequência de DNA para genes expressos.

Desenvolvimento de marcadores baseados na

sequência de genes.

Teste em diferentes genótipos.

Utilização:

Caracterização de cultivares de videira através de

ESTP.

(Sítios específicos em videiras)

Marcadores derivados de

sequencias

expressas: ASP ASP – Allele Specific Polymorphism ou Alelo

Polimorfismo Específico

Trabalha-se com a sequência do gene

Identificação de plantas variantes alélicos de um

gene

Eventos de Inserção / Deleção / Substituição de

base na região transcrita de um gene

Marcadores derivados de

sequencias

expressas: ASP Desenvolvimento:

Identificação e sequenciamento dos variantes

alélicos do gene de interesse

Desenho de um par de primers

Anelamento – local de inserção / deleção /

substituição

Aplicação:

Analise filogenética e mapeamento genético.